HiSeq 1000/2000 및 1500/2500 시퀀싱 플랫폼에 대한 Illumina 라이브러리 및 권장 라이브러리 키트 유형의 시퀀싱 프라이머 호환성

08/24/21


Illumina는 다양한 애플리케이션을 위한 다양한 라이브러리 준비 키트 및 시퀀싱 플랫폼을 제공하며, 각 키트에는 자체 커버리지 및 인덱싱 고려 사항이 있습니다. 표 1 및 표 2에는 HiSeq 1000/2000 및 1500/2500 클러스터 키트에 포함된 시퀀싱 프라이머가 나열되어 있으며 HiSeq 1000/2000 및 1500/2500 플랫폼과 호환되는 Illumina 라이브러리 준비 키트가 포함되어 있습니다.

참고: 아래 표의 정보는 각 키트의 필수 데이터 출력 및 인덱싱 기능을 기반으로 합니다. 대부분의 Illumina 라이브러리는 모든 Illumina 시퀀싱 플랫폼에서 시퀀싱할 수 있습니다. 특정 Illumina 라이브러리가 아래에 나열되지 않은 경우, Illumina 기술 지원팀에 연락하여 특별한 고려 사항에 대해 논의하십시오.

자세한 내용은 Sequence Coverage CalculatorLibrary Prep and Array Kit Selector 리소스를 참조하십시오.

표 1. 권장 라이브러리 유형 및 플로우 셀 유형에 따라 HiSeq v4 고출력 화학 물질에서 시퀀싱 프라이머 호환성.

HiSeq v4 High Output

플로우 셀 유형

Read 1
프라이머

인덱스 1
(i7)
프라이머

인덱스 2
(i5)
프라이머

읽기 2
프라이머

라이브러리 유형

싱글 리드
(GD-401-4001)

HP10
(cBot 플레이트 - 2열)

HP12
(PE 랙 - 17)

HP9
(PE 랙 - 16)

해당 없음

AmpliSeq for Illumina Library Prep PLUS

Illumina DNA Prep (M) Tagmentation(이전 명칭 : Nextera DNA Flex Library  Prep Kit)

Illumina DNA Prep with Enrichment(S) Tagmentation(구 Nextera Flex for Enrichment)

TruSeq ChIP

TruSeq DNA Exome

TruSeq DNA Nano

TruSeq™ DNA PCR-Free

TruSeq Methyl Capture EPIC

TruSeq RNA Exome

TruSeq RNA v2

TruSeq Stranded mRNA

TruSeq Stranded Total RNA

TruSight Inherited Disease Sequencing Panel

TruSight One Sequencing Panel

TruSight Rapid Capture Panel

TruSight Tumor 170

페어드 엔드
(PE-401-4001)

HP10(cBot 플레이트 - 2열)

HP12(PE 랙 - 17)

에 그라프트된 P5
플로우 셀

HP11(PE 랙 - 16)

 

표 2. 권장되는 라이브러리 유형 및 플로우 셀 유형에 따라 HiSeq v3 고출력 화학 물질에서 시퀀싱 프라이머 호환성.

HiSeq v3 고출력

플로우 셀 유형

Read 1
프라이머

인덱스 1
(i7)
프라이머

인덱스 2
(i5)
프라이머

읽기 2
프라이머

라이브러리 유형

싱글 리드*
(GD-401-3001)

HP6
(cBot 플레이트-
11열)

HP8
(PE 랙 - 17)

HP9
(PE 랙 - 16)

해당 없음

AmpliSeq for Illumina Library PLUS**

Illumina DNA Prep (M) Tagmentation(이전 명칭 : Nextera DNA Flex Library  Prep Kit)**

Illumina DNA Prep with Enrichment(S) Tagmentation(이전 명칭: Nextera Flex for Enrichment)**

TruSeq ChIP

TruSeq DNA Exome

TruSeq DNA Nano

TruSeq™ DNA PCR-Free

TruSeq Methyl Capture EPIC

TruSeq RNA Exome

TruSeq RNA v2

TruSeq Stranded mRNA

TruSeq Stranded Total RNA

TruSight 유전 질환 시퀀싱 패널**

TruSight One 시퀀싱 패널**

TruSight Rapid Capture Panel**

TruSight Oncology UMI**

TruSight Tumor 170**

페어드 엔드
(PE-401-3001)

HP6
(cBot 플레이트-
11열)

HP8
(PE 랙 - 17)

에 그라프트된 P5
플로우 셀

HP7
(PE 랙 - 16)

 

* 단일 리드 플로우 셀에서 시퀀싱된 듀얼 인덱스 라이브러리에는 HP9를 공급하는 TruSeq 듀얼 인덱스 시퀀싱 프라이머 – 싱글 리드(FC-121-1003)가 필요합니다.

** 이러한 라이브러리 키트에는 TruSeq Dual Index Sequencing Primer Box의 프라이머가 필요합니다.

TruSeq Dual Index Sequencing Primers – Single-Read(FC-121-1003): HP10(Read 1), HP12(index i7) 및 HP9(index i5) 포함

TruSeq 듀얼 인덱스 시퀀싱 프라이머 – 페어드 엔드(PE-121-1003): HP10(읽기 1), HP11(읽기 2) 및 HP12(인덱스 i7) 포함

표 3. 권장되는 라이브러리 유형 및 플로우 셀 유형에 따라 HiSeq 빠른 v2 화학 물질에서 시퀀싱 프라이머 호환성.

HiSeq Rapid Run v2

플로우 셀 유형

읽기 1
프라이머

인덱스 1
(i7)
프라이머

인덱스 2
(i5)
프라이머

프라이머 2개 읽기

라이브러리 유형

싱글 리드*
(GD-402-4002)

HP10
(PE 랙 - 18)

HP12
(PE 랙 - 17)

HP9
(PE 랙 - 16)

해당 없음

AmpliSeq for Illumina Library PLUS

Illumina DNA Prep (M) Tagmentation(이전 명칭 : Nextera DNA Flex Library  Prep Kit)

Illumina DNA Prep with Enrichment(S) Tagmentation(구 Nextera Flex for Enrichment)

TruSeq ChIP

TruSeq DNA Exome

TruSeq DNA Nano

TruSeq™ DNA PCR-Free

TruSeq Methyl Capture EPIC

TruSeq RNA Exome

TruSeq RNA v2

TruSeq Stranded mRNA

TruSeq Stranded Total RNA

TruSight Inherited Disease Sequencing Panel

TruSight One Sequencing Panel

TruSight Rapid Capture Panel

TruSight Oncology UMI

TruSight Tumor 170

페어드 엔드
(PE-402-4002)

HP10
(PE 랙 - 18)

HP12
(PE 랙 - 17)

에 그라프트된 P5
플로우 셀

HP11
(PE 랙 - 16)

 

HiSeq 1000/2000 및 1500/2500 시퀀싱 플랫폼에서 맞춤형 프라이머를 사용하는 방법에 대한 지침은 다음 리소스를 참조하십시오.

맞춤형 프라이머를 Illumina 시퀀싱 프라이머에 스파이킹

HiSeq 시스템 맞춤형 프라이머 가이드