업그레이드란 무엇인가요?

MiSeq System 업그레이드는 MiSeq Control Software(MCS) v4.0으로 업데이트하여 이루어집니다. MCS v4.0은 몇 가지 업데이트를 제공합니다.

• Windows 10 운영 체제로 업그레이드 및 새 하드 드라이브 설치
• MiSeq® System Suite를 v4.0으로 업데이트
• LRM v2 또는 MiSeq Reporter를 대체하는 Local Run Manager(LRM) v3으로 업데이트. 이렇게 하면 다음과 같은 개선 사항이 제공됩니다.
  • 간소화된 런 설정 및 온보드 분석
  • 사용자 계정 잠금 해제를 위해 보안 질문을 사용하는 새로운 비밀번호 복구 기능
  • 향상된 계정 보안 기능
  • 분리된 라이브러리 준비 키트 및 인덱스 키트의 취급 개선
• 업그레이드는 Illumina 현장 서비스 엔지니어 또는 현장 애플리케이션 과학자가 수행해야 합니다.

MiSeq® System Suite v4.0의 소프트웨어 변경 사항은 MiSeq v4.0 소프트웨어 릴리스 노트에서 확인할 수 있습니다. 모든 Illumina 시퀀싱 시스템에 대한 최신 Windows 10 업그레이드 정보는 Windows 10 업그레이드 지원 페이지에서 확인할 수 있습니다.

업그레이드 프로세스

• MiSeq을 Windows 10 및 MiSeq® System Suite v4.0으로 업그레이드하려면 기기 일련 번호로 Illumina 기술 지원팀에 문의하십시오.
• 원활한 업그레이드를 위해 Illumina 현장 지원팀이 귀하에게 연락하여 업그레이드 전 점검 목록과 네트워크 설정 설문지를 작성할 것입니다.
• 필요한 정보를 받은 후 Illumina 현장 팀과 업그레이드를 조정하고 일정을 잡습니다.
• MiSeq 기기가 유효한 서비스 계약 또는 1년 보증의 적용을 받는 경우, 추가 비용 없이 업그레이드가 제공됩니다.
• 업그레이드는 서비스 계약에 포함되지 않은 기기에 대해 청구 가능한 서비스로 제공됩니다.
• 업그레이드 후에는 제어 소프트웨어를 이전 버전으로 다운그레이드할 수 없습니다.
• Clarity LIMS는 MCS v4.0과의 통합을 지원합니다.

MCS v4.0의 새로운 인터페이스

MCS v4.0에는 실행을 시작하고 기기 세척을 수행하기 위한 시퀀스 및 세척 옵션이 포함된 업데이트된 홈 화면이 있습니다. 기기 종료, 시스템 설정, 시스템 점검 및 파일 관리를 포함한 추가 기능은 화면 왼쪽 상단 모서리에 있는 햄버거 메뉴를 통해 사용할 수 있습니다.

MiSeq Control Software v4.0으로 설정 실행

런 설정 옵션에는 LRM 모드, 샘플 시트 모드 또는 수동 모드가 포함됩니다. 모든 옵션을 사용하면 런 모니터링을 위해 BaseSpace Sequence Hub(BSSH)에 런을 업로드할 수 있습니다. 또한 LRM 모드를 사용하면 런 분석, 협업 및 보관을 위해 BSSH에 업로드할 수 있습니다. BaseSpace Onsite는 단종되었으며 MCS v4.0과 호환되지 않습니다.

 MiSeq® System 가이드에는 런 설정 지침이 포함되어 있습니다. LRM 런 설정은 간단하며 런 설정을 위한 기본 옵션입니다. LRM이 처음인 경우, 20 분 간의 대화형 Local Run Manager v3 과정을 완료하는 것이 좋습니다. Illumina는 또한 LRM v3 소개 웨비나를 주최합니다.

MCS v4.0의 샘플 시트

• Illumina Experiment Manager(IEM)에서 생성된 샘플 시트는 MCS v4.0과 호환되지 않습니다. IEM 샘플 시트는 MCS v4.0 런 설정 옵션 “샘플 시트” 모드에서 가져올 수 없습니다. LRM 샘플 시트만 호환됩니다.
• 샘플 시트를 생성하려면 원하는 LRM 모듈 페이지에서 샘플 시트 템플릿을 다운로드하여 수동으로 채우고 LRM 모듈에 업로드합니다.
• 템플릿 샘플 시트가 게시되고 샘플 시트 필드에 대한 자세한 정보는 MiSeq Sample Sheet Quick Reference Guide 포함되어 있습니다.

LRM v3.0에 대한 중요 정보

• 출시 시 사용 가능한 LRM v3.0 모듈은 Generate FASTQ 3.0, Library QC 2.1 및 Resequencing 3.0입니다.
• DNA Enrichment 3.0, DNA Amplicon 3.0 및 기타 모듈은 출시 직후에 제공될 예정입니다.
• 필요한 LRM 분석 모듈을 아직 사용할 수 없는 경우 BSSH에서 사용할 수 있는 대체 분석 앱을 사용하십시오.
• 일부 워크플로우의 경우, 더 많은 LRM 모듈을 사용할 수 있을 때 업그레이드를 예약하는 것이 선호되는 옵션일 수 있습니다.
• LRM v1, v2, v3 및 Dx 모듈은 각 프레임워크에 고유하며 교차 설치할 수 없습니다.
• 새로 출시된 모듈을 확인하려면 LRM 모듈 선택기를 사용하십시오.

네트워킹 고려 사항

출력 폴더를 네트워크 위치로 설정하는 것은 Windows 10 인증 요구 사항으로 인해 특별한 고려 사항이 있습니다. Windows 10에서는 사용자가 비밀번호를 주기적으로 업데이트해야 합니다. 네트워크를 구성하려면 IT 팀과 협력하여 벤치탑 기기 및 Local Run Manager를 네트워크 위치에 연결하는 방법 게시판의 지침을 따르십시오.

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