测序运行输出文件夹的近似大小

12/29/2022

重要说明：本公告中列出的测序输出文件夹大小仅应作为近似值使用。输出文件夹（Output folder）大小因原始簇密度和通过过滤器的簇的数量而有所不同。本文列出的每个平台的输出文件夹大小是基于双index的最佳簇密度情况下进行估算的。对于在非patterned流动槽（Flow Cell）的测序运行，输出文件夹的大小是基于PF值大于80%的情况下进行估算的。

其他文件大小估算的注意事项

  • iSeq™ 100文件夹大小包含了Local Run Manager FASTQ分析流程产生的FASTQ文件
  • MiniSeq™和NextSeq™ 500/550（NextSeq Control Software v4.0 以及以上版本）文件夹大小包含了Local Run Manager FASTQ分析流程产生的FASTQ文件
  • MiSeq™ 文件夹大小包含了MiSeq Reporter FASTQ 分析流程产生的FASTQ文件和MiSeq (MiSeq Control Software 3.1以及以上版本) Local Run Manager FASTQ分析流程产生的FASTQ文件
  • NexSeq™ 1000/2000文件夹大小没有包含本地分析结果。本地分析结果大小根据分析流程不同，大小为25GB到120+GB。
  • HiSeq™ 1500/2500，HiSeq™ 3000/4000，HiSeq™ X以及NovaSeq™ 6000 文件夹大小不包含FASTQ文件。HiSeq™ 1500/2500，HiSeq™ 3000/4000，HiSeq™ X以及NovaSeq™ 6000 文件夹大小仅代表单个流动槽（Flow Cell）的文件夹大小。

Illumina推荐将iSeq 100, NextSeq 500/550, NextSeq 1000/2000, HiSeq 1500/2500, HiSeq 3000/4000, HiSeq X等测序仪器的Output文件夹存储在网络位置。 NovaSeq Control Software要求把Output文件夹存储在网络位置。

iSeq 100 | MiniSeq | MiSeq | NextSeq 500/550 | NextSeq 1000/2000 | HiSeq 1000/1500/2000/2500 | HiSeq 3000/4000 | HiSeq X | NovaSeq 6000

iSeq 100

测序读长 文件夹大小（GB）
 2 x 150 bp 1.5 - 2.5
 
MiniSeq
 
测序读长 Output文件夹大小（GB）
中通量 高通量 快速试剂盒
  2 x 150 bp 2.3 - 2.6 7 - 8 N/A
2 x 75 bp N/A 6 - 8 N/A
1 x 100 bp N/A N/A 2
1 x 75 bp N/A 2 - 4 N/A


MiSeq

v3 Chemistry
测序读长 Output文件夹大小（GB）
  2 x 300 bp 22 - 26
2 x 75 bp 19 - 22

 

v2 Chemistry
测序读长 测序试剂盒配置
 Output文件夹大小（GB）
 2 x 250 bp Standard 22 - 24
  2 x 250 bp  Nano 1.6 - 1.8
 2 x 150 bp Standard 16 - 18
 2 x 150 bp Micro 3 - 5
 2 x 150 bp Nano 0.8 - 1.2
2 x 25 bp Standard 14 - 16
 
 
NextSeq 500/550
 
测序读长 Output文件夹大小（GB）
中通量 高通量
  2 x 150 bp 62 - 66 160 - 170
2 x 75 bp 39 - 46 92 - 97
1 x 75 bp N/A 50 - 78

 

NextSeq 1000/2000

测序读长 Output文件夹大小（GB）
P1 P2 P3
2 x 300 85 - 95 140 - 160 N/A
2 x 150 50 - 55 89 - 99 165 - 170
2 x 101 40 - 45 65 - 66 103 - 126
2 x 75 35 - 40 44 - 55 N/A
2 x 50 N/A N/A N/A
 

HiSeq 1000/1500/2000/2500

测序读长 高通量 TruSeq SBS v3
Output 文件夹大小（GB）		 高通量 SBS v4
Output 文件夹大小（GB）		 HiSeq Rapid Run v2
Output文件夹大小（GB）
2 x 250 bp N/A N/A 80 - 100
2 x 125 bp 295 - 310 190 - 210 N/A
2 x 100 bp 225 N/A 55 - 60
 2 x 50 bp 133 77 - 83 32 - 36

 

HiSeq 3000/4000

测序读长 Output文件夹大小（GB）
  2 x 150 bp 560
2 x 75 bp 290
2 x 25 bp 80

 

HiSeq X

测序读长 Output文件夹大小（GB）
 2 x 150 bp 560

 

NovaSeq 6000

测序读长 SP 流动槽
Output文件夹大小（GB）		 S1 流动槽
Output文件夹大小（GB）		 S2 流动槽
Output文件夹大小（GB）		 S4 流动槽
Output文件夹大小（GB）
1 x 36 bp 20 N/A N/A 240
 2 x 150 bp 185 370 730 2190
 2 x 250 bp 400 N/A N/A N/A

 

这些表中的输出文件夹大小以千兆字节(gigabytes)为单位。

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