MiSeq Reporter로 런 분석을 다시 기다리는 방법

03/23/22


MiSeq Reporter는 MiSeq 기기에서 생성된 데이터에 대한 2차 분석을 수행합니다. 런 데이터는 MiSeq Reporter 로 분석을 다시 대기열에 넣어 로컬에서 여러 번 재분석할 수 있습니다. 분석을 다시 기다리는 일반적인 이유에는 분석 워크플로우 변경 또는 샘플 시트에서 인덱스 시퀀스, 샘플 ID 또는 샘플 이름 수정이 포함됩니다. 웹 인터페이스를 사용하거나 런 폴더에서 MiSeq Reporter로 샘플 시트를 올바르게 편집하고 분석을 다시 대기하는 방법은 다음과 같습니다. MiSeq Reporter로 분석을 다시 대기열에 넣을 때 시퀀싱 런이 진행 중이 아닌지 항상 확인하십시오.

샘플 시트 편집 방법

  1. D 드라이브의 MiSeq Analysis 런 폴더로 이동합니다. 예:
    1. D:\Illumina \MiSeq Analysis\141007_M001_0016_000000000-AB8A8
  2. SampleSheet.csv 파일을 편집하려면 노트패드와 같은 텍스트 편집기를 엽니다. 스프레드시트 편집기를 사용하는 경우 샘플 시트를 쉼표로 분리된 값(.csv) 파일로 저장해야 합니다. 샘플 시트의 형식을 유지해야 합니다.
  3. 새 샘플 시트를 생성하는 경우 SampleSheet.csv 파일의 이름을 SampleSheet_original.csv로 변경하여 원본 샘플 시트의 사본을 보관합니다. 새 샘플 시트를 MiSeq Analysis 런 폴더에 넣고 이름을 SampleSheet.csv로 지정합니다.

MiSeq Reporter 웹 인터페이스를 사용하여 런 분석을 다시 대기

  1. MiSeq Reporter 웹 인터페이스를 시작하려면 Internet Explorer 웹 브라우저를 열고 주소 표시줄에 http://localhost:8042를 입력합니다.
  2. MiSeq Reporter 웹 인터페이스에서 왼쪽 상단의 Analysis 탭을 선택합니다.
  3. 분석 탭의 사용 가능한 런 목록에서 런을 찾아 런 이름 옆의 확인란을 클릭한 후 Requeue 를 선택합니다.

분석 중에 경과 시간이 있는 상태 표시줄이 분석 정보 탭에 나타납니다. 완료 전에 분석을 중지해야 하는 경우, 분석 정보 탭의 상태 표시줄 옆에 있는 분석 중지 아이콘을 선택합니다.

MiSeq Reporter 웹 인터페이스를 사용하지 않고 다시 대기

  1. 런이 BaseSpace Sequence Hub 전송되었지만 로컬에서 분석되지 않은 경우, 런은 MiSeq Reporter 웹 인터페이스의 분석 섹션에 나열되지 않습니다. 이러한 상황에서는 런 폴더에서 분석을 다시 대기열에 추가해야 합니다. 분석이 다시 대기되면 MiSeq Reporter 웹 인터페이스에 런이 표시됩니다. 다음 단계에서는 런 폴더에서 분석을 다시 대기하는 방법을 설명합니다.
  2. D 드라이브의 MiSeq Analysis 런 폴더로 이동합니다. 예:
    1. D:\Illumina \MiSeq Analysis\141007_M001_0016_000000000-AB8A8
  3. 런 폴더에서 queuedforanalysis.txt(또는 QueuedForAnalysis.txt)라는 파일을 삭제합니다. 런 폴더에서 이 파일을 삭제하면 MiSeq Reporter가 분석을 시작합니다. 이 파일은 현재 날짜 및 타임 스탬프와 함께 다시 나타나( QueuedForAnalysis.txt로 표시) MiSeq Reporter가 런 분석을 시작했음을 나타냅니다.

분석 상태를 보려면 Internet Explorer 웹 브라우저를 열고 주소 표시줄에 http://localhost:8042를 입력하여 MiSeq Reporter 웹 인터페이스를 시작합니다. 왼쪽 상단의 Analysis 탭을 선택합니다. 방금 다시 대기한 런은 목록의 맨 아래에 표시됩니다. 분석을 위한 상태 표시줄을 보려면 런을 선택합니다.