DRAGEN 소프트웨어는 디멀티플렉싱 문제를 해결하는 데 사용할 수 있는 Demultiplex_Stats.csv 및 Top_Unknown_Barcodes.csv라는 두 개의 디멀티플렉싱 파일을 출력합니다.

Demultiplex_Stats.csv 및 Top_Unknown_Barcodes.csv 파일은 어디에 있습니까?

<runfolder>/분석/1/보고서

Demultiplex_Stats.csv에는 어떤 정보가 있습니까?

Demultiplex_Stats.csv 파일은 다음 정보를 제공합니다.

• 샘플 ID
• 인덱스 조합
• 리드 수
• 완벽한 인덱스 리드 수
• 1개의 불일치 인덱스 리드 수
• Q30(PF) 이상의 염기 수
• 평균 품질 점수(PF)

Top_Unknown_Barcodes.csv에 어떤 정보가 있나요?

인덱스 및 인덱스 2 열은 기기에서 판독한 알 수 없는 바코드의 시퀀스를 제공합니다. # Reads 열은 인덱스와 인덱스2의 조합이 수신한 리드 수를 제공합니다.

디멀티플렉싱 문제를 해결할 때 예상 인덱스 시퀀스(샘플 시트에 있음)와 비교하기 위해 식별된 인덱스 시퀀스를 사용합니다.

디멀티플렉싱 불량의 가능한 원인:

• 샘플 시트에 잘못된 방향으로 입력된 인덱스 시퀀스
• 샘플 시트에 잘못된 인덱스 시퀀스가 입력됨(예: Nextera 대 TruSeq HT 또는 인덱스 A001 대 인덱스 A006)
• 인덱스 리드 시퀀싱 품질 불량(예: 목록 상단 근처의 “통화 없음”을 나타내는 많은 기간이 포함된 인덱스 시퀀스)