Illumina DNA Prep

광범위한 시퀀싱 애플리케이션에 사용하기 위한 매우 정확한 데이터를 생성하는 효율적이고 빠른 통합 라이브러리 프렙 워크플로우입니다.

약 3~4시간(DNA 추출부터 정규화된 라이브러리까지)

Assay 시간

1~1.5시간

수작업 시간

작은 게놈(예: 미생물)의 경우 1~500 ng DNA, 또는 큰 게놈(예: 인간)의 경우 100~500 ng DNA. (혈액 및 타액의 경우 참조 가이드 확인).

사용량

상세한 정보는 사양표를 확인하세요.

Nextera DNA Flex 제품군은 이제 Illumina DNA Prep군으로 불립니다. (M) designation은 ~350bp의 삽입 크기를 생성하는 비드-결합 트랜스포솜을 나타냅니다. Illumina DNA/RNA UD Indexes Sets A-D (20091654, 2009165620091658, 20091660)의 구매를 권장해 드립니다. Illumina DNA/RNA UD Indexs Sets A-D (20027213, 2002721420042666, 20042667)는 단종 되었으며, 마지막 주문일은 2025년 1월 30일입니다.

개요

이전 명칭이 Nextera DNA Flex인 Illumina DNA Prep은 인간 전장 유전체 시퀀싱부터 시퀀싱 앰플리콘, 플라스미드 및 미생물 종에 이르기까지 다양한 응용 분야를 용이하게 하는 광범위한 DNA 입력 유형 및 양으로부터 정규화된 시퀀싱 라이브러리 프렙을 준비하기 위한 빠르고 견고하며 유연한 워크플로우를 제공합니다.1

  • 균일한 유전체 범위와 탁월한 데이터 품질 제공 

  • 통합 DNA 추출 프로토콜로 라이브러리 준비 효율성 향상 

  • 총 라이브러리 준비 시간을 약 3.5시간으로 단축하는 빠르고 사용자 친화적인 워크플로우 제공 

신뢰할 수 있는 결과 확보

Illumina DNA Prep 워크플로우는 DNA 투입량 또는 유전체 크기에 관계없이 일관된 삽입 크기, 균일한 적용 범위 및 최적화된 성능을 제공합니다. 비드 기반 기술은 바이어스와 오류 기회를 최소화하여 재현성이 높은 시퀀싱 데이터를 생성합니다. 

유연한 처리량 옵션 이용

Illumina DNA/RNA UD Indexes Sets는 최대 384개의 고유한 이중 인덱스를 제공하여 판독을 정확하게 할당하고 플로우 셀을 효율적으로 사용할 수 있습니다. 

Illumina Advantage 제품 가용성

이 제품은 Illumina Advantage(TG) 제품으로도 이용 가능합니다. Illumina Advantage 대규모 시퀀싱 제품은 로트별 배송 및 검사, 연장된 유통 기한, 더 큰 검사실 효율성을 위한 고급 변경 사항 알림을 특징으로 합니다.


Illumina DNA Prep 제품 라인

광범위한 응용 분야에 사용할 수 있는 빠르고 최적화된 시퀀싱 라이브러리 준비 솔루션을 찾아보세요.


사양


필수 제품

각 Illumina DNA Prep 키트는 시퀀싱에 사용되는 샘플 풀링 수준에 관계없이 프로토콜을 완료하기 위해 인덱스 키트 중 하나가 필요합니다. 당사는 고객이 가능한 한 고유한 이중 인덱싱을 사용하도록 권장합니다.귀하의 애플리케이션에 적합한 인덱싱 옵션을 선택하는 방법에 대해  자세히 알아보십시오

 

인덱스 키트는 Nextera DNA 또는 Nextera XT 인덱스 키트와 호환되지 않습니다. 

 

Flex Lysis Kit는 Illumina DNA Prep의 혈액 DNA 추출 측면을 보완하는 별도의 제품입니다. 

 

Illumina 정제 비드는 Illumina DNA Prep 키트에 포함되어 있으며 별도로 구매할 필요가 없습니다.  

/ 결과

애플리케이션

Illumina DNA Prep은 광범위한 DNA 입력 범위(1~500 ng)를 지원하며, 큰 전체 유전체에서 앰플리콘, 플라스미드 및 미생물 종에 이르는 샘플 시퀀싱을 위한 고품질 라이브러리를 단 약 3.5시간 만에 제공합니다. 

