단백체학

단백체학은 세포 표현형과 기능을 이해할 수 있게 해주며, 유전체, 후성유전체, 전사체를 포함한 기타 모든 세포 조절 수준에서의 연구 성과를 대표합니다. 단백체학을 통해 과학자들은 질병 기전 및 목표 신약 개발과 같은 중요한 연구 영역에서 바이오마커에 대한 실행 가능한 인사이트를 얻을 수 있습니다.

단백체학은 다른 오믹 데이터를 검증하는 데 필요한 인사이트를 제공하여 생물학에 대한 이해를 심화시킴으로써 멀티오믹 응용 분야의 가치를 크게 높여줄 수 있습니다. 또한 단백체학은 바이오마커를 식별하는 동시에 돌연변이 및 단백질 발현의 변화와 관련된 중요한 데이터를 질병의 잠재적 동인으로 파악하는 데 도움을 줄 수 있다. 과학자들은 Illumina Protein Prep과 같은 제품으로 구성된 현재의 Illumina NGS 시스템을 사용하여 데이터 분석을 포함한 여러 생물학적 프로세스를 단일 플랫폼에서 포괄적으로 연구할 수 있습니다.

질량 분석법은 단백체학의 필수적인 연구 수단으로, 높은 특이성과 동시에 다양한 유형의 샘플을 정량적으로 분석할 수 있다는 강점을 지니고 있습니다. 또한, 이 방법으로 단일 지점 돌연변이 및 번역 후 변형에 관한 정성적 정보를 얻을 수도 있습니다. 그러나 해당 워크플로우에 수작업이 많이 필요하며 NGS 기반 단백체학 기술에 비해 처리량이 낮습니다. Illumina Protein Prep은 96개 샘플에서 9000개 이상의 단백질을 한 번에 분석할 수 있을 정도로 높은 확장성 및 고처리량을 비롯한 뚜렷한 이점을 제공합니다. 이 시스템은 완전히 자동화된 워크플로우를 통해 발견 및 스크리닝 연구를 모두 지원하며, 워크플로우에 질량 분석법이라는 골드 스탠다드 방법을 접목하여 결과를 검증하고 확인할 수 있습니다. 전체적으로, NGS 기반 단백질학은 바이오마커 발견을 위한 연구에 소요되는 비용을 절감하면서 전체 워크플로우의 효율성을 높여줄 수 있습니다.

lllumina Protein Prep은 SomaScan assay를 사용하여 단백질 에피토프를 특정 SOMAmer 시약 기반 DNA 신호로 변환합니다. 이어서, 일련의 비드 포획 및 워시 단계를 통해 상대적 단백질 농도를 SOMAmer 시약 풍부도로 변환합니다. 하이브리드화(hybridization) 기반 방법을 통해 SOMAmer 시약이 바코드화된 시퀀싱 라이브러리로 변환됩니다. 자성 비드에 포획하기 전에 프로브 페어가 SOMAmer 시약에 하이브리드화됩니다. 각각의 SOMAmer 시약에는 하나의 특수한 프로브 페어가 있는데, 프로브 페어마다 특정 SOMAmer 시약에 상응하는 바코드를 가지고 있습니다. 결합되지 않은 프로브는 워시되어 바코드가 있는 프로브의 풍부도로 변환됩니다. 시퀀싱에 필요한 샘플 인덱스의 부착을 위해 인덱스 PCR 프라이머가 추가된 후 증폭되면, 개별적으로 바코드화 및 인덱싱된 라이브러리가 생성됩니다. 이러한 인덱싱된 바코드 라이브러리는 시퀀싱되며 분석 결과는 샘플의 단백질 풍부도에 대한 상대적인 정량적 측정값입니다. 전체 Illumina Protein Prep assay 단계는 Illumina Protein Prep Automation System이라는 하나의 플랫폼에서 자동화됩니다. 자세한 내용을 보려면 데이터 시트를 다운로드하세요.

Illumina Protein Prep은 NovaSeq 6000, NovaSeq X 및 NovaSeq X Plus 시스템과 호환됩니다.