Illumina Ribo-Zero Plus rRNA Depletion Kit는 하나의 시약으로 인간, 마우스 및 랫트의 세포질 및 미토콘드리아 rRNA, 글로빈 전사물 및 세균 rRNA를 표적으로 하는 효소 고갈 방법을 사용합니다. 표 1은 고갈을 표적으로 하는 RNA 종을 보여준다.

표 1 환원을 표적으로 하는 RNA 종.

Ribo-Zero Plus는 DNA 프로브와 효소 고갈을 사용하여 총 RNA 샘플에서 풍부한 전사물을 제거하는 반면, 레거시 Ribo-Zero 키트는 비오틴화 RNA 프로브를 사용하여 스트렙타비딘 비드로 풍부한 전사물을 끌어냅니다(그림 1 참조).

그림 1. Ribo-Zero Plus 및 기존 Ribo-Zero 고갈 방법.

Ribo-Zero Plus는 TruSeq Stranded Total RNA 워크플로우 또는 Illumina Stranded Total RNA 라이브러리 준비 키트와 함께 독립형 키트로 사용할 수 있습니다. Illumina Ribo-Zero Plus 시약은 개별적으로 구매하거나 Illumina Stranded Total RNA와 번들로 구매할 수 있습니다. Ribo-Zero Plus는 TruSeq Stranded Total RNA 키트와 번들로 제공되지 않습니다. TruSeq Stranded Total RNA 키트와 함께 Ribo-Zero Plus를 사용하는 경우 Ribo-Zero Plus rRNA 고갈 시약을 별도로 구매해야 합니다. TruSeq Stranded Total RNA 키트와 함께 제공되는 Ribo-Zero 비드는 사용되지 않습니다.

표 2. Ribo-Zero Plus 키트 호환성 및 번들링 옵션.

Ribo-Zero Plus는 Illumina Stranded Total RNA 키트와 함께 사용 시 향상된 연구 유연성을 가능하게 하는 주요 이점을 제공합니다.

• “여러 종을 고갈시키기 위한 튜브 1개(단일 키트)” 기능
• 낮은 총 RNA 투입량에서 향상된 고갈
• 표적 전사물 고갈을 위한 보다 정밀한 메커니즘

rRNA 고갈에 대한 프로토콜은 Illumina Stranded Total RNA 참조 가이드에서 확인할 수 있으며 1~1,000 ng의 총 RNA 투입량과 호환됩니다. Illumina Ribo-Zero Plus의 공개 데이터 세트는 BaseSpace를 통해 액세스할 수 있습니다.

맞춤형 프로브를 Ribo-Zero Plus 워크플로우에 추가하여 다양한 종을 표적으로 삼을 수 있습니다. Ribo-Zero Plus 맞춤형 설계 프로세스에는 내부 BaseSpace 앱을 통해 표적 RNA 종 목록을 입력하는 것이 포함됩니다. BaseSpace 앱은 Ribo-Zero Plus에 추가해 지정된 표적을 제거할 수 있는 추가 프로브 설계를 제공합니다. Ribo-Zero Plus 맞춤형 디자인 프로세스에 대한 자세한 내용은 현지 Illumina 영업 팀에 문의하십시오. 프로브 풀은 제3자에게 주문됩니다.

Illumina Stranded Total RNA와 TruSeq Stranded Total RNA의 차이에 대한 자세한 내용은 Illumina Stranded와 TruSeq Stranded RNA 라이브러리 준비 키트의 차이점 게시판을 참조하십시오.