예시 워크플로우


주요 애플리케이션 노트


프로젝트 권장 사항

기기 Recommended number of samples Read length
NextSeq 550 System

1 sample per run (high output; based on 30× coverage of a human genome)

최대 2 × 150 bp

NovaSeq 6000 System

2–10 samples per run  (dual flow cell; based on 30× coverage of a human genome)

최대 2 × 125 bp(빠른 실행) 
최대 2 × 150bp(고출력)


관련 애플리케이션 및 방법

문서

제품 관련 자료

비교하기

Illumina DNA Prep TruSeq DNA PCR-Free TruSeq DNA Nano Nextera XT DNA Library Preparation Kit
Assay 시간 약 3~4시간(DNA 추출부터 정규화된 라이브러리까지) 총 분석 시간 5시간 약 6시간의 총 분석 시간 DNA 추출부터 정규화된 라이브러리까지 약 5.5시간. (라이브러리 준비 시간: 약 90분).
자동화 기능 Liquid handling robots Liquid handling robots Liquid handling robots Liquid handling robots
자동화 상세 정보 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기
설명 다양한 샘플 유형과 DNA 투입량을 수용하여 인간에서 미생물 전장 유전체 염기서열 분석에 이르기까지 광범위한 응용 분야에 액세스할 수 있는 빠르고 유연한 라이브러리 준비 워크플로우.  유전체의 어려운 영역을 통과해 시퀀싱하는 기능을 갖춘 전장 유전체 시퀀싱 연구를 위한 단순한 전체 포함 PCR-free prep입니다. 높은 유전체 커버리지 품질과 편향 감소 효과를 제공하는 저사용량 연구 방법입니다. DNA 투입 요구량이 적은 작은 유전체, PCR 앰플리콘 및 플라스미드에 대한 시퀀싱 라이브러리를 90분 내에 준비한다.
수작업 시간 1~1.5시간 4시간 ~4시간 15분
사용량 작은 게놈(예: 미생물)의 경우 1~500 ng DNA, 또는 큰 게놈(예: 인간)의 경우 100~500 ng DNA. (혈액 및 타액의 경우 참조 가이드 확인). DNA 1 ug genomic DNA 100 ng DNA 1 ng
Instruments MiSeq System, iSeq 100 System, NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System, NextSeq 550Dx in Research Mode, NovaSeq X System, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System MiSeq System, NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System, NovaSeq X System, NextSeq 500 System, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System MiSeq System, NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System, NovaSeq X System, NextSeq 500 System, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System MiSeq System, iSeq 100 System, NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiniSeq System, NextSeq 500 System
작용 기전 Bead-linked transposome 기계적 DNA 절편화 및 어댑터 라이게이션. 워크플로우는 PCR을 사용하지 않고 겔이 없음. 기계적 DNA 절편화 및 어댑터 라이게이션. 워크플로우는 편향 감소 PCR을 사용하고 겔이 없음. 효소적 절편화
방법 Amplicon sequencing, De novo sequencing, Whole-genome sequencing, Shotgun sequencing Genotyping by sequencing, Whole-genome sequencing, Shotgun sequencing Genotyping by sequencing, Whole-genome sequencing, Shotgun sequencing Amplicon sequencing, 16s rRNA sequencing, De novo sequencing, Whole-genome sequencing, Shotgun sequencing
멀티플렉싱 최대 384개의 고유한 듀얼(UD) 조합 및 96개의 조합 듀얼(CD) 조합 싱글 최대 24개, 조합(CD) 듀얼 96개, 고유한 듀얼 24개 및 고유한 듀얼(UD) 조합 96개 싱글 최대 24개, 조합(CD) 듀얼 96개, 고유한 듀얼 24개 및 고유한 듀얼(UD) 조합 96개 최대 384개의 고유하게 인덱싱된 샘플을 함께 풀링 및 시퀀싱할 수 있습니다.
Nucleic acid type DNA DNA DNA DNA
샘플의 종류 세부 사항 FFPE 검체와 함께 사용하도록 검증되지 않음 
특수 샘플의 종류 Blood, Not FFPE-compatible, Saliva Not FFPE-compatible Not FFPE-compatible, Low-input samples Not FFPE-compatible, Low-input samples, Single cells
Species category Drosophila, Any species, Mammalian, Mouse, Yeast, Zebrafish, Human, Rat, Plant, Virus, Nematode, Bacteria Other, Mammalian, Mouse, Human, Rat, Plant Other, Mammalian, Mouse, Human, Rat, Plant Drosophila, Any species, Mammalian, Mouse, Yeast, Zebrafish, Fungal, Human, Rat, Plant, Virus, Nematode, Bacteria
종 세부 사항 모든 종과 호환됨 대부분의 큰 DNA 유전체와 호환됨. 대부분의 큰 DNA 유전체와 호환됨. 모든 종과 호환됨
표적 단편 크기 ~350 bp 350 bp 또는 550 bp 350 bp 또는 550 bp 300 bp~1.5 kb
Technology Sequencing Sequencing Sequencing Sequencing
변이 클래스 Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Loss of heterozygosity (LOH), Somatic variants, Chromosomal abnormalities, Germline variants, Structural variants, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs) Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Loss of heterozygosity (LOH), Somatic variants, Chromosomal abnormalities, Germline variants, Structural variants, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs) Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Loss of heterozygosity (LOH), Somatic variants, Chromosomal abnormalities, Germline variants, Structural variants, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs) Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Structural variants

