06/08/20
Illumina a récemment lancé les doubles indexes ADN uniques Nextera™ (Nextera Unique Dual Indexes – Nextera UDI) fait par IDT® pour Illumina®, afin d'élargir la sélection possible d'index pour le démultiplexage et de fournir de nouvelles solutions pour atténuer le mélange d'index (index hopping). Les Nextera UDI sont compatibles avec la chimie pour la préparation des librairies Nextera pour générer des librairies doublement indexées (10 pb pour chaque index).
Vous trouverez ci-dessous un résumé de la compatibilité des offres d'index actuelles avec les kits de préparation de librairie Nextera.
Tableau 1. Offres d'index Nextera actuelles et kits de préparation de librairie Nextera.
Nom de l'index | Numéros de catalogue | Longueur des indexes |
Compatibilité des indexes avec la préparation de librairie BBN * |
Compatibilité des kits préparation de librairie | ||
---|---|---|---|---|---|---|
Nextera XT |
Nextera DNA Flex |
Nextera Flex for Enrichment |
||||
Nextera UD Indexes (UDI) |
20027213 20027214 20027215 20027216 |
10 bp | ✔ | ✔ | ✔ | |
Nextera DNA CD Indexes |
20018707 20018708 |
8 bp | ✔ | |||
Nextera XT Indexes |
FC-131-1001 FC-131-2001 FC-131-2002 FC-131-2003 FC-131-2004 |
8 bp | ✔ | ✔ |
*BBN: normalisation à base de billes, réactifs inclus dans les kits de préparation de librairies Nextera XT.
Remarque:
Les séquences d'index se trouvent dans le document Illumina Adapter Sequences.