WGS, RNA-seq, 엑솜/증균, 앰플리콘, 16S 메타지노믹스 등 광범위한 NGS 방법 지원
DRAGEN 2차 분석은 광범위한 유전체 분석 기능을 위한 애플리케이션과 파이프라인을 제공합니다. DRAGEN 앱은 BaseSpace Sequence Hub의 클라우드에서 정확하고 효율적이며 안전한 분석을 제공합니다. DRAGEN 파이프라인은 온프레미스 서버를 통해, Illumina Connected Analytics의 클라우드에서, 또는 NextSeq 1000 및 NextSeq 2000 시스템 및 NovaSeq X Series에 탑재하여 실행할 수 있는 데이터 분석 도구입니다.
| 애플리케이션 | DRAGEN 온프레미스 서버 | NovaSeq X 시리즈 | NextSeq 1000/2000 | BaseSpace Sequence Hub | 연결된 분석 |
|---|---|---|---|---|---|
| BCL 변환 | 체크 표시
아이콘을 사용할 수 없음
|
체크 표시
아이콘을 사용할 수 없음
|
체크 표시
아이콘을 사용할 수 없음
|
체크 표시
아이콘을 사용할 수 없음
|
(사용자 지정 전용)
|
| 드레인 ORA 압축 | 체크 표시
아이콘을 사용할 수 없음
|
체크 표시
아이콘을 사용할 수 없음
|
체크 표시
아이콘을 사용할 수 없음
|
(사용자 지정 전용)
|
|
| DRAGEN FASTQ + 멀티QC | 체크 표시
아이콘을 사용할 수 없음
|
체크 표시
아이콘을 사용할 수 없음
|
체크 표시
아이콘을 사용할 수 없음
|
체크 표시
아이콘을 사용할 수 없음
|
체크 표시
아이콘을 사용할 수 없음
|
| 전체 유전체 | 생식세포 + 체세포 | 생식세포 + 체세포 | 생식세포만 | 생식세포 + 체세포 | 생식세포 + 체세포 |
| 농축(엑솜 포함) | 생식세포 + 체세포 | 생식세포 + 체세포 | 생식세포 + 체세포 | 생식세포 + 체세포 | 생식세포 + 체세포 |
| DNA 앰플리콘 | 체크 표시
아이콘을 사용할 수 없음
|
체크 표시
아이콘을 사용할 수 없음
|
체크 표시
아이콘을 사용할 수 없음
|
체크 표시
아이콘을 사용할 수 없음
|
|
| RNA | 체크 표시
아이콘을 사용할 수 없음
|
체크 표시
아이콘을 사용할 수 없음
|
체크 표시
아이콘을 사용할 수 없음
|
체크 표시
아이콘을 사용할 수 없음
|
체크 표시
아이콘을 사용할 수 없음
|
| 단일 세포 RNA | 체크 표시
아이콘을 사용할 수 없음
|
체크 표시
아이콘을 사용할 수 없음
|
체크 표시
아이콘을 사용할 수 없음
|
체크 표시
아이콘을 사용할 수 없음
|
|
| 차등 발현 | 체크 표시
아이콘을 사용할 수 없음
|
체크 표시
아이콘을 사용할 수 없음
|
체크 표시
아이콘을 사용할 수 없음
|
||
| NanoString GeoMx NGS(공간 전사체학) | 체크 표시
아이콘을 사용할 수 없음
|
체크 표시
아이콘을 사용할 수 없음
|
|||
| RNA 앰플리콘(amplicon) | 체크 표시
|
체크 표시
|
|||
| 메틸레이션 | 체크 표시
아이콘을 사용할 수 없음
|
체크 표시
아이콘을 사용할 수 없음
|
체크 표시
아이콘을 사용할 수 없음
|
||
| 메타지노믹스 | 체크 표시
아이콘을 사용할 수 없음
|
||||
| RNA 병원체 검출 | 체크 표시
|
||||
| 코로나 | COVIDSeq, COVID 계보 | COVIDSeq(클라우드만 해당) | COVIDSeq, COVID 계보 | ||
| TruSight Oncology 500 | ctDNA 사용 가능(고체 출시 예정) | v3.10에서 활성화됨 | 체크 표시
아이콘을 사용할 수 없음
|
||
| ScATAC-Seq(전위효소 접근 가능 염색질에 대한 단일 세포 염기서열 분석) | 체크 표시
|
체크 표시
|
체크 표시
|
||
| 대치 | 체크 표시
아이콘을 사용할 수 없음
|
체크 표시
아이콘을 사용할 수 없음
|
체크 표시
아이콘을 사용할 수 없음
|
||
| PGx 스타 대립유전자 호출자 | 체크 표시
아이콘을 사용할 수 없음
|
체크 표시
아이콘을 사용할 수 없음
|
체크 표시
아이콘을 사용할 수 없음
|
||
| Illumina Complete Long Read | 체크 표시
아이콘을 사용할 수 없음
|
||||
| RPIP 및 UPIP 패널 | 체크 표시