선택 도구:

그림 자료

Illumina bead-linked transposome chemistry

(A) Bead-linked transposome chemistry는 gDNA의 동시 단편화 및 Illumina 시퀀싱 프라이머의 첨가를 매개합니다. (B) 환원 주기 PCR 증폭은 시퀀싱 준비 DNA 단편을 증폭시키고 인덱스 및 어댑터를 추가합니다. (C) 시퀀싱 준비된 단편을 세척하고 풀링합니다.

Illumina DNA Prep은 가장 빠른 Illumina 워크플로우를 제공합니다

DNA 추출부터 라이브러리 정규화 및 풀링까지의 총 워크플로 시간 비교. Illumina DNA Prep은 가장 적은 수의 단계와 가장 빠른 총 워크플로 시간을 가진 워크플로를 생성합니다. 

커버리지 균일성 향상

(A) Illumina DNA Prep은 TruSeq DNA Nano 키트와 유사한 유전체 전체에 균일한 커버리지를 제공합니다. (B) GC 함량이 매우 높거나 낮은 미생물에 대한 적용범위가 표시됩니다. 개선된 비드 부착 라이브러리 준비 화학으로 인해 Illumina DNA Prep은 Nextera XT보다 더 균일한 커버리지를 보여줍니다.

리소스

DNA 및 RNA 라이브러리 준비를 위해 사용하기 쉽고 빠르며 간단한 솔루션을 제공하도록 설계된 Illumina 기술에 대해 알아보십시오.

Illumina DNA Prep 키트의 소개 프레젠테이션.

비드 부착 라이브러리 준비 화학은 DNA 추출, 단편화, 라이브러리 준비 및 라이브러리 정규화를 통합합니다.

라이브러리 프렙 (2)

Illumina DNA Prep, (M) Tagmentation (24 Samples, IPB)

20060060

24개의 라이브러리를 준비하기 위한 시약이 포함되어 있습니다. Illumina 정제 비드가 포함되어 있습니다. 증균 프로브 패널과 인덱스 어댑터를 별도로 구입하십시오.

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Illumina DNA Prep, (M) Tagmentation (96 Samples, IPB)

20060059

96개의 라이브러리를 준비하기 위한 시약이 포함되어 있습니다. Illumina 정제 비드가 포함되어 있습니다. 증균 프로브 패널과 인덱스 어댑터를 별도로 구입하십시오.

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인덱스 어댑터 (9)

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091654

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)에는 96개 샘플을 라벨링하는 데 충분한 96개의 10 bp 인덱스가 포함되어 있습니다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091656

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)에는 96개 샘플을 라벨링하는 데 충분한 96개의 10 bp 인덱스가 포함되어 있습니다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091658

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)에는 96개 샘플을 라벨링하는 데 충분한 96개의 10 bp 인덱스가 포함되어 있습니다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091660

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)에는 96개 샘플을 라벨링하는 데 충분한 96개의 10 bp 인덱스가 포함되어 있습니다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20027213

96개의 검체 라벨링에 충분한 96, 10 bp 지수를 포함한다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20027214

96개의 검체 라벨링에 충분한 96, 10 bp 지수를 포함한다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20042666

96개의 샘플에 라벨을 부착하기에 충분한 96, 10 bp 인덱스 포함. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20042667

96개의 검체 라벨링에 충분한 96, 10 bp 지수를 포함한다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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Nextera™ DNA CD Indexes (96 Indexes, 96 Samples)

20018708

20개의 인덱스, 8/i500s 및 12/i700 인덱스가 포함되어 96개의 샘플에 라벨을 부착하기에 충분한 96개의 이중 인덱싱 기능을 제공합니다. 색인은 96웰 형식으로 제공됩니다. 라이브러리 준비 및 프로브 패널을 별도로 구입합니다.

