NovaSeq X 시리즈 주문
발전된 화학 반응, 광학 및 인포매틱스가 결합되어 뛰어난 속도와 데이터 품질, 뛰어난 처리량과 확장성을 제공합니다.
Infinium CytoSNP-850K v1.3 BeadChip은 세포유전체 연구를 위해 국제 커뮤니티의 최신 정보를 활용하는 최초의 SNP 기반 인간 마이크로어레이입니다.
Infinium CytoSNP-850K v1.3 BeadChip
컨소시엄이 구축한 SNP 기반 마이크로어레이는 체질 및 암 연구를 위해 3,262개의 세포유전학적 관련 유전자의 완전한 커버리지(coverage)를 제공합니다.
iScan 시스템에서 주당 960개 샘플(자동화, 주당 24개 BeadChips/배치 및 2개 배치/FTE/Tecan). NextSeq 550 시스템에서 주당 128개 검체(주당 8개의 BeadChips/배치 및 2개의 배치/FTE/Tecan).
샘플 처리량
어레이당 8개 샘플
샘플 수
고정 표지자: ~848,000개 맞춤형 표지자 추가 용량: 없음
표지자의 수
개요
주요 기능
전문가 정보에 입각한 포괄적인 커버리지
유전자 목록은 국제임상유전체학협력(International Collaboration for Clinical Genomics, ICCG)1 및 암유전체학 컨소시엄(C Cancer Genomics Consortium,CGC)2의 내용을 근거로 정의되었으며, 세포유전체학 활성에 대한 철저한 견해를 제공했다.
낮은 수준의 모자이크에 대한 고도 검출 민감도
SNP 표적에 대해 고도의 민감도를 가진 긴 50-mer 프로브를 사용하면 낮은 수준의 모자이크에 대한 민감도를 증가시키고3, 이형접합성의 복제수 무변화 손실(LOH)에 대해 높은 해상도를 제공합니다. 15배 높은 비드 중복성으로 정확한 CNV를 만들기 위한 신호 대 잡음비 및 유전체 전반에 걸쳐 이형접합성 부재(Absence of Heterozygosity, AOH) 검출을 늘립니다.
사양
| Assay 시간 | 3일 |
|---|---|
| Assay type | Infinium HD Super |
| 자동화 기능 | Liquid handling robots, Automated array loader |
| Cancer type | Hematologic, Solid tumor |
| 설명 | Infinium CytoSNP-850K BeadChip은 알려진 세포유전학적 관련성이 있는 3262개 유전자의 질병 중심 범위를 통해 의미 있는 염색체 이상을 발견하기 위한 고해상도 분석을 가능하게 합니다. |
| 수작업 시간 | 자동화된 8-beadchip 워크플로우의 경우 1시간 5분, 수동 8-beadchip 워크플로우의 경우 6시간 15분 |
| 사용량 | DNA 200 ng |
| Instruments | NextSeq 550 System, iScan System |
| 방법 | Cytogenomic array, Genome-wide genotyping array |
| Nucleic acid type | DNA |
| 표지자의 수 |
고정 표지자: ~848,000개 맞춤형 표지자 추가 용량: 없음 |
| 샘플 수 | 어레이당 8개 샘플 |
| 샘플 처리량 | iScan 시스템에서 주당 960개 샘플(자동화, 주당 24개 BeadChips/배치 및 2개 배치/FTE/Tecan). NextSeq 550 시스템에서 주당 128개 검체(주당 8개의 BeadChips/배치 및 2개의 배치/FTE/Tecan). |
| 특수 샘플의 종류 | FFPE tissue, Blood, Saliva |
| Species category | Human |
| Technology | Microarray |
| 변이 클래스 | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Loss of heterozygosity (LOH), Chromosomal abnormalities, Copy number variants (CNVs) |
필수 제품
선택한 키트 크기를 한 번에 실행하는 샘플 수에 맞춥니다. 각 키트는 단일 배치로 처리되며 여러 실험에 걸쳐 분할되도록 설계되지 않았습니다. 처리량이 적은 배치를 여러 개 처리하는 경우 여러 개의 소형 키트를 주문해 보세요.
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결과
애플리케이션
Infinium CytoSNP-850K v1.3 BeadChipArray는 유전체에 걸쳐 있는 최대 850,000개의 SNP를 포함하고 있으며, 연구자들이 체질 및 암 애플리케이션에 대한 염색체 이상의 영향을 연구할 수 있도록 알려진 관련성이 있는 3,262개의 유전자에 대한 풍부한 커버리지를 제공합니다.
예시 워크플로우
관련 애플리케이션 및 방법
Sequencing- and microarray-based technologies offer complementary approaches for identifying chromosomal abnormalities in cancer.
Chromosomal microarrays reliably detect copy number and allelic contribution imbalances associated with constitutional disorders.
Clinical researchers can obtain a complete view of cancer cytogenetics by combining next-generation sequencing (NGS) and microarrays.
