NGS를 이용한 인간 미생물군유전체 분석
인간 마이크로바이옴 및 전사체 분석 소개
인간 마이크로바이옴 분석은 인체와 인체에서 발견되는 미생물 군집에 대한 연구입니다. 인간 마이크로바이옴 프로파일링 연구의 목표는 건강과 질병에서 미생물의 역할을 이해하는 것입니다. 차세대 시퀀싱(NGS)은 배양이 불가능한 미생물을 포함한 전체 미생물 군집의 유전체를 조사할 수 있는 연구에 박차를 가하고 있습니다.
이전에는 인간 마이크로바이옴 샘플을 연구하는 것이 개별 유기체를 성장시키고 분리하는 시간 및 노동 집약적 미생물학 기법에 의존했으며, 그 후 표현형 또는 유전자형 분석을 실시했습니다. 단일 샘플 내 미생물 커뮤니티 프로파일링은 이러한 이전 방법으로는 가능하지 않았습니다.
미생물 전사체학 또는 메타크립토믹스는 복잡한 시료의 유기체 그룹에 의해 인코딩된 발현된 RNA에 대한 주요 인사이트를 제공합니다. 고품질 메타크립토믹스 데이터를 통해 연구자들은 유전자 발현 변화를 정량화하고, 특정 치료에 대한 내성 또는 감수성을 예측하며, 숙주-병원체 면역 상호작용을 이해하고, 질병 진행을 추적할 수 있습니다.
인간 마이크로바이옴 연구를 위한 NGS
차세대 시퀀싱의 출현은 인간 마이크로바이옴 프로젝트와 같은 여러 개의 중요한 협업 프로젝트를 가능하게 했으며, 이는 NGS를 기본 도구로 사용하여 인간 마이크로바이옴에 관한 광범위한 자료를 발표했습니다.
NGS 방법을 통해 과학자들은 배양 없이 복잡한 미생물 군집을 식별하고 분류할 수 있습니다. 이러한 방법은 또한 마이크로바이옴 샘플에서 신규 종의 발견을 가속화하고 독성 및 항미생물 내성 유전자의 검출을 용이하게 할 수 있습니다.
인간 마이크로바이옴 분석을 위한 실험적 NGS 방법은 다음을 포함합니다.
샷건 메타지노믹 시퀀싱
- 주어진 복합 미생물 샘플의 모든 유기체에서 모든 유전자의 포괄적인 샘플링을 가능하게 하는 DNA 시퀀싱 방법.
16S rRNA 시퀀싱
- 주어진 샘플 내에 존재하는 세균을 식별하고 비교하는 데 사용되는 16S 리보솜 RNA 유전자 시퀀싱 방법입니다.
미생물 메타트랜스크립토믹스
- 복잡한 샘플 내의 미생물 그룹에 의해 인코딩된 모든 RNA의 분석.
NGS 워크플로우 파인더
다음 워크플로우에서 추측을 배제하세요. NGS 워크플로우 파인더는 개인화된 솔루션 권장 사항과 리소스를 제공하므로 안심하고 순서를 지정할 수 있습니다.
지금 바로 연구에 적합한 차세대 시퀀싱(NGS) 워크플로우 확인하기마이크로바이옴 분석의 주제
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참고 문헌
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