Illumina Enrichment 키트(DNA 및 RNA 기반)는 시퀀싱을 위한 유전체 또는 전사체에서 특정 관심 영역을 분리하고 강화하는 데 도움이 됩니다. 예를 들어, TruSight Cancer Panel을 사용하는 Illumina DNA Prep with Enrichment(이전 명칭: Nextera Flex for Enrichment)는 다양한 암과 관련된 94개의 유전자와 284개의 SNP를 표적으로 합니다.

이 게시판은 인리치먼트 반응의 원리와 Illumina Enrichment 키트를 설명할 때 일반적으로 사용되는 용어를 설명합니다.

인리치먼트 키트의 경우, ‘반응’(약칭 ‘rxn’)은 키트와 함께 제공되는 인리치먼트 반응의 수를 나타냅니다. ‘플렉시티’(약칭 “플렉스”)는 인리치먼트 반응에서 함께 풀링되는 사전 인리치된 라이브러리의 수를 나타냅니다. 예를 들어, 8-rxn x 12-plex 키트에는 8개의 인리치먼트를 수행하기에 충분한 시약이 있습니다. 각 인리치먼트 반응에서 12개의 라이브러리를 풀링할 수 있습니다. 따라서 이 키트로 준비할 수 있는 총 샘플 수는 96개입니다. 다음 그림은 3개의 라이브러리가 하나의 인리치먼트 반응에서 풀링되는 방법을 보여줍니다.

이 예시에서, 3개의 사전 인리치된 라이브러리를 준비한 다음 표적 특이적 인리치먼트 프로브(3플렉스 풀링)와의 혼성화를 위해 동일한 양(질량 기준)으로 함께 풀링합니다. 그런 다음 이러한 프로브 결합 단편을 스트렙타비딘 비드로 포획합니다. 모든 비결합 절편을 씻어내고, 관심 서열에 대해 강화된 결합 절편을 스트렙타비딘 비드에서 용리하여 시퀀싱합니다.

DNA 인리치먼트 키트 – DNA의 효소 절편화

Illumina DNA Prep with Enrichment(이전 명칭: Nextera Flex for Enrichment)는 DNA와 트랜스포솜 효소의 효소적 단편화를 기반으로 합니다.  다음 프로브 패널은 Illumina DNA Prep with Enrichment 함께 사용됩니다.

• Illumina Exome Panel(전체 코딩 전사체용)
• TruSight Cancer
• TruSight One
• TruSight One Expanded
• TruSight Cardio
• TruSeq Neurodegeneration – 유전체의 표적 영역을 더 많이 선택하는 데 사용됩니다.
• 소프트웨어 DesignStudio를 사용하여 맞춤형 관심 패널을 생성하는 Illumina Custom Enrichment Panel.

DNA 인리치먼트 키트 – DNA의 기계적 단편화

• TruSeq DNA 엑솜은 DNA의 기계적 단편화(Covaris 필요) 후 코딩 엑솜을 캡처합니다.

RNA 인리치먼트 기반 키트

• Illumina RNA Prep with Enrichment는 온비드 태그멘테이션을 사용하고 코딩 RNA를 캡처합니다.
• TruSight RNA Pan-Cancer Panel TruSight RNA Fusion