문서
제품 관련 자료
Support documentation
비교하기
| Infinium CytoSNP-850K v1.3 BeadChip | Cytogenetics-24 | ||
|---|---|---|---|
| Assay 시간 | 3일 | 3 days | |
| Assay type | Infinium HD Super | ||
| 자동화 기능 | Liquid handling robots, Automated array loader | Liquid handling robots, Automated array loader | |
| Cancer type | Hematologic, Solid tumor | Hematologic, Solid tumor | |
| 설명 | Infinium CytoSNP-850K BeadChip은 알려진 세포유전학적 관련성이 있는 3262개 유전자의 질병 중심 범위를 통해 의미 있는 염색체 이상을 발견하기 위한 고해상도 분석을 가능하게 합니다. | The 24-sample Infinium Global Screening Array with Cytogenetics-24 provides targeted coverage of more than 4800 key genes across the genome. Approximately 700K markers are included on the BeadChip for high exonic coverage in regions of disease relevance, providing highly accurate copy number variation calls, and an average resolution of 2.5Mb. | |
| 수작업 시간 | 자동화된 8-beadchip 워크플로우의 경우 1시간 5분, 수동 8-beadchip 워크플로우의 경우 6시간 15분 | 1 hour and 5 minutes for automated 8-beadchip workflow | |
| 사용량 | DNA 200 ng | 200 ng DNA | |
| Instruments | NextSeq 550 System, iScan System | iScan System | |
| 방법 | Cytogenomic array, Genome-wide genotyping array | Cytogenomic array, High-throughput genotyping array | |
| Nucleic acid type | DNA | DNA | |
| 표지자의 수 |
고정 표지자: ~848,000개 맞춤형 표지자 추가 용량: 없음 |
||
| 샘플 수 | 어레이당 8개 샘플 | 24 samples per array | |
| 샘플 처리량 | iScan 시스템에서 주당 960개 샘플(자동화, 주당 24개 BeadChips/배치 및 2개 배치/FTE/Tecan). NextSeq 550 시스템에서 주당 128개 검체(주당 8개의 BeadChips/배치 및 2개의 배치/FTE/Tecan). | ||
| 특수 샘플의 종류 | FFPE tissue, Blood, Saliva | Blood, FFPE tissue, Buccal swabs, Saliva | |
| Species category | Human | Human | |
| Technology | Microarray | Microarray | |
| 변이 클래스 | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Loss of heterozygosity (LOH), Chromosomal abnormalities, Copy number variants (CNVs) | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Loss of heterozygosity (LOH), Chromosomal abnormalities, Copy number variants (CNVs) |
선택 도구:
Library Prep and Array Kit Selector
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그림 자료
Infinium CytoSNP-850K v1.3 BeadChip 커버리지
Infinium CytoSNP-850K v1.3 BeadChip에는 유전체에 걸쳐 경험에 의거하여 선택된 최대 850,000개의 단일 염기 다형성(Single Nucleotide Polymorphisms, SNP)이 포함되어 있습니다. 이러한 높은 밀도의 SNP를 통해 의미 있는 염색체 이상의 발견을 위한 고해상도 분석이 가능해집니다.
| 프로브 간격 | 평균 거리 |
| 대상 영역 프로브 간격 |
~1 kb |
| 목표 영역 해상도 |
~10 kb |
| 유전체 백본 프로브 간격 |
~5 kb |
| 전체 프로브 간격 |
~1.8 kb |
| 전반적으로 효과적인 해결 방법 |
~18kb |
Infinium CytoSNP-850K v1.3 BeadChip 표지자 정보ª
| 마커 범주b | iScan 시스템 |
| 총 마커 수 |
848,902 |
| RefSeq 유전자 |
467,422 |
| 참조 시퀀스 +/- 10 kb |
541,515 |
| ADME 유전자 |
15,153 |
| ADME +/- 10 kb |
18,590 |
| COSMIC 유전자 |
418,131 |
| HLA 표지자 |
5145 |
| HLA 유전자 |
276 |
| GO 유전자 |
137,873 |
| 엑소닉 영역 |
68,801 |
| 프로모터 지역 |
26,814 |
| X 염색체 마커 |
29,894 |
| Y 염색체 표지자 |
1197 |
| PAR/상동 표지자 |
728 |
a. 값은 분석 매니페스트 파일에서 얻습니다. 각 기구에 대해 BeadChip을 처리하는 데 필요한 매니페스트/제품 파일이 다르기 때문입니다.
b. 인간 유전체 문제 hg19 참조 유전체와 비교. 약어: ADME, 흡착, 분포, 대사, 배설; COSMIC, 암의 체세포 돌연변이 카탈로그; MHC, 주요 조직적합성 복합체; HLA, 인간 백혈구 항원; PAR, 가성상염색체 부위
리소스
Infinium-Array 발전 축하
표적 및 전장 유전체 연구를 위해 탁월한 데이터 품질과 고밀도 유전체(genome) 커버리지를 제공하도록 설계된 포괄적인 Infinium 마이크로어레이 제품군에 대해 알아보세요.
