Illumina 시퀀싱 플랫폼의 최대 리드 길이

12/10/2022


지원되는 최대 리드 길이

Illumina 플랫폼 및 시퀀싱 키트는 다양한 시퀀싱 애플리케이션을 지원합니다. 최고 수준의 품질을 보장하기 위해 Illumina는 시퀀싱 플랫폼 및 SBS 키트 버전에 따라 최대 특정 길이까지 리드를 지원합니다. 내 키트에 몇 사이클의 SBS 화학이 있습니까? 지원 게시판을 참조하십시오. Local Run Manager(LRM) 또는 기기 제어 소프트웨어에서 런 설정 중에 더 긴 리드 길이를 선택할 수 있습니다. 그러나 리드 길이가 지원되는 길이를 초과할 경우 Illumina는 높은 데이터 품질 유지를 보장할 수 없습니다.   

표 1. 시퀀싱 플랫폼 및 SBS 시약 키트에 지원되는 최대 리드 길이.

시퀀싱 플랫폼 SBS 키트 버전 최대 리드 길이
iSeq 100 v1 2 x 151bp
v2 2 x 151bp
MiniSeq MO* 2 x 151bp
HO* 2 x 151bp
MiSeq v2 2 x 251bp
v3 2 x 301bp
NextSeq 500/550 MO* 2 x 151bp
HO* 2 x 151bp
NextSeq 1000/2000 P1, P2 2 x 301bp
P3 2 x 151bp
HiSeq 1000/1500/2000/2500 HO* v3 2 x 101bp
HO* v4 2 x 126bp
RR** v4 2 x 251bp
HiSeq 3000/4000 해당 없음 2 x 151bp
HiSeq X 해당 없음 2 x 151bp
NovaSeq 6000 SP 2 x 251bp
S1, S2, S4 2 x 151bp

* MO: 중간 출력 / HO: 고출력
** 래피드 런

인덱스 리드의 최대 리드 길이

  • 기기 제어 소프트웨어: 아래 표 2와 같이 특정 기기에 대한 런 설정 중 맞춤형 인덱스 리드 길이를 입력합니다.
  • LRM v2: 최대 인덱스 주기에 최대 100자를 입력합니다(Local Run Manager 2: 맞춤형 Library Prep Kit 지원 게시판 사용 방법 참조).
  • LRM v3: 최대 20자를 입력하거나 20~100 bp가 필요한 경우 수동 모드를 사용합니다.
  • 인덱스 리드의 시퀀싱 품질을 보장하려면 지원되는 리드 길이를 초과하지 마십시오.

표 2. 시퀀싱 플랫폼에 대한 최대 개별 인덱스 길이.

시퀀싱 플랫폼 단일 또는 이중 인덱스(최대 길이)
iSeq 100 소프트웨어에 의해 제한되지 않음
MiniSeq v1.X 20 bp
MiniSeq v2.X 20 bp
MiSeq < v4 소프트웨어에 의해 제한되지 않음
MiSeq ≥ v4 100 bp**
NextSeq 500/550 v2 NCS 20 bp
NextSeq 500/550 v4 NCS 20 bp
NextSeq 1000/2000* 소프트웨어에 의해 제한되지 않음
HiSeq 2500 소프트웨어에 의해 제한되지 않음
HiSeq 3000/4000 소프트웨어에 의해 제한되지 않음
HiSeq X 6 bp 단일 인덱스 / 2 x 8 bp 이중 인덱스
NovaSeq 6000 < v1.6.0 20 bp
NovaSeq 6000 ≥ v1.6.0 소프트웨어에 의해 제한되지 않음

*클라우드 모드에서 런을 설정할 때 인덱스 길이는 10 bp로 제한됩니다.

**인덱스 길이가 20~100 bp인 경우, LRM v3이 20 bp로 제한되므로 수동 모드를 사용하십시오.