Local Run Manager on NextSeq

NextSeq Control Software(NCS) v4로 업그레이드하는 과정에서 NextSeq 시스템에는 시퀀싱 런 관리를 위한 통합 소프트웨어 솔루션인 Local Run Manager가 제공됩니다. Local Run Manager는 기기 제어 소프트웨어와 통합되어 NextSeq 시스템에서 직접 액세스하거나 원격으로 실행할 수 있습니다.

Local Run Manager는 샘플, 런(run) 및 분석을 설정하고 분석 결과를 보기 위한 간편하고 사용이 용이한 인터페이스를 제공합니다. 또한 샘플 시트 가져오기 및 내보내기도 지원합니다. 사용자 관리에는 권한 설정 및 감사 추적이 포함됩니다. 다양한 라이브러리 유형을 분석하기 위한 여러 분석 모듈을 Local Run Manager와 함께 사용할 수 있습니다.

설치

Local Run Manager는 기기 소프트웨어 제품군의 일부이며 별도의 설치가 필요하지 않습니다.

기기가 인터넷에 연결되어 있으면 모듈 파일을 다운로드하여 Local Run Manager 시스템에 직접 설치할 수 있습니다. 분석 모듈은 Illumina 지원 웹사이트의 Local Run Manager 소프트웨어 다운로드 페이지를 통해 별도로 다운로드됩니다.

분석 모듈

Local Run Manager는 아래 분석 모듈을 지원합니다.* 각 모듈의 참조 가이드에는 해당 모듈의 기반이 되는 분석 파이프라인이 설명되어 있습니다.

  • 16S Metagenomics Analysis Module
  • Amplicon DS Analysis Module
  • Assembly Analysis Module
  • DNA Amplicon Analysis Module
  • DNA Enrichment Analysis Module
  • GenerateFASTQ Analysis Module
  • Library QC Analysis Module
  • Amplicon Module
  • Resequencing Analysis Module
  • RNA Amplicon Analysis Module
  • RNA Fusion Analysis Module
  • Small RNA Analysis Module

* 또한 다양한 타사 분석 솔루션을 사용할 수 있으며 각 솔루션에는 고유한 기능과 제한 사항이 있습니다. 최적의 솔루션을 알아내기 위해서는 프로젝트별로 잠재적인 솔루션을 평가하는 것이 좋습니다.

이전에 생성된 준비 탭 데이터 사용

NCS v4로 업그레이드하면 프로젝트를 BaseSpace Sequence Hub에 업로드할 때 Prep 탭이 아닌 Local Run Manager에서 런을 설정해야 합니다. Prep 탭과 런 설정을 위해 BaseSpace Sequence Hub에서 Local Run Manager를 사용하여 생성된 데이터는 동등합니다. 기기 내 Local Run Manager를 사용할 계획이라면, 일부 모듈에서는 기기 내 및 클라우드 기반 분석이 다를 수 있으므로 Prep 탭을 통해 생성된 이전 데이터와 데이터 아웃풋을 직접 비교하는 것이 좋습니다.

추가 리소스

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