시퀀싱 런 성능에 대한 암모늄 기반 세척 제품의 영향

11/10/21


Illumina는 최근 시퀀싱 런 설정(실험실 벤치, 피펫 등) 근처에서 암모니아 기반 클리너를 사용하거나 제품을 소독하면 시퀀싱 런 성능 메트릭스가 감소할 수 있음을 발견했습니다. 클러스터 밀도의 감소 또는 가변과 낮은 시작 강도가 고객이 발견했습니다.

이러한 효과가 발생하는 기전은 암모니아가 DNA 구조에 미치는 영향과 관련이 있을 수 있다(Zinchenko et al 2004).

가변 클러스터 밀도(비패턴 플로우 셀), 필터를 통과하는 가변 백분율 클러스터(패턴 플로우 셀 및 비패턴 플로우 셀 모두) 또는 시퀀싱 런에서 예상보다 낮은 시작 강도가 발생하는 경우, 검사실 환경에서 암모니아 기반 세제를 사용하지 않도록 하십시오. 벤잘코늄 클로라이드(알킬디메틸벤질암모늄 클로라이드) 및 디알킬디메틸암모늄 클로라이드와 같은 암모니아 또는 4차 암모늄 화합물이 있는지 세척제 또는 항균 와이프의 성분 목록을 검사합니다.

암모니아 기반 세제를 사용한 경우, Illumina는 다음을 권장합니다.

  • 암모니아 기반 세제와 접촉한 장비와 표면을 광범위하게 청소합니다. 세척하려면 1% SDS 또는 희석된 주방 세제와 같은 음이온 세제를 사용한 후 물을 사용하십시오.
  • 클러스터링 및/또는 시퀀싱 런을 설정할 때 암모니아 기반 세제와 접촉하지 않은 피펫을 사용합니다.
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