내 키트에는 몇 사이클의 SBS 화학 물질이 들어 있나요?

01/25/2022


성공적인 런을 위해서는 충분한 양의 SBS 시약이 시퀀싱 기기에 장착되도록 하는 것이 중요합니다. 런 중에 시약이 부족하면 강도와 품질에 영향을 미치며 런 실패를 초래할 수 있습니다. 기기에 따라 듀얼 인덱스 시퀀싱은 Indexed Sequencing Overview Guide 에 표시된 대로 다양한 워크플로우를 따릅니다. 특정 기기에서 듀얼 인덱스 런은 두 번째 인덱스 리드가 시작될 때 화학 전용 사이클에 추가로 7사이클의 시약이 필요합니다. 플로우 셀 표면의 접목된 P5 프라이머로 순방향 템플릿 어닐링 후 두 번째 인덱스 리드 시퀀싱이 발생하는 워크플로우에는 7개의 화학 전용 사이클이 필요합니다. 키트에서 지원하는 사이클 수를 계산할 때 이러한 7개 사이클을 고려해야 합니다.

다음 표는 사용 가능한 시약 키트 크기와 각 키트가 수행할 수 있는 최대 사이클 수를 약술하며, 추가 7사이클을 고려합니다.

시약 유형 시약 키트 크기 최대 사이클 수 듀얼 인덱스에 추가 사이클이 필요하신가요?
iSeq 100 i1(v1 또는 v2) 300 322 아니요
MiniSeq 래피드 키트 100 128 예 - 7사이클
고출력 또는
중간 출력
75 92 아니요
150 168
300 318
MiSeq v2
(마이크로 및 나노 키트 포함)
50 79 예 - 7사이클
300 329
500 529
v3 150 179
600 629
NextSeq 500/550 고출력 또는 중간 출력 75 92 아니요
150 168
300 318
HiSeq 1000/1500/2000/2500 빠른 SBS v2 50 79 페어드 엔드 플로우 셀에는 7사이클 필요
200 229
500 529
TruSeq SBS v3 50 58
200 209
HiSeq SBS v4 50 79
250 279
NextSeq 1000/2000
P1 100 138 아니요
600 638
P2 100 138 아니요
200 238
300 338*
600 638
P3 50 88 아니요
100 138
200 238
300 327*
HiSeq 3000/4000 해당 없음 50 79 싱글 리드 플로우 셀에는 7사이클 필요
150 179
300 329
NovaSeq 6000 SP v1.0 100 130 예 - 7사이클
200 230
300 330
500 530
S1 및 S2 v1.0 100 130
200 230
300 330
S4 v1.0 200 230
300 330
SP v1.5 100 138 아니요
200 238
300 338
500 538
S1 및 S2 v1.5 100 138
200 238
300 338
S4 v1.5 35 72
200 238
300 338

 

*NextSeq 1000/2000 P1 및 P2 키트에는 총 338개의 사이클이 있는 반면 P3 v3 키트에는 총 327개의 사이클이 있습니다.

가능한 경우 SBS 시약을 준비, 결합 및 분할하는 방법을 포함하여 각 SBS 시약 키트에 대한 자세한 내용은 각 키트의 지원 페이지를 참조하세요. 또한 높은 데이터 품질을 유지하기 위해 Illumina 시퀀싱 플랫폼의 최대 리드 길이 회보를 참조하세요.