새로운 기능:
표 1: NextSeq 1000/2000 P1, P2 및 P3 시약 키트 사양.
| 리드 길이(read length) |
NextSeq 1000/2000 P1 |
NextSeq 1000/2000 P2 |
NextSeq 2000 P3 |
| 플로우 셀당 출력 |
| 1 × 50 bp(P3만 해당) |
해당 없음 |
해당 없음 |
60 Gb |
| 2 × 50 bp |
10 Gb |
40 Gb |
120 Gb |
| 2 × 100 bp |
해당 없음 |
80 Gb |
240 Gb |
| 2 × 150 bp |
30 Gb |
120 Gb |
360 Gb |
| 2 x 300 bp |
60 Gb |
180 Gb |
해당 없음 |
| 통과 필터 읽기(단일) |
100M |
400M(100, 200, 300 사이클)
300M(600사이클)* |
1.2B |
| 품질 점수 |
| 1 x 50 bp |
Q30 이상의 염기 ≥ 90% |
| 2 × 50 bp |
Q30 이상의 염기 ≥ 90% |
| 2 × 100 bp |
Q30을 넘는 염기의 ≥ 85% |
| 2 × 150 bp |
Q30을 넘는 염기의 ≥ 85% |
| 2 x 300 bp |
Q30을 넘는 염기의 ≥ 80% |
| 런 타임 |
| 1 × 50 bp |
해당 없음 |
해당 없음 |
최대 11시간 |
| 2 × 50 bp |
최대 10시간 |
최대 13시간 |
최대 19시간 |
| 2 × 100 bp |
해당 없음 |
최대 21시간 |
최대 33시간 |
| 2 × 150 bp |
최대 19시간 |
최대 29시간 |
최대 48시간 |
| 2 x 300 bp |
최대 34시간 |
최대 44시간 |
해당 없음 |
*P2 600 사이클 시약 키트는 300M 클러스터(단일 리드) 통과 필터를 생성하는 반면, P2 100 사이클, 200 사이클 및 300 사이클 시약 키트는 400M 클러스터(단일 리드) 통과 필터를 생성합니다. P2 600 사이클 시약 키트의 필터를 통과하는 낮은 리드는 더 긴 리드 길이의 더 높은 품질을 보장하기 위한 것입니다.
자주 묻는 질문:
- 사용 가능한 새로운 크기의 P1 및 P2 시약 키트는 무엇입니까?
새로운 크기에는 P1 100 사이클, P1 600 사이클 및 P2 600 사이클 시약 키트가 포함됩니다.
- 새로운 P1 및 P2 시약 키트를 실행하려면 어떤 NextSeq 1000/2000 Control Software 버전이 필요합니까?
NextSeq 1000/2000 Control Software의 버전 1.5는 새로운 P1 및 P2 키트와의 호환성을 도입합니다. 이전 버전의 제어 소프트웨어는 호환되지 않습니다.
- 어떤 버전의 시퀀싱 분석 뷰어(SAV)가 필요하며 어떤 운영 체제에 설치할 수 있습니까?
NextSeq 1000/2000 Control Software v1.5로 수행된 런 메트릭을 보려면 SAV 버전 2.5.12이 필요합니다. SAV v2.5.12은 기기 외부 NextSeq 1000/2000 런 데이터(Windows 버전 10 이상)와만 사용하도록 제작되었으며 다른 플랫폼에는 필요하지 않습니다.
- 새로운 P1 및 P2 키트의 데이터가 온보드 DRAGEN 워크플로우와 호환됩니까?
NextSeq 1000/2000의 온보드 DRAGEN v3.10.11(2022년 12월 중순 출시 예정)은 600개의 사이클 키트로 FASTQ 파일을 생성하는 것이 좋습니다. 3.10.11 이전의 DRAGEN 버전은 600사이클 런으로 디멀티플렉싱하는 동안 실패를 경험할 수 있으며, FASTQ 생성의 재큐가 필요합니다(NextSeq 1000 및 2000 시퀀싱 시스템 가이드에 자세히 설명됨). 롱 리드 애플리케이션(> 2 x 150 bp)의 경우, DRAGEN 2차 분석 솔루션은 클라우드 전용입니다.
- 새로운 P1 및 P2 키트의 예상 실행 시간은 얼마입니까?
P1 100 사이클 시약 키트의 경우 약 10시간, P1 600 사이클 시약 키트의 경우 약 34시간, P2 600 사이클 시약 키트의 경우 약 44시간.
- 이전에 출시된 NextSeq P1000/2000 키트와 비교하여 새로운 P1 및 P2 키트의 로딩 농도에 변화가 있습니까?
새 키트는 동일한 로딩 농도를 사용합니다.
- 새로운 P1 및 P2 키트에는 몇 개의 사이클이 있습니까?
새로운 P1 100 Cycle Reagent Kit에는 최대 138사이클이 있고, 새로운 P1 600 Cycle Reagent Kit에는 최대 638사이클이 있으며, 새로운 P2 600 Cycle Reagent Kit에는 최대 638사이클이 있습니다.
- BaseSpace Sequence Hub(BSSH)의 데모 데이터는 런 성능의 다양한 예를 보여줍니까?
예, BSSH 데모 데이터는 P1 100 사이클 시약 키트, P1 600 사이클 시약 키트 및 P2 600 사이클 시약 키트 런 데이터를 제공합니다.
- 새로운 600사이클 시약 키트의 해동은 600사이클 미만의 키트와 어떻게 다릅니까?
- 25°C에서 제어 수조를 사용하는 경우 600사이클 시약 카트리지는 2시간의 추가 해동 시간이 필요합니다.
- 냉장고(2°~8°C)를 사용하는 경우, 실온에서 6시간 동안 해동하고, 냉장고로 옮겨 최소 16시간 동안 계속 해동합니다.
- 실온(20°C~25°C)에서 해동하려면 최소 12시간에서 최대 16시간이 필요합니다.