NextSeq Control Software(NCS)가 개선되었습니다. 버전 4.0은 NextSeq 500/550 및 NextSeq 550Dx(연구 전용[RUO] 모드) 기기에 도입되었습니다. 이 업그레이드에는 Local Run Manager(LRM) 설치가 포함되므로 런 설정이 크게 간소화되고 이러한 Illumina 시퀀싱 시스템의 온보드 분석 기능이 향상됩니다.
NextSeq Control Software(NCS)의 새로운 기능은 다음과 같습니다.
- 어레이 기능이 있는 기기에서 Infinium MethylationEPIC BeadChip 스캔
- Windows 10 호환성: 처음에 NextSeq 500/550은 Windows 7과 함께 작동했으며, 이는 2019년 말에 Microsoft에 의해 폐기되었습니다.
- NextSeq 550Dx 기기에서 연구 전용(RUO) 모드에서 NextSeq 500/550 v2.5 키트 사용 가능
- 향상된 실시간 분석(RTA) 버전으로 기본 통화 정확도 향상
- 향상된 Illumina Proactive 모니터링 기능으로 기기 가동 시간 증가
- Local Run Manager(LRM) 통합
- 온보드 분석 옵션 소개
- 런 구성 및 샘플 정보 입력을 위한 향상된 인터페이스
자주 묻는 질문:
NCS 버전 4.0의 설치 프로그램은 온라인으로 다운로드할 수 있습니까?
- 아니요. 업데이트에는 새 하드 드라이브를 설치하거나 시스템을 재이미징해야 하므로 Illumina 엔지니어가 업데이트를 수행해야 합니다. 문의 사항 및 업데이트 일정은 techsupport@illumina.com으로 문의하시기 바랍니다.
Local Run Manager와 온보드 분석의 이점은 무엇인가요?
- LRM은 런 설정 및 다운스트림 데이터 분석을 간소화합니다. 고객은 다양한 분석 모듈 중에서 선택하거나 분석 파이프라인에 통합하기 위해 FASTQ 생성을 자동화할 수 있습니다. 이 프로세스는 컴퓨팅 집약적이므로, 온보드 분석 중에 시퀀싱을 포함한 추가 작업을 기기에 수행해서는 안 됩니다.
분석을 위해 BaseSpace에 런을 업로드할 때 준비 탭이 필요합니까?
- LRM이 준비 탭을 대체합니다. Prep Tab은 NCS 4.0과 호환되지 않으며 최신 버전에는 포함되지 않습니다.
BaseSpace Onsite(BSO)는 NCS v4.0 업그레이드와 호환되나요?
- NCS suite v4.0으로 업그레이드하면 BSO는 더 이상 NextSeq 기기와 직접 통신할 수 없습니다. LRM은 BSO의 런 설정 및 분석 기능을 대체합니다. LRM 분석 모듈에 대한 자세한 내용은 여기에서 확인할 수 있습니다.
- BSO 지원은 2019년에 종료되었습니다. BSO와 NCS suite v4.0 간의 상호 연결에 대한 지원은 지원되지 않지만, BSO는 여전히 고객이 사용할 수 있습니다.
- 참고: BSO 장치를 사용하는 고객은 몇 가지 옵션을 사용할 수 있습니다.
- BSO는 LRM의 FASTQ 파일 출력을 허용합니다. LRM의 FASTQ 출력은 FASTQ 가져오기 기능을 사용하여 BSO에 업로드할 수 있습니다.
- BSO는 Windows 10 라이선스로 용도를 변경할 수 있으며 NextSeq 기기의 출력 파일을 저장하거나 NextSeq 런을 분석할 수 있는 LRM 오프 기기를 실행하도록 구성할 수 있습니다. 후자의 옵션은 고처리량 시퀀싱과 여러 벤치탑 시퀀서가 있는 검사실에 유용합니다.
- BSO는 Linux 운영 체제로 용도를 변경할 수 있습니다. 이 옵션을 통해 고객은 NextSeq 기기의 런을 저장하고 Illumina ® 분석 도구 및 기타 오픈 소스 분석 도구를 활용하도록 BSO를 구성할 수 있습니다.
NCS v4.0과 함께 BSO를 사용하는 데 사용할 수 있는 옵션에 대한 질문은 techsupport@illumina.com으로 문의하십시오.
업그레이드 후 기기가 Illumina Proactive에 연결되어 있습니까?
- Illumina Proactive 설정은 업그레이드 후 유지됩니다. 설정을 변경하려면 설치 시 현장 서비스 엔지니어에게 알리십시오.
내 그룹이 LRM을 배우기 위해 어떤 교육을 받을 수 있나요?
이 업그레이드에는 Windows 10이 포함됩니까?
- 예. Windows 10 OS가 설치된 새 드라이브가 업그레이드와 함께 설치됩니다.
업그레이드는 어떻게 예약하나요?
- NCS v4.0은 현재 새로운 NextSeq 500/550으로 배송 중입니다. 설치된 NextSeq 500/550 기기에서 NCS v4.0으로 소프트웨어 업그레이드를 요청하려면 techsupport@illumina.com으로 문의하십시오.
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