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서비스 (1)

Nextera DNA Flex - Customer Site

20022900

유전체 DNA의 정량화 및 품질 관리, 라이브러리 품질 및 수량 확인, 완전한 Nextera DNA Flex 워크플로우 교육.

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액세서리 제품 (6)

Illumina Purification Bead, 100mL

20060057

라이브러리 정리 및 크기 선택을 위한 비드 100ml 컨테이너 1개가 포함되어 있습니다. 라이브러리 준비 및 증균 시약, 프로브 패널 및 색인을 별도로 구입합니다.

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Illumina Purification Bead, 400mL

20060058

라이브러리 정리 및 크기 선택을 위한 비드 100ml 컨테이너 4개가 포함되어 있습니다. 라이브러리 준비 및 증균 시약, 프로브 패널 및 색인을 별도로 구입합니다.

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Flex Lysis Reagent Kit (96 reactions)

20018706

Illumina DNA Prep 및 Illumina DNA Prep with Enrichment로 혈액 검체를 처리하기 위한 시약이 포함되어 있습니다. 라이브러리 준비, 증균, 증균 프로브 패널 및 인덱스 어댑터 시약을 별도로 구입합니다.

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Illumina® Free Adapter Blocking Reagent (12 Reactions)

20024144

이 시약은 라이브러리 준비 중에 인덱스 호핑 수준을 줄이기 위해 사용합니다.

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Illumina® Free Adapter Blocking Reagent (48 Reactions)

20024145

이 시약은 라이브러리 준비 중에 인덱스 호핑 수준을 줄이기 위해 사용합니다.

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NextSeq PhiX Control Kit

FC-110-3002

NextSeq Illumina 시퀀싱 플랫폼을 위한 DNA 제어. 10 nM PhiX 용액 최대 150 bp. 10 µl의 단일 및 페어드 엔드 판독과 호환.

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제품

수량

Unit Price

FAQ

예, Illumina는 혈액과 타액 모두에 대한 특정 추출 프로토콜을 설계했습니다. 프로토콜은 Illumina DNA 준비 참조 가이드 에서 확인할 수 있습니다.

일반적으로 Illumina DNA Prep은 대부분의 자동화된 액체 처리 시스템과 호환되도록 설계되었습니다. 

모든 Illumina 자동화 파트너는 하나 이상의 기존 자동화 플랫폼을 위한 방법을 개발하고 있습니다. 자세한 내용은 개별 파트너에게 문의하십시오. 

GC가 풍부한 영역의 적용 범위는 사용된 열 순환기의 모델, 설정 및 성능에 의해 영향을 받을 수 있습니다. Illumina는 Bio-Rad DNA 엔진 Tetrad 2, Bio-Rad S1000, Bio-Rad C1000 및 MJ Research PTC-225 DNA 엔진 Tetrad 열 순환기를 Illumina DNA Prep과 함께 사용하는 것을 검증했습니다. 다른 열 순환기는 성능이 다를 수 있으며, 이는 게놈 커버리지에 영향을 미칠 수 있다.

예, Illumina DNA Prep의 최소 입력 범위(1–500 ng)는 건조 혈액 스팟(DBS) 카드에서 추출한 DNA를 사용할 수 있게 합니다. 건조된 혈액 스팟 추출을 위한 Illumina 입증 프로토콜은 Nextera DNA Flex 건조 혈액 스팟 프로토콜 가이드 문서에서 확인할 수 있습니다.

/ 결과

NovaSeq X 시리즈 주문

발전된 화학 반응, 광학 및 인포매틱스가 결합되어 뛰어난 속도와 데이터 품질, 뛰어난 처리량과 확장성을 제공합니다.

MiSeq Reagent Kit v3

클러스터 밀도와 판독 길이를 높여 이전 버전에 비해 시퀀싱 품질 점수를 개선하는 최적화된 시약 키트입니다.

TruSight Oncology 500

FFPE 조직의 모든 주요 변이 계열과 유전자 시그니처(TMB, MSI, HRD)를 포함하는 대형 범암 패널로 CGP를 활성화합니다.

Illumina DNA Prep

광범위한 시퀀싱 애플리케이션에 사용하기 위한 매우 정확한 데이터를 생성하는 효율적이고 빠른 통합 라이브러리 프렙 워크플로우입니다.

참고 문헌(References)

1. Bruinsma S, Burgess J, Schlingman D, et al. Bead-Linked Transposomes Enable a Normalization-Free Workflow for NGS Library Preparation. 2018;19:722. BMC Genomics. Published online 2018 Oct 1. doi: 10.1186/s12864-018-5096-9

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