고객 범위: 소스 가닥과 동일합니다. 맞춤형 콘텐츠의 경우 프로브 설계를 위해 고객이 제출한 가닥입니다.

ILMN Strand, 일명 설계 가닥: Illumina가 NCBI BLAST에 따라 열역학적 안정성 및 유전자좌 특이성을 기반으로 프로브를 설계하는 데 사용하는 가닥. 이러한 이유로 고객/소스 가닥과 다를 수 있습니다.

정방향/역방향(정방향/역방향) 스트랜드: dbSNP 에서 사용하는 Fwd/Rev 지정은 NCBI Genome Build 업데이트로 변경될 수 있으므로 Fwd/Rev 가닥을 보고할 때 Genome Build를 지정해야 합니다. 1. 표준 어레이 제품의 SNP의 경우, Fwd strand = Source strand이며 dbSNP에서 유래합니다. 2. rsid가 없는 맞춤형 어레이 제품 SNP의 경우, 고객은 자체 기준에 따라 소스 가닥을 Fwd 또는 Rev로 식별할 수 있습니다. Illumina 맞춤형 제품 파일은 고객의 Fwd/Rev 지정을 사용합니다. 참고: Illumina 표준 제품 파일에서 식별된 Fwd 가닥은 HapMap이 상호 교환적으로 “전방 가닥”이라고 하는 Plus (+) 가닥과 혼동해서는 안 됩니다.

플러스/마이너스(+/-) 가닥: HapMap 및 1000 Genomes Project에서 사용되는 모든 진핵생물에 대한 표준 명칭. (+) 가닥의 5’ 말단은 염색체의 짧은 팔(p arm)의 말단에 있고, (-) 가닥의 5’ 말단은 긴 팔(q arm)의 말단에 있습니다.(+/-) 지정은 NCBI 유전체 빌드 업데이트에 따라 변경될 수 있으므로, (+/-) 가닥을 보고할 때 유전체 빌드를 지정해야 합니다.

소스 스트랜드: 고객 가닥과 동일. 프로브 설계를 위해 Illumina 설계자에게 제출된 가닥. 1. 표준 SNP의 경우, 이는 소스 데이터베이스(즉, dbSNP)에 보고된 Fwd 가닥입니다. 2. 맞춤형 콘텐츠는 고객이 제출한 형식에 따라 rsid 또는 DNA 시퀀스 또는 염색체 영역으로 보고할 수 있습니다.

Top/Bottom(Top/Bot) Strand:Top/Bot 명명법은 사용된 데이터베이스 또는 유전체 어셈블리에 관계없이 변경되지 않는 가닥 지정을 할당하기 위해 서열 기반 컨텍스트를 사용하여 Illumina에 의해 개발되었습니다(예: 참조된 NCBI Genome Build에 따라 가닥 및 대립유전자 지정이 변경될 수 있음). Top/Bot은 Fwd/Rev 또는 (+/-)와 직접 관련이 없습니다.Top/Bot 가닥은 SNP 및 주변 DNA 서열을 검사하여 결정되며, 2개의 가능한 대립유전자가 있는 SNP에만 적용됩니다. 자세한 내용은 Top/Bot A/B 대립유전자 게시판을 참조하세요.