10/19/21
이제 Windows 10 및 MiSeq MiSeq Control Software 시퀀싱 시스템에 대한 업데이트를 사용할 수 있습니다. 시스템 업데이트 중에 MiSeq Reporter 또는 Local Run Manager(LRM) 버전 2가 기기에서 LRM 버전 3으로 교체됩니다. LRM은 런 설정과 2차 분석에 모두 사용됩니다.
LRM 2차 분석 워크플로우는 별도의 모듈로 설치되어 필요한 파이프라인만 설치할 수 있는 유연성을 제공합니다.
이 게시판은 LRM 버전 3으로 업데이트하는 사용자가 각 MiSeq System 버전에 사용할 수 있는 기기 내 분석 옵션을 비교하는 정보를 제공합니다.
MiSeq Reporter와 LRM 버전 2 및 3의 기기 외 버전은 별도의 Windows PC에 설치할 수 있습니다. 어떤 소프트웨어도 MiSeq 기기에 MCS 버전 4 및 LRM 버전 3과 함께 공동 설치할 수 없습니다.
각 프레임워크 버전에 대해 올바른 모듈 버전이 설치되었는지 확인하기 위해 LRM 모듈 선택기 도구를 사용할 수 있습니다.
| 분석 워크플로우 | MiSeq Reporter 워크플로우 (MCS v2.6 이하) |
LRM v2 모듈 (MCS v3) |
LRM v3 모듈 (MCS v4) |
|---|---|---|---|
| FASTQ 생성 | FASTQ 생성 | FASTQ 2.0 생성 | FASTQ 3.0 생성 |
| 라이브러리 QC | 라이브러리 QC | 라이브러리 QC 1.1 | 라이브러리 QC 2.1 |
| 소형 유전체 시퀀싱 | 재시퀀싱 | 재시퀀싱 2.0 | 재시퀀싱 3.0 |
| DNA 인리치먼트 | 인리치먼트 | DNA 인리치먼트 2.0 | DNA 인리치먼트 3.0 |
| AmpliSeq(DNA) | N/A | DNA 앰플리콘 2.1 | DNA 앰플리콘 3.0 |
| TruSeq Amplicon | TruSeq Amplicon | DNA 앰플리콘 2.1 | DNA 앰플리콘 3.0 |
| 16S 메타지노믹스 | 메타지노믹스 | 16S 메타지노믹스 1.0 | 16S 메타지노믹스 2.0 |
| AmpliSeq(RNA) | N/A | RNA 앰플리콘 2.0 | RNA 앰플리콘 3.0 |
| 표적 RNA 발현 | 표적 RNA | RNA 앰플리콘 2.0 | RNA 앰플리콘 3.0 |
| PCR 앰플리콘 | PCR 앰플리콘 | PCR 앰플리콘 1.0 | PCR 앰플리콘 2.0a |
| RNA 유전자 융합 | N/A | RNA Fusion 2.0 | RNA Fusion 3.0a |
| De novo 어셈블리 | 어셈블리 | 어셈블리 1.0 | 어셈블리 2.0b |
| Small RNA | Small RNA | 소형 RNA 2.0 | 소형 RNA 3.0b |
| 앰플리콘 DS | 앰플리콘 DS | 앰플리콘 DS 2.0 | 앰플리콘 DS 3.0b |
| TruSight Tumor 15 | TruSight Tumor 15 | TruSight Tumor 15 2.0 | TruSight Tumor 15 3.0c |
| VeriSeq PGS | VeriSeq PGS | VeriSeq PGS 1.0 | 해당 없음d |
a 2021년 Q4 출시
b 2022년 Q1 출시
c 미정
d VeriSeq PGS는 이제 Vitrolife의 지원을 받습니다.