Infinium CytoSNP-850K v1.4 Beadchip Kit (8 Samples)
20103480
헌법 및 암 세포유전학 응용 분야에 최적화되었습니다. BeadChip은 8개의 샘플을 처리하고 복제수 변이체(CNVS) 및 이형접합성 부재(AOH) 모두에 대해 850,000개의 단일 뉴클레오티드 다형성(SNP)을 분석할 수 있다. 각 포장에는 8개의 DNA 샘플에 대한 CNV 및 AOH 증폭, 단편화, 혼성화, 라벨링 및 검출을 위한 시약과 함께 BeadChip 1개가 들어 있습니다.
List Price:
Discounts:
Infinium CytoSNP-850K v1.4 Beadchip Kit (16 Samples)
20103481
헌법 및 암 세포유전학 응용 분야에 최적화되었습니다. BeadChip은 8개의 샘플을 처리하고 복제수 변이체(CNVS) 및 이형접합성 부재(AOH) 모두에 대해 850,000개의 단일 뉴클레오티드 다형성(SNP)을 분석할 수 있다. 각 포장에는 2개의 BeadChip과 16개의 DNA 샘플에 대한 CNV 및 AOH 증폭, 단편화, 혼성화, 라벨링 및 검출을 위한 시약이 들어 있습니다.
List Price:
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Infinium CytoSNP-850K v1.4 Beadchip Kit (48 Samples)
20103482
헌법 및 암 세포유전학 분야에 최적화되었습니다. BeadChip은 8개의 샘플을 처리하고 복제수 변이체(CNVS) 및 이형접합성 부재(AOH) 모두에 대해 850,000개의 단일 뉴클레오티드 다형성(SNP)을 분석할 수 있다. 각 포장에는 48개의 DNA 샘플에 대한 CNV 및 AOH 증폭, 파편화, 혼성화, 라벨링 및 검출을 위한 시약과 함께 6개의 BeadChip이 들어 있습니다.
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Infinium CytoSNP-850K v1.4 Beadchip Kit (96 Samples)
20103483
헌법 및 암 세포유전학 분야에 최적화되었습니다. BeadChip은 8개의 샘플을 처리하고 복제수 변이체(CNVS) 및 이형접합성 부재(AOH) 모두에 대해 850,000개의 단일 뉴클레오티드 다형성(SNP)을 분석할 수 있다. 각 포장에는 12개의 BeadChip과 96개의 DNA 샘플에 대한 CNV 및 AOH 증폭, 단편화, 혼성화, 라벨링 및 검출을 위한 시약이 들어 있습니다.
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제품
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단가
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카탈로그 ID:수량:
FAQ
FFPE 샘플은 Infinium FFPE QC 키트 및 Infinium FFPE 복원 키트를 사용하여 CytoSNP-850K에서 실행할 수 있습니다.
FFPE별 manifest 및 cluster 파일은 CytoSNP-850K 지원 페이지에서 다운로드할 수 있습니다.
CytoSNP-850K Lab Planner 도구를 사용하여 배치 가져오기 파일을 생성할 수 있습니다. 배치 가져오기 .txt 파일이 생성되면 파일|배치|배치 가져오기로 이동하여 배치 가져오기 파일을 찾은 다음 열기를 클릭합니다.
자세한 내용은 BlueFuse Multi Software Guide의 Import 24sure 및 BeadArray Experiments 섹션에서 확인할 수 있습니다.
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결과
MiSeq Reagent Kit v3
클러스터 밀도와 판독 길이를 높여 이전 버전에 비해 시퀀싱 품질 점수를 개선하는 최적화된 시약 키트입니다.
TruSight Oncology 500
FFPE 조직의 모든 주요 변이 계열과 유전자 시그니처(TMB, MSI, HRD)를 포함하는 대형 범암 패널로 CGP를 활성화합니다.
Illumina DNA Prep
광범위한 시퀀싱 애플리케이션에 사용하기 위한 매우 정확한 데이터를 생성하는 효율적이고 빠른 통합 라이브러리 프렙 워크플로우입니다.
TruSight One Sequencing Panels
분석 민감도와 특이성이 높은 엑솜의 질병 관련 영역을 표적으로 하는 포괄적인 염기서열분석 연구 패널.
Infinium FFPE QC and DNA Restoration Kit
Infinium 어레이 기반 assay에 사용하기 위해 샘플 품질을 평가하고 분해된 FFPE DNA 샘플을 복구합니다.
Infinium MethylationEPIC v2.0 Kit
전후성유전체 연관성 연구를 위한 CpG 섬(island), 유전자, 인핸서(enhancer) 등 폭넓은 범위에 적용되는 강력한 메틸레이션 프로파일링 마이크로어레이입니다.
참고문헌 :
1. Clinical Genome Resource. www.clinicalgenome.org. Accessed December 12, 2022.
2. Cancer Genomics Consortium. www.cancergenomics.org. Accessed December 12, 2022.
3. Conlin LK, Thiel BD, Bonnemann CG, et al. Mechanisms of mosaicism, chimerism and uniparental disomy identified by single nucleotide polymorphism array analysis. Hum Mol Genet. 2010;19(7):1263-75. doi: 10.1093/hmg/ddq003.
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