Infinium 유전형 분석 매니페스트 컬럼 제목

03/29/22


IlmnID : SNP 또는 Indel 프로브에 대한 관련 정보의 요약을 제공합니다. 알려지지 않은 경우 유전체 빌드는 0입니다. Indel의 경우, Top/Bot 대신 Plus/Minus가 보고됩니다. 아래 다이어그램 참조:

ILMN 가닥: ILMN 가닥(설계 가닥)의 Top/Bot(SNP의 경우) 또는 Plus/Minus(Indel의 경우) 지정.

SNP : assay 프로브에 의해 보고된 SNP 대립유전자. Design 가닥(ILMN 가닥)의 대립유전자는 대립유전자 A/B의 순서로 나열됩니다.

주소A_ID : Infinium I 비드 유형의 경우 A 대립유전자에 특정된 프로브의 주소 ID입니다. Infinium II 비드 유형의 경우, A 및 B 대립유전자 모두에 사용되는 프로브의 주소 ID(이 경우 AddressB_ID 및 AlleleB_ProbeSeq 열이 비어 있음).

AlleleA_ProbeSeq : AddressA_ID 열에서 식별된 프로브의 시퀀스입니다.

주소B_ID : Infinium I 비드 유형의 경우, B 대립유전자에 특이적인 프로브의 주소 ID.

AlleleB_ProbeSeq : Infinium I 비드 유형의 경우 AddressB_ID 열에서 식별된 프로브의 시퀀스.

GenomeBuild : 이 적하목록에서 이 프로브에 대한 정보를 위해 참조된 NCBI 유전체 빌드.

시간: SNP를 포함하는 염색체.

MapInfo : SNP의 염색체 좌표.

Ploidy : 표적 유기체의 증식. 인간의 경우, 상염색체는 이배수체, 미토콘드리아 및 Y 염색체는 단배수체입니다.

종: 이 BeadArray의 프로브가 표적으로 하는 종.

출처: 이용 가능한 경우 SNP의 데이터베이스 출처(예: dbSNP).

SourceVersion : 가능한 경우 SNP가 매니페스트를 생성하기 위해 참조한 데이터베이스(소스) 버전.

소스 스트랜드: 소스 가닥에 대한 Top/Bot(SNP의 경우) 또는 Plus/Minus(Indel의 경우) 지정.

소스 시퀀스: 소스 가닥의 시퀀스.

TopGenomicSeq(*.bpm이 아닌 *.csv 버전의 매니페스트): Top 가닥(SNP의 경우) 또는 Plus 가닥(Indel의 경우)의 서열.

BeadSetID : BeadChip의 제조에 사용되는 식별자.

Exp_클러스터: 각 SNP에 의해 생성될 것으로 예상되는 클러스터의 수: 비다형성 프로브의 경우 1개, 미토콘드리아 DNA의 경우 2개, 이배체 유기체의 경우 Y 염색체 유전자좌의 경우 3개.

참조 스트랜드: ILMN 가닥에 대한 플러스/마이너스(+/-) 지정.

 

가닥 지정에 대한 자세한 내용은 다음 기술 게시판을 참조하십시오.