Infinium MethylationEPIC v2.0 Kit

전후성유전체 연관성 연구를 위한 CpG 섬(island), 유전자, 인핸서(enhancer) 등 폭넓은 범위에 적용되는 강력한 메틸레이션 프로파일링 마이크로어레이입니다.

주당 > 1000개 샘플(8개 샘플 BeadChip의 경우 Tecan당)

샘플 처리량

어레이당 8개 샘플

샘플 수

>  935K

표지자의 수

상세한 정보는 사양표를 확인하세요.

개요

Infinium MethylationEPIC v2.0 키트는 인간 메틸롬의 가장 생물학적으로 유의한 영역에서 > 935K CpG 부위를 표적으로 하는 유전체 전체 메틸화 스크리닝 도구이다.

  • 판독 깊이와 무관하게 정확하고 정밀한 메틸레이션 측정을 통해 단일 뉴클레오티드 분해능에서 CpG의 정량적 조사

  • GenomeStudio 메틸레이션 모듈을 사용한 1차 분석 및 품질 관리

  • EPIC v1.0의 전문가 평가에 따라 업데이트된 내용

비용 효율적인 스크리닝

상대적으로 낮은 샘플당 총 비용과 확장성을 통해 검사실은 대규모 코호트를 효율적으로 선별할 수 있습니다.

후생유전학 연구자들의 신뢰

Illumina methylation BeadChips는 > 10년의 획기적인 연구를 주도했으며, 현재까지 대부분의 출판된 전장 전장 연관성 연구(EWAS)는 MethylationEPIC 또는 그 이전 버전에서 완료되었다. Gene Expression Omnibus (GEO) 또는 The Cancer Genome Atlas (TCGA)와 같은 데이터 저장소에서 메틸레이션 데이터를 활용합니다.

여러 샘플 유형과 호환

이 assay는 FFPE와 호환되므로 종양의 대규모 생체시료저장소에서 연구를 완료할 수 있습니다. 또한 신선/냉동 조직, 전혈, 구강 세포, 세포유리 DNA, 타액 및 기타 샘플 유형과도 호환됩니다.


사양


필수 제품

한 번에 실행하는 샘플 수와 일치하는 키트를 구매해야 합니다. 각 키트는 단일 배치로 처리되며 여러 실험에 걸쳐 분할되도록 설계되지 않았습니다. 처리량이 적은 배치를 여러 개 처리하는 경우 여러 개의 소형 키트를 주문해 보세요. 키트에는 별도로 구매할 수 있는 선택적 제품인 중아황산염 전환 키트를 제외하고, 메틸화 스크리닝 수행에 필요한 모든 시약이 들어 있습니다. 

/ 결과

애플리케이션

Infinium MethylationEPIC v2.0 BeadChip은 강력한 마이크로어레이로서 암, 유전 질환, 노화 및 분자 역학의 연구 응용 분야에 사용되는 메틸레이션 기반 생체표지자를 발견할 수 있습니다.

예시 워크플로우

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Infinium MethylationEPIC v2.0 Kit



관련 애플리케이션 및 방법

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Infinium MethylationEPIC v2.0 Kit Infinium Custom Methylation Kit Infinium Mouse Methylation BeadChip
Assay type Infinium HD Methylation Infinium HD Methylation
자동화 기능 Automated array loader Automated array loader Automated array loader
설명 Infinium MethylationEPIC v2.0 BeadChip은 전문적으로 선택된 향상된 기능성 콘텐츠를 갖춘 유전체(genome) 전체의 메틸레이션 스크리닝 도구입니다. 키트는 iScan 또는 NextSeq 550 Systems에서 처리되며, 샘플 풀링 및 인덱싱이 필요하지 않은 간단하고 사용이 용이한 워크플로우를 따릅니다.
사용량 DNA 250 ng DNA >250 ng
Instruments NextSeq 550 System, NextSeq 550Dx in Research Mode, iScan System iScan System iScan System
방법 Methylation array Methylation array Methylation array
Nucleic acid type DNA DNA DNA
표지자의 수 >  935K 고정 표지자: > 285k 개
샘플 수 어레이당 8개 샘플 어레이당 샘플 12개
샘플 처리량 주당 > 1000개 샘플(8개 샘플 BeadChip의 경우 Tecan당) 주당 > 1000개 샘플(8개 샘플 BeadChip의 경우 Tecan당)
샘플의 종류 세부 사항 구강 세포 및 신선/냉동 조직과도 호환 신선/냉동 조직과 함께 사용할 수 있습니다. DAC를 포함한 외인성 화학물질에 의해 유도된 DNA 메틸화의 변화를 분석한다.
특수 샘플의 종류 Blood, FFPE tissue, Cell-free DNA, Saliva Blood, Cell-free DNA, Saliva Blood, FFPE tissue, Saliva
Species category Human Mouse, Human Mouse
Technology Microarray Microarray Microarray
변이 클래스 Differentially methylated cytosines Differentially methylated cytosines Differentially methylated cytosines

