NovaSeq 6000 시퀀싱 플랫폼에서 PhiX 검증 런을 설정하는 방법

10/13/21


PhiX 검증 런은 기기의 적절한 하드웨어 및 소프트웨어 성능을 확인합니다. Illumina PhiX Control Library는 A, T, G 및 C 뉴클레오티드를 비교적 동일하게 나타내는 균형 잡힌 유전체입니다. PhiX에는 인덱스가 없으며 인덱스 리드 성능을 평가하기에 적절한 도구가 아닙니다. 다음은 NovaSeq 시퀀싱 플랫폼에서 PhiX 검증 런을 설정하는 지침입니다.

NovaSeq 시스템 PhiX 검증 런을 위한 최적의 로딩 농도는 250 pM입니다. 변성 및 희석 절차는 NovaSeq Denature and Dilute Guide를 참조하십시오. 런 설정 직전에 변성된 PhiX를 라이브러리 튜브에 로드합니다. 캡을 벗긴 라이브러리 튜브는 클러스터 카트리지의 위치 8에 로드됩니다.

  • 참고: 
    1. 모든 NovaSeq 플로우셀(SP, S1, S2 또는 S4)은 PhiX 검증 런에 사용할 수 있습니다. 4개의 레인을 모두 테스트하기 위해 NovaSeq S4 300 사이클 키트가 권장됩니다.
    2. S4 런의 경우 플로우셀당 4개의 PhiX 튜브가 필요합니다. SP, S1 및 S2 플로우셀의 경우 PhiX 튜브 2개가 필요합니다. 듀얼 S4 검증 의 경우 양쪽을 동시에 실행하는 경우 PhiX 바이알 6개가 필요합니다.
  1. NovaSeq Control Software(NVCS) 열기
  2. 홈 화면에서 시퀀스를 선택하고 한쪽 또는 양쪽을 선택합니다.
  3. 화면의 지시에 따라 플로우 셀을 로드합니다.
    1. 참고: 플로우 셀 도어 위에 아무것도 놓지 마십시오.
  4. 화면의 프롬프트에 따라 클러스터, SBS 및 버퍼 카트리지를 로드하고 크고 작은 폐기물 병을 비웁니다.
  5. (선택 사항) BaseSpace Sequence Hub런을 업로드하는 경우, Run Monitoring Only를 선택합니다. Run Monitoring and Storage를 선택하면 샘플 시트가 필요합니다.
  6. Run Setup 화면에서:
    1. 일반적으로 2 x 151의 런 파라미터를 입력합니다.
    2. 인덱스 1 및 인덱스 2의 사이클 수를 0으로 설정합니다.
  7. 원하는 네트워크 출력 위치를 지정합니다.
  8. 런 파라미터를 검토한 후 런 전 점검을 진행합니다.
  9. 점검이 성공적으로 완료되면 시퀀싱 런이 시작됩니다.
  10.