아이콘을 사용할 수 없음
|
네이티브 엑플리파이트 솔루션 | 베타 |
| 파이프라인 | 설명 | 검출된 변이 유형a | 제공된 메트릭 | 간행물 |
|---|---|---|---|---|
| DRAGEN 디멀티플렉싱 | NGS 분석의 신속한 역다중화 수행 | |||
| DRAGEN ORA 압축 | 빠른 압축 및 감압뿐만 아니라 FASTQ 파일의 높은 압축 비율에 최적화되어 데이터 무결성을 유지합니다. |
|
설계 고려사항 및 방법론 | |
| 드로겐 맵 + 정렬 | 독립 실행형 또는 |
|
|
|
| DRAGEN Germline | Illumina Expansion Hunter를 통해 정확도를 높이고 반복 확장 감지 및 유전형 분석을 위한 고급 오류 모델 보정을 포함한 NGS 분석 제공 | SNV 인델 CNV SV 반복 확장 |
|
|
| DRAGEN Somatic | 종양 검체에서 체세포 변이를 검출하도록 설계된 종양 단독 및 종양 정상 모드가 포함된다. 두 모드 모두 배율 가정을 하지 않으므로 저주파 대립유전자를 검출할 수 있습니다. | SNV 인델 CNV SV TMB MSI HLA |
|
|
| DRAGEN Enrichment | DRAGEN 생식선 및 체세포 호출기를 증균 시료 분석을 위해 특별히 설계된 파이프라인에 결합합니다. 강화 지표 및 보고의 전체 제품군 포함 | SNV CNV SV |
|
|
| DRAGEN RNA | 스플라이스 접합부 발견 및 정렬부터 시작하여 빠른 정렬 및 스플라이스 접합부 매핑 및 정량화까지 전사체 분석을 수행합니다. (차등 표현의 경우, Illumina는 BaseSpace Sequence Hub에서 DRAGEN 차등 표현 앱을 권장합니다). | SNV 인델 유전자 융합 |
|
방글라데시 SARS-CoV-2 균주의 점 돌연변이 식별 |
| DRAGEN 단일 세포 RNA | 유전자 발현의 역다중화, 세포 바코드 및 UMI 오류 보정, 서열 정렬 및 정량화를 수행합니다. |
|
||
| DRAGEN 관절 유전자형 분석 | 여러 유전체에 걸쳐 변이체를 공동으로 호출하고 타협하지 않는 정확도로 신속한 속도로 대규모 샘플 코호트로 확장 | SNV 인델 CNV SV 반복 확장 |
|
대규모 인간 유전체 연구를 위한 하이브리드 클라우드 시스템 |
| DRAGEN 메틸화 | 정렬 및 메틸 콜을 수행합니다. 정렬 및 메틸화 메트릭을 계산합니다. |
|
||
| DRAGEN 참조 작성기 | FASTA 파일을 수락하고 DRAGEN 앱에서 사용하는 독점 참조를 구축합니다. | |||
| DRAGEN TruSight Oncology 500 ctDNA 분석 소프트웨어 | TruSight Oncology 500 ctDNA에 대한 이차 분석 지원을 제공합니다. 로컬 DRAGEN 서버(버전 3)에서만 사용 가능 | SNV 인델 CNV DNA 융합 MSI TMB |
|
cfDNA 분석법 검증을 위한 혈액 TMB 표준물질 개발 |
| DRAGEN 대치 | 사용자 친화적인 도구에서 확장 가능한 저역통과 전장 유전체 시퀀싱 분석 가능 | SNV 인델 인델 |
변종 호출 성능 향상 |
a. SNV, 단일 뉴클레오티드 변이체; CNV, 복제수 변이; SV, 소 변이체; TMB, 종양 돌연변이 부담; MSI, 현미부수체 불안정성; HLA, 인간 백혈구 항원
설명: 이 솔루션에서는 돌연변이 검출, 새로운 변이 식별, COVID-19 숙주 반응 연구, 공유 데이터베이스에 결과 제공이 가능합니다.
엑솜 염기서열분석을 위한 Illumina DNA Prep과 DRAGEN의 분석력을 결합하면 FFPE 종양 샘플에서 효율적이고 정확한 변이체 분석을 가능하게 합니다.
엑솜 염기서열분석을 위한 Illumina DNA Prep과 DRAGEN의 분석력을 결합하면 FFPE 종양 샘플에서 효율적이고 정확한 변이체 분석을 가능하게 합니다.
입증된 Illumina 시퀀싱과 결합된 NanoString GeoMx DSP는 유전자 및 단백질 프로파일링에 필요한 조직 구조에 대한 정보와 고집적도 공간 분석을 제공합니다.
DRAGEN 분석 기능에 대한 자세한 내용을 보고, 주문 방법을 배우고, 제품 설명서를 찾아보십시오. 또한 전문가와 상담하여 질문에 대한 답변을 얻을 수 있습니다.
귀하의 이메일 주소는 결코 제3자와 공유되지 않습니다.