선택 도구:

그림 자료

Infinium MethylationEPIC v2.0 coverage of genomic regions

유전체 영역의 인피늄 메틸화EPIC v2.0 커버리지

새롭고 향상된 콘텐츠는 향후 후생유전학적 발견을 가능하게 합니다.

Dense coverage of CpG islands

CpG 섬의 밀집 커버리지

Infinium MethylationEPIC v1.0 BeadChip에서 충분히 다루지 않은 CpG 섬과 엑손은 추가 프로브로 철저히 덮여 있습니다.

Robust data with FFPE samples

FFPE 샘플에 대한 강력한 데이터

FFPE 조직 샘플은 Infinium Methylation HD Assay의 수정된 버전에서 강력한 성능을 보여줍니다. 소중한 샘플과 최적의 샘플 무결성을 위해 Infinium FFPE QC 및 DNA 복원 키트를 권장합니다.

High backwards compatibility with previous BeadChips

이전 BeadChips와 높은 역호환성

Infinium MethylationEPIC v2.0 BeadChip은 Infinium MethylationEPIC v1.0 및 HumanMethylation450 BeadChip의 기존 CpG 백본을 기반으로 합니다.

EPIC v2.0 키트 (4)

Inf MethylationEPIC V2.0 Kit (8 Spl)

20087706

1개의 8-샘플 BeadChip과 8개의 DNA 샘플을 증폭, 파편화, 혼성화, 라벨링 및 검출하기 위한 시약이 포함되어 있습니다. 입력에 250 ng DNA가 필요합니다. 각 키트는 단일 배치로 처리됩니다. 중아황산염 전환 키트를 별도로 구입하십시오.

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Inf MethylationEPIC V2.0 Kit (16 Spl)

20087707

16개의 DNA 샘플을 증폭, 파편화, 혼성화, 라벨링 및 검출하기 위한 2개의 8-샘플 BeadChip 및 시약이 포함되어 있습니다. 입력에 250 ng DNA가 필요합니다. 각 키트는 단일 배치로 처리됩니다. 중아황산염 전환 키트를 별도로 구입하십시오.

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Inf MethylationEPIC V2.0 Kit (32 Spl)

20087708

4개의 8-샘플 BeadChip 및 32개의 DNA 샘플을 증폭, 파편화, 혼성화, 라벨링 및 검출하기 위한 시약이 포함되어 있습니다. 입력에 250 ng DNA가 필요합니다. 각 키트는 단일 배치로 처리됩니다. 중아황산염 전환 키트를 별도로 구입하십시오.

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Inf MethylationEPIC V2.0 Kit (96 Spl)

20087709

12개의 8-샘플 BeadChip 및 96개의 DNA 샘플을 증폭, 파편화, 혼성화, 라벨링 및 검출하기 위한 시약이 포함되어 있습니다. 입력에 250 ng DNA가 필요합니다. 각 키트는 단일 배치로 처리됩니다. 중아황산염 전환 키트를 별도로 구입하십시오.

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EPIC v2.0 세미커스텀 키트 (3)

Inf MethylationEPIC-8+ v2.0 Kit (16 Spl)

20097750

EPIC v2 위에 맞춤형으로 선발된 3,000~10,000개의 시도된 비드형이 포함된 Semi-custom EPIC v2. 키트에는 16개의 검체를 처리하기 위한 시약이 들어 있는 2개의 비드칩이 들어 있습니다.

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Inf MethylationEPIC-8+ v2.0 Kit (32 Spl)

20097751

EPIC v2 위에 맞춤형으로 선발된 3,000~10,000개의 시도된 비드형이 포함된 Semi-custom EPIC v2. 키트에는 32개의 샘플을 처리하기 위한 시약과 함께 BeadChip 4개가 포함되어 있습니다.

