08/23/2022
PhiX 검증 런은 기기의 적절한 하드웨어 및 소프트웨어 성능을 확인합니다. Illumina PhiX Control Library는 A, T, G 및 C 뉴클레오티드를 비교적 동일하게 나타내는 균형 잡힌 유전체입니다. PhiX에는 인덱스가 없으며 인덱스 리드 성능을 평가하기에 적절한 도구가 아닙니다.
PhiX 컨트롤 런은 다음 표에 나열된 대로 각 플랫폼에 대한 최적의 클러스터 밀도 내에 속하는 것이 중요합니다.
| 플랫폼 | 최적의 로딩 농도 | 최적의 원시 클러스터 밀도 |
|---|---|---|
| iSeq 100 | 100 pM | 해당 없음** |
| MiniSeq | 1.4 pM | 170-220K 클러스터/mm2 |
| MiSeq v2 시약 | 12.5 pM | 1000-1200K 클러스터/mm2 |
| MiSeq v3 시약 | 20 pM | 1200-1400K 클러스터/mm2 |
| NextSeq 500/550 고출력 시약 | 1.5 pM | 170-220K 클러스터/mm2 |
| NextSeq 500/550 Mid Output 시약 | 1.5 pM | 170-220K 클러스터/mm2 |
| NextSeq 1000/2000 | 650 pM | 해당 없음** |
| HiSeq 2000/2500 고출력 v3 | 12 pM | 750-850K 클러스터/mm2 |
| HiSeq 2000/2500 고출력 v4 | 18 pM | 950-1050K 클러스터/mm2 |
| HiSeq 2500 Rapid Run v2 | 12 pM | 850-1000K 클러스터/mm2 |
| HiSeq 3000/4000 | 2-3nM * | 해당 없음** |
| NovaSeq - 표준 워크플로우 | 250 pM*** | 해당 없음** |
| NovaSeq - XP 워크플로우 | 100 pM*** | 해당 없음** |
*변성되지 않은 pre-ExAmp 농도
**패턴된 플로우 셀은 웰이 주문된 나노웰로 구성되며, 런마다 보고된 클러스터 밀도의 변동이 없습니다.
***최종 로딩 농도
런 길이와 파라미터는 문제 해결 요구 사항에 따라 다르지만, 품질 점수를 생성하려면 리드 1 및 2에 최소 26사이클이 있어야 합니다.
시퀀싱 플랫폼을 위한 PhiX 준비에 대한 자세한 내용은 다음 문서를 참조하십시오.