차세대 시퀀싱(next-generation sequencing, NGS)을 활용하여 미생물 개체군에서 유전자 발현 발견
메타트랜스크립토믹스는 복잡한 미생물 군집에서 발현된 mRNA에 대한 집단 연구입니다.1 미생물 개체군에서 유전자 발현을 연구하기 위해 메타트랜스크립톰 시퀀싱을 사용하여 연구자들은 미생물이 특정 시간에 주어진 환경에 어떻게 반응하는지에 대한 중요한 인사이트를 획득할 수 있습니다. 마이크로바이옴에서 RNA 시퀀싱을 하면 어떤 미생물이 존재하는지 뿐만 아니라 그 기능적 활성도 밝혀낼 수 있습니다.
차세대 시퀀싱(NGS) 기술을 기반으로 하는 메타트랜스크립토믹스는 농업, 생명공학, 의학 등의 다양한 애플리케이션에 걸친 연구 분야입니다.1-4 복잡한 미생물 군집의 행동 및 기능에 대한 데이터를 제공하는 것 외에도 메타트랜스크립토믹 시퀀싱은 군집의 환경 또는 숙주에 대한 귀중한 정보도 제공할 수 있습니다.
아직 조절 체계가 이해되지 않은 방대한 수(수백만)의 유전자를 감안할 때, 메타트랜스크립토믹스는 군집 수준에서 자연 환경으로부터 중요한 생물학적 인사이트를 만들어 낼 수 있는 준비가 되어 있습니다.
다음 워크플로우에서 추측을 배제하세요. NGS 워크플로우 파인더는 개인화된 솔루션 권장 사항과 리소스를 제공하므로 안심하고 시퀀싱할 수 있습니다.
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Illumina Stranded Total RNA Prep with Ligation, Ribo-Zero Plus Microbiome
코딩 및 비코딩 전사체 전반에 걸쳐 명확하고 포괄적인 분석을 위한 간소화된 RNA-Seq 솔루션으로 탁월한 연구 유연성 제공.
입증된 NGS 기술을 조정 가능한 데이터 아웃풋과 결합하여 다양한 애플리케이션 전반에 걸쳐 시퀀싱 및 어레이 기능을 지원해 보세요.
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프로덕션 규모에서 데이터 집약적인 애플리케이션을 수행하기 위한 탁월한 처리량과 정확성을 달성해 보세요.
BaseSpace Microbiome Metatranscriptomics
메타지노믹 샘플에 대해 분류학 및 경로 인리치먼트 분석을 수행해 보세요.
라이브러리 준비에 대한 세부 사항, 시퀀싱 및 Illumina Ribo-Zero Plus Microbiome을 사용한 메타트랜스크립토믹 분석을 위한 직관적인 소프트웨어 사용을 통해 복잡한 미생물 샘플에 대한 RNA 시퀀싱 워크플로우를 최적화하는 방법을 알아보세요. 이 Application Note를 다운로드하여 전사체의 고부가 가치 부분에 초점을 맞추어 건강 및 질병에서 마이크로바이옴의 역할을 이해해 보세요.
메타지노믹스는 미생물 개체군 샘플 내에서 발견되는 모든 유전자에 대한 연구입니다.5 이와는 대조적으로, 메타트랜스크립토믹스는 발현된 유전자 또는 개체군의 전사체에 대한 연구입니다.1
16S rRNA 시퀀싱은 원핵생물(즉, 세균 및 고충)에서만 발견되는 16S rRNA 유전자를 표적으로 하는 특이적 방법입니다.6 메타트랜스크립토믹스 또는 메타지노믹스와 달리, 16S rRNA 시퀀싱은 바이러스 및 진균과 같은 다른 미생물을 검출할 수 없습니다. 이 방법은 숙주 DNA 오염에 대해 그다지 민감하지 않지만, 메타트랜스크립토믹 또는 메타지노믹 시퀀싱 방법과 비교하여 기능적 정보를 검출하고 균주/변이체를 식별하는 것으로 제한됩니다.
RNA 추출은 5 이상의 RNA 무결성 번호(RIN)를 제공하는 상업적으로 이용 가능한 마이크로바이옴 RNA 추출 키트를 사용하여 달성할 수 있습니다.
BaseSpace Microbiome Metatranscriptomics 앱은 Ribo-Zero Plus Microbiome Depletion Kit에 포함되어 있으며 포괄적인 메타트랜스크립토믹 분석을 수행하기 위한 바이오인포매틱스 도구를 제공합니다.
전장 유전체 시퀀싱과 전사체학이 연구자들에게 약제 발견과 개발을 개선하기 위한 데이터를 제공하는 방법을 읽어 보세요.
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참고 문헌