01/25/2022
성공적인 런을 위해서는 충분한 양의 SBS 시약이 시퀀싱 기기에 장착되도록 하는 것이 중요합니다. 런 중에 시약이 부족하면 강도와 품질에 영향을 미치며 런 실패를 초래할 수 있습니다. 기기에 따라 듀얼 인덱스 시퀀싱은 Indexed Sequencing Overview Guide 에 표시된 대로 다양한 워크플로우를 따릅니다. 특정 기기에서 듀얼 인덱스 런은 두 번째 인덱스 리드가 시작될 때 화학 전용 사이클에 추가로 7사이클의 시약이 필요합니다. 플로우 셀 표면의 접목된 P5 프라이머로 순방향 템플릿 어닐링 후 두 번째 인덱스 리드 시퀀싱이 발생하는 워크플로우에는 7개의 화학 전용 사이클이 필요합니다. 키트에서 지원하는 사이클 수를 계산할 때 이러한 7개 사이클을 고려해야 합니다.
다음 표는 사용 가능한 시약 키트 크기와 각 키트가 수행할 수 있는 최대 사이클 수를 약술하며, 추가 7사이클을 고려합니다.
시약 유형 | 시약 키트 크기 | 최대 사이클 수 | 듀얼 인덱스에 추가 사이클이 필요하신가요? | |
---|---|---|---|---|
iSeq 100 | i1(v1 또는 v2) | 300 | 322 | 아니요 |
MiniSeq | 래피드 키트 | 100 | 128 | 예 - 7사이클 |
고출력 또는 중간 출력 |
75 | 92 | 아니요 | |
150 | 168 | |||
300 | 318 | |||
MiSeq | v2 (마이크로 및 나노 키트 포함) |
50 | 79 | 예 - 7사이클 |
300 | 329 | |||
500 | 529 | |||
v3 | 150 | 179 | ||
600 | 629 | |||
NextSeq 500/550 | 고출력 또는 중간 출력 | 75 | 92 | 아니요 |
150 | 168 | |||
300 | 318 | |||
HiSeq 1000/1500/2000/2500 | 빠른 SBS v2 | 50 | 79 | 페어드 엔드 플로우 셀에는 7사이클 필요 |
200 | 229 | |||
500 | 529 | |||
TruSeq SBS v3 | 50 | 58 | ||
200 | 209 | |||
HiSeq SBS v4 | 50 | 79 | ||
250 | 279 | |||
NextSeq 1000/2000 | ||||
P1 | 100 | 138 | 아니요 | |
600 | 638 | |||
P2 | 100 | 138 | 아니요 | |
200 | 238 | |||
300 | 338* | |||
600 | 638 | |||
P3 | 50 | 88 | 아니요 | |
100 | 138 | |||
200 | 238 | |||
300 | 327* | |||
HiSeq 3000/4000 | 해당 없음 | 50 | 79 | 싱글 리드 플로우 셀에는 7사이클 필요 |
150 | 179 | |||
300 | 329 | |||
NovaSeq 6000 | SP v1.0 | 100 | 130 | 예 - 7사이클 |
200 | 230 | |||
300 | 330 | |||
500 | 530 | |||
S1 및 S2 v1.0 | 100 | 130 | ||
200 | 230 | |||
300 | 330 | |||
S4 v1.0 | 200 | 230 | ||
300 | 330 | |||
SP v1.5 | 100 | 138 | 아니요 | |
200 | 238 | |||
300 | 338 | |||
500 | 538 | |||
S1 및 S2 v1.5 | 100 | 138 | ||
200 | 238 | |||
300 | 338 | |||
S4 v1.5 | 35 | 72 | ||
200 | 238 | |||
300 | 338 |
*NextSeq 1000/2000 P1 및 P2 키트에는 총 338개의 사이클이 있는 반면 P3 v3 키트에는 총 327개의 사이클이 있습니다.
가능한 경우 SBS 시약을 준비, 결합 및 분할하는 방법을 포함하여 각 SBS 시약 키트에 대한 자세한 내용은 각 키트의 지원 페이지를 참조하세요. 또한 높은 데이터 품질을 유지하기 위해 Illumina 시퀀싱 플랫폼의 최대 리드 길이 회보를 참조하세요.