我所购买的SBS试剂盒最多能够满足多少个循环的测序?

12/22/2022


为上机测序提供足够量的SBS试剂是确保测序获得成功的重要因素之一。如果运行过程中试剂量不够,会导致荧光信号强度和测序质量值降低,甚至可能引起测序失败。双端测序在不同测序仪上有不同的操作流程,具体可以参照Indexed Sequencing Overview Guide。在某些仪器上运行双端index测序时,还需要额外七个循环的试剂做第二个index测序前的化学合成反应(仅合成不拍照),此时计算试剂盒所能支持的测序循环数时,一定要考虑到这七个循环也要被包含在总循环数内。

下面表格列举出了多种试剂盒的规格及每种试剂盒最多支持的循环数,请将在某些仪器上运行双端index测序时额外的7个循环考虑在内:

Reagent Type Reagent Kit Size Maximum Number of Cycles Additional Cycles Needed for Dual Index?
iSeq 100 i1 (v1 or v2) 300 322 No
MiniSeq Rapid Kit 100 128 Yes - 7 cycles
High Output or
Mid Output
75 92 No
150 168
300 318
MiSeq v2
(including Micro and Nano kits)
50 79 Yes - 7 cycles
300 329
500 529
v3 150 179
600 629
NextSeq 500/550 High Output or Mid Output 75 92 No
150 168
300 318
HiSeq 1000/1500/2000/2500 Rapid SBS v2 50 79 7 cycles required for paired-end flow cells
200 229
500 529
TruSeq SBS v3 50 58
200 209
HiSeq SBS v4 50 79
250 279
NextSeq 1000/2000
P1 100 138 No
300 338
600 638
P2 100 138 No
200 238
300 338*
600 638
P3 50 88 No
100 138
200 238
300 327*
HiSeq 3000/4000 N/A 50 79 7 cycles required for single-read flow cells
150 179
300 329
NovaSeq 6000 SP v1.0 100 130 Yes - 7 cycles
200 230
300 330
500 530
S1 and S2 v1.0 100 130
200 230
300 330
S4 v1.0 200 230
300 330
SP v1.5 100 138 No
200 238
300 338
500 538
S1 and S2 v1.5 100 138
200 238
300 338
S4 v1.5 35 72
200 238
300 338

*The NextSeq 1000/2000 P1和P2试剂盒含有338个cycles 而 P3 v3 试剂盒含有327个cycles.

关于每种测序试剂盒的详细信息请参阅对应的试剂支持页面,不同测序试剂盒支持的最长读长请参阅Maximum read length for Illumina sequencing platforms