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Inf MethylationEPIC-8+ v2.0 Kit (96 Spl)

20097752

EPIC v2 위에 맞춤형으로 선발된 3,000~10,000개의 시도된 비드형이 포함된 Semi-custom EPIC v2. 키트에는 96개의 샘플을 처리하기 위한 시약과 함께 BeadChip 12개가 포함되어 있습니다.

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서비스 (1)

Infinium® Assay: An Introduction – Customer Site

20015273

사용자가 Infinium 프로토콜의 필수 단계를 숙지할 수 있도록 3일간의 고객 현장 실습 지침 제공. 이 과정은 샘플 및 BeadChip 준비, iScan 시스템을 사용한 샘플 스캐닝, 배열 분석 소프트웨어를 사용한 일차 데이터 평가 및 분석에 대한 실습 교육을 제공합니다.

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FAQ

Infinium Methylation Assay는 강력한 Infinium 화학을 활용하여 바이설파이트 전환 유전체 DNA의 고도로 멀티플렉싱된 유전형 분석을 기반으로 CpG 섬에서 사이토신 메틸레이션을 검출합니다. 정량적 어레이 기반 메틸화 측정에 대해 자세히 알아보십시오.

이 키트는 단일 CpG 부위 수준에서 정량적 메틸화 측정을 제공하는 마이크로어레이 기술인 Illumina 메틸화 Assay를 사용하여 정상 세포와 병든 세포에서 DNA 메틸화의 생물학적 역할을 검사하는 연구를 강화합니다.  Illumina 메틸화 분석에 대해 자세히 알아보십시오.

Infinium MethylationEPIC v2.0 BeadChip 키트에는 ATAC-Seq 및 ChIP-seq 실험에 의해 식별된 원발성 종양과 연관된 알려진 인핸서(enhancer), 수퍼 인핸서(enhancer), CTCF 결합 부위 및 크로마틴의 개방 영역을 표적으로 하는 186K의 새로운 프로브가 포함되어 있습니다. Infinium MethylationEPIC v2.0 데이터 시트에서 추가 개선 사항에 대해 알아보십시오.

GenomeStudio 메틸레이션 모듈은 베타 값을 추출하고 Infinium MethylationEPIC 어레이 데이터에 대한 클러스터링 및 표준화를 제공합니다. 또한 Bioconductor에는 chAMP 및 SeSAMe와 같이 향상된 표준화 및 시각화 옵션을 제공하는 많은 프리웨어 애플리케이션이 있습니다. Illumina는 이러한 프리웨어 솔루션에 대한 기술 지원을 직접 제공하지 않습니다. 자세한 메틸화 어레이 데이터 분석 팁을 참조하십시오.

Zymo EZ DNA Methylation Lightning 키트는 Infinium 워크플로우에 권장되는 중아황산염 변환 키트입니다. 제3자 중아황산염 전환 키트는 별도로 구매해야 합니다. Infinium Methylation BeadChips용 검증된 중아황산염 전환 키트에 대해 자세히 알아보십시오.

결과 파일은 JPEG 파일과 함께 평균 약 2.75Gb이며, 이는 기본 설정입니다.

이 스캔은 BeadChip당 약 18~37분이 소요됩니다.

예, Infinium MethylationEPIC v1.0 및 HumanMethylation450 BeadChip 키트는 단종되었습니다.  Infinium MethylationEPIC v2.0 키트는 신뢰할 수 있는 동일한 Infinium 화학 기초를 기반으로 하며, 전문가 선택에 따라 향상된 콘텐츠를 제공하며, 두 키트 모두에 대한 권장 교체품입니다. 

/ 결과

NovaSeq X 시리즈 주문

발전된 화학 반응, 광학 및 인포매틱스가 결합되어 뛰어난 속도와 데이터 품질, 뛰어난 처리량과 확장성을 제공합니다.

MiSeq Reagent Kit v3

클러스터 밀도와 판독 길이를 높여 이전 버전에 비해 시퀀싱 품질 점수를 개선하는 최적화된 시약 키트입니다.

TruSight Oncology 500

FFPE 조직의 모든 주요 변이 계열과 유전자 시그니처(TMB, MSI, HRD)를 포함하는 대형 범암 패널로 CGP를 활성화합니다.

Illumina DNA Prep

광범위한 시퀀싱 애플리케이션에 사용하기 위한 매우 정확한 데이터를 생성하는 효율적이고 빠른 통합 라이브러리 프렙 워크플로우입니다.

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