라이브러리를 준비하기 전에 시퀀싱 시스템에 사용할 수 있는 옵션을 사용하여 샘플에 대한 정보를 기록합니다.
AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2는 암과의 연관성이 알려진 50개 유전자의 핫스팟 영역 전반에서 체세포 돌연변이를 연구하기 위한 표적 재시퀀싱 assay로, 이는 암의 체세포 돌연변이 카탈로그(COSMIC) 데이터베이스에 명시되어 있습니다.
| 풀 수 | 농도 | 앰플리콘 수 | 평균 앰플리콘 길이(bp) | 평균 라이브러리 길이(bp) |
|---|---|---|---|---|
| 1 | 5X | 207 | 106 | 246 |
AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2 프로토콜을 완료하려면 패널과 다음 라이브러리 준비 및 인덱스 키트 가 필요합니다. AmpliSeq for Illumina Library PLUS Kit는 24, 96 및 384개의 반응 구성으로 제공됩니다.
각 DNA 샘플에 대해 AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2는 하나의 DNA 라이브러리를 생성합니다. 샘플은 하나의 소스에서 추출한 핵산의 표본인 반면, 라이브러리는 준비 후 샘플에서 추출한 핵산입니다. 라이브러리에는 시퀀싱에 필요한 끝이 있습니다.
적절한 수의 샘플을 준비하려면 다음 개수와 키트 조합이 필요합니다.
| 샘플 수 | 샘플 24개 | 샘플 96개 | 샘플 384개 |
|---|---|---|---|
| 라이브러리 수 | 라이브러리 24개 | 96개 라이브러리 | 384개의 라이브러리 |
| AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2 | 1 | 4 | 16 |
| AmpliSeq Library PLUS for Illumina | 24-반응 키트 1개 | 96-반응 키트 1개 | 384-반응 키트 1개 |
| AmpliSeq CD 세트 A(96개 반응, 96개 인덱스) | 1 | 1 | 4 |
| cDNA 합성 | N/A | N/A | N/A |
다음 시스템 및 시약 키트를 사용하는 Illumina Cancer Hotspot Panel v2 라이브러리용 Sequence AmpliSeq.
| 시스템 | Reagent Kit | 런당 샘플 수 |
|---|---|---|
| MiniSeq 시스템 | MiniSeq Mid Output Reagent Kit | 32 |
| MiniSeq High Output Reagent Kit | 96 | |
| MiSeq 시스템 | MiSeq Reagent Nano Kit v2 | 4 |
| MiSeq Reagent Micro Kit v2 | 16 | |
| MiSeq Reagent Kit v2 | 60 | |
| MiSeq Reagent Kit v3 | 96 |