NovaSeq X 시리즈 주문
발전된 화학 반응, 광학 및 인포매틱스가 결합되어 뛰어난 속도와 데이터 품질, 뛰어난 처리량과 확장성을 제공합니다.
Infinium Mouse Methylation BeadChip Kit는 전문가가 선택한 포괄적인 커버리지(coverage)와 높은 샘플 처리량의 고유한 조합을 제공합니다.
Infinium Mouse Methylation BeadChip
다양한 쥐 균주의 고해상도 후성유전학 분석을 위해 메틸롬 전반에서 > 285,000개 이상의 마커를 제공 합니다.
주당 > 1000개 샘플(8개 샘플 BeadChip의 경우 Tecan당)
샘플 처리량
어레이당 샘플 12개
샘플 수
고정 표지자: > 285k 개
표지자의 수
개요
유전자 영역 전반에 걸친 포괄적인 커버리지
Infinium Mouse Methylation BeadChip은 CpG 섬(island), 번역 시작 부위, 인핸서(enhancer), 각인된 유전자좌 및 기타 영역에 대한 균형 잡힌 커버리지를 제공합니다. Infinium HD chemistry를 통해 종종 메틸화된 DNA 캡처 방법과 관련된 편향 제한과 무관하게 콘텐츠를 선택할 수 있습니다.
높은 Assay 재현성
Infinium Mouse Methylation BeadChip은 기술적 복제에 대해 > 98%의 재현성을 달성하며 전장 유전체 중아황산염 시퀀싱 데이터와 높은 상관관계를 보여줍니다.
광범위한 애플리케이션
전장전위 연관성 연구, 이종이식 실험, 전임상 연구 등을 가능하게 합니다.
사양
| Assay type | Infinium HD Methylation |
|---|---|
| 자동화 기능 | Automated array loader |
| 사용량 | DNA >250 ng |
| Instruments | iScan System |
| 방법 | Methylation array |
| Nucleic acid type | DNA |
| 표지자의 수 | 고정 표지자: > 285k 개 |
| 샘플 수 | 어레이당 샘플 12개 |
| 샘플 처리량 | 주당 > 1000개 샘플(8개 샘플 BeadChip의 경우 Tecan당) |
| 샘플의 종류 세부 사항 | 신선/냉동 조직과 함께 사용할 수 있습니다. DAC를 포함한 외인성 화학물질에 의해 유도된 DNA 메틸화의 변화를 분석한다. |
| 특수 샘플의 종류 | Blood, FFPE tissue, Saliva |
| Species category | Mouse |
| Technology | Microarray |
| 변이 클래스 | Differentially methylated cytosines |
필수 제품
필요에 맞는 샘플 처리량을 제공하는 Infinium 마우스 메틸화 비드칩 키트 구성을 선택하십시오.
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결과
애플리케이션
Infinium Mouse Methylation BeadChip은 전후성유전체 연관성 연구, 전임상 연구, 이종이식 연구 등을 포함한 다양한 영역의 쥐 후성유전학적 분석 연구를 지원합니다.
예시 워크플로우
관련 애플리케이션 및 방법
Genome-wide methylation profiling studies with microarray and NGS technologies can provide novel insights into the functional impact of methylation.
Illumina는 후성유전학적 분석을 위한 솔루션을 제공합니다. Illumina의 도구를 사용하여 후성유전학적 변형과 유전자 조절에 미치는 영향에 대해 알아보세요.
Learn how to profile gene expression changes for a deeper understanding of biology.
주요 애플리케이션 노트
문서
제품 관련 자료
지원 문서
그림 자료
Infinium I 및 Infinium II assay 설계를 사용한 광범위한 커버리지
어레이는 Infinium I 및 Infinium II assay를 모두 사용합니다. Infinium I assay 설계는 CpG 유전자좌당 2개의 비드 유형을 사용하며, 메틸화 및 비메틸화 상태에 대해 각각 1개씩 사용합니다. Infinium II 설계는 1가지 비드 유형을 사용하며, 혼성화 후 단일 염기 연장 단계에서 메틸화 상태를 결정합니다.
Illumina GenomeStudio 소프트웨어를 사용한 통합 데이터 분석
GenomeStudio 소프트웨어는 모든 플랫폼에서 DNA 메틸레이션 분석을 지원합니다. 데이터는 히트맵과 같은 직관적인 그래픽으로 표시됩니다.
비교하기
| Infinium Mouse Methylation BeadChip | Infinium MethylationEPIC v2.0 Kit | |
|---|---|---|
| Assay type | Infinium HD Methylation | Infinium HD Methylation |
| 자동화 기능 | Automated array loader | Automated array loader |
| 사용량 | DNA >250 ng | DNA 250 ng |
| Instruments | iScan System | NextSeq 550 System, NextSeq 550Dx in Research Mode, iScan System |
| 방법 | Methylation array | Methylation array |
| Nucleic acid type | DNA | DNA |
| 표지자의 수 | 고정 표지자: > 285k 개 | > 935K |
| 샘플 수 | 어레이당 샘플 12개 | 어레이당 8개 샘플 |
| 샘플 처리량 | 주당 > 1000개 샘플(8개 샘플 BeadChip의 경우 Tecan당) | 주당 > 1000개 샘플(8개 샘플 BeadChip의 경우 Tecan당) |
| 샘플의 종류 세부 사항 | 신선/냉동 조직과 함께 사용할 수 있습니다. DAC를 포함한 외인성 화학물질에 의해 유도된 DNA 메틸화의 변화를 분석한다. | 구강 세포 및 신선/냉동 조직과도 호환 |
| 특수 샘플의 종류 | Blood, FFPE tissue, Saliva | Blood, FFPE tissue, Cell-free DNA, Saliva |
| Species category | Mouse | Human |
| Technology | Microarray | Microarray |
| 변이 클래스 | Differentially methylated cytosines | Differentially methylated cytosines |
선택 도구:
Library Prep and Array