중요 참고 사항: Local Run Manager 버전 2는 MiniSeq Control Software v2 및 Windows 10으로 업데이트된 MiniSeqs 기기용 기기 내에서 사용할 수 있습니다. 이 게시판은 Local Run Manager 버전 1이 사전 설치된 Windows 7에서 제어 소프트웨어 버전 1을 실행하는 MiniSeq 기기에만 적용됩니다. Local Run Manager 버전 2는 기기 외부에서 설치하고 제어 소프트웨어의 두 버전 중 하나에서 MiniSeq 데이터와 함께 사용할 때도 사용할 수 있습니다.

AmpliSeq for Illumina 제품 출시와 함께 Local Run Manager 버전 2용 DNA Amplicon 및 RNA Amplicon 분석 모듈을 출시했습니다. 기기 외부 분석은 iSeq 100, MiniSeq, MiSeq 및 NextSeq 500/550 기기에 사용할 수 있습니다. 온보드 분석은 iSeq 100, MiSeq Control Software 버전 3 이상의 MiSeq 기기, NextSeq Control Software 버전 4의 NextSeq 500/500 기기, MiniSeq Control Software 버전 2의 MiniSeq 기기에 대해 사용할 수 있습니다. MiniSeq Control Software 버전 1 및 온보드 Local Run Manager 버전 1.3이 포함된 MiniSeq에서 AmpliSeq 라이브러리를 시퀀싱할 때, 로컬 분석을 위해 기기 내에서 생성된 데이터를 Local Run Manager 2 기기 외부로 전송해야 합니다. 디멀티플렉싱된 FASTQ 파일은 DNA Amplicon 및 RNA Amplicon 앱을 사용한 분석을 위해 BaseSpace Sequence Hub에 업로드할 수도 있습니다.

Local Run Manager v1.3이 있는 MiniSeq에서 AmpliSeq for Illumina 패널을 시퀀싱하려면 맞춤형 Library Prep Kit 가져와야 합니다.

1. 이 AmpliSeq.tsv 파일을 다운로드하여 데스크톱에 저장합니다.
2. 기기 내 Local Run Manager에 로그인하고 시스템 메뉴에서 Library Prep Kits를 선택합니다.
   
3. Add Library Prep Kit를 선택합니다.
   
4. AmpliSeq.tsv 파일을 가져옵니다.

이제 AmpliSeq for Illumina가 사용 가능한 런 설정 옵션 목록에 추가됩니다. 런을 설정하려면:

1. Create Run을 선택한 다음 GenerateFASTQ를 선택합니다.
2. 런 이름 입력
3. Library Prep Kit의 드롭다운 메뉴에서 AmpliSeq for Illumina를 선택합니다.
4. 표에서 Sample ID를 입력하고 드롭다운 메뉴에서 적절한 i5 및 i7 인덱스를 선택합니다. 인덱스 어댑터 풀링 가이드의 인덱스 플레이트 레이아웃 정보를 참조하십시오.
   
5. 옵션 어댑터 트리밍: MiniSeq용 Local Run Manager 버전 1.3은 가져온 키트에 대해 어댑터 트리밍을 자동으로 수행하지 않습니다. 어댑터를 트리밍하려면 “+ 맞춤형 설정 추가”를 선택하고 이 키트를 사용하여 각 런에 대한 어댑터 옵션과 시퀀스를 추가합니다. 사용자 지정 설정에서 Adapter를 추가한 다음 그 옆에 있는 필드에 시퀀스를 추가합니다. CTGTCTTATACACATCT
6. Save Run 선택
7. MiniSeq Control Software에서 Local Run Manager 모드를 사용하여 런을 시작하고 목록에서 저장된 런을 선택합니다.

시퀀싱 후 전체 런 폴더를 DNA Amplicon 및/또는 RNA Amplicon AmpliSeq 모듈이 설치된 기기 외부 Local Run Manager 2가 있는 컴퓨터로 옮깁니다. 기기 외부에서 분석을 설정하는 지침은 다음 게시판을 참조하십시오.

기기 외부 Local Run Manager v2를 사용하여 AmpliSeq for Illumina 라이브러리에 대한 분석을 설정하는 방법