샘플 시트를 편집하고 iSeq, MiniSeq(Control Software 2 및 Windows 10으로 업데이트됨), MiSeq, HiSeq, NextSeq 500/550(Control Software 4 및 Windows 10으로 업데이트됨) 및 BaseSpace Sequence Hub에 업로드된 NovaSeq 런에 대해 FASTQ 생성 분석을 다시 대기열에 추가할 수 있습니다. 샘플 시트는 시퀀싱 런에서 역다중화 FASTQ를 설정, 수행 및 생성하는 데 필요한 정보를 저장하는 쉼표로 구분된 값(*.csv) 파일입니다. Illumina는 Windows 기반 Illumina Experiment Manager 소프트웨어를 사용하여 샘플 시트를 생성할 것을 권장합니다. 샘플 시트는 프로세스를 안내하고 오류를 확인하기 때문입니다.

FASTQ 생성 분석을 다시 실시해야 하는 이유는 다양합니다. 예를 들어, 인덱스가 샘플 시트에 잘못 입력된 경우(예: 역보체), 인덱스를 수정하고 데이터를 다시 역다중화해야 합니다. 디멀티플렉싱 문제를 해결하기 위한 기술은 사용자가 디멀티플렉싱 문제를 진단하는 데 도움이 될 수 있습니다. 재대기 기능은 어댑터 트리밍을 켜거나 끄거나 샘플 시트를 재포맷하여 잘못된 문자를 제거하는 데도 사용할 수 있습니다. 잘못된 문자의 예로는 샘플 시트의 샘플 ID 필드에 공백 또는 영숫자, 대시 또는 밑줄 이외의 문자가 있습니다.

중요 참고 사항:

• BaseSpace Sequence Hub Preptab을 사용하여 설정된 MiniSeq 및 NextSeq 500/550 런은 런 설정을 편집하고 분석을 다시 대기열에 넣는 다양한 단계가 필요합니다.
• 런의 소유자만 분석을 다시 대기열에 넣을 수 있습니다. 필요한 경우 런의 소유권을 이전할 수 있습니다. 공유 런은 분석을 다시 대기열에 추가하는 데 필요한 권한을 제공하지 않습니다.
• BaseSpace Sequence Hub 사용자는 5회의 재대기 시도로 제한됩니다. 추가 대기열에 대한 지원이 필요한 경우, Illumina 기술 지원에 이메일을 보내 런 ID와 샘플 시트를 공유할 준비를 하세요. 런 ID를 찾으려면 BaseSpace에서 런을 열고 웹 브라우저 주소 표시줄에서 다음 후 숫자 값을 확인하세요. https://basespace.illumina/com/run/
• 샘플 시트를 편집한 후, 처음에 업로드된 파일만 런의 샘플 시트 탭에 표시되지만, 변경된 내용은 분석에 사용됩니다.

BaseSpace Sequence Hub를 사용하여 샘플 시트를 편집하고 다시 대기열에 추가합니다.

1. BaseSpace 계정에 로그인한 후 페이지 상단의 RUNS 탭을 선택합니다.
2. 다시 대기열에 추가하려는 런의 파란색 하이퍼링크를 선택합니다.
3. 모래시계 기호 드롭다운 메뉴를 선택한 다음 Requeue를 선택한 다음 Sample Sheet를 선택합니다. 참고: 이 옵션은 런의 소유자가 아닌 경우 회색으로 표시됩니다.
   
4. 원본 로드를 선택하여 편집할 원본 샘플 시트를 로드합니다. 샘플 시트에서 발견된 모든 오류는 편집 창 위에 표시됩니다. 노트패드와 같은 일반 텍스트 편집기에서 직접 편집을 입력하거나 복사/붙여넣기를 하여 쉼표로 구분된 값을 유지할 수 있습니다. Excel과 같은 스프레드시트 프로그램에서 편집을 복사할 수 없습니다. 편집이 완료되면 파란색 대기열 분석 버튼을 선택합니다. 대기열 분석 버튼이 활성화되지 않은 경우, 유효성 검사 오류를 확인하고 해결합니다.
5. 런 요약 페이지의 상태는 분석이 진행 중일 때 “분석 중”으로 표시되며 다시 대기열에 추가한 분석이 완료되면 “완료”로 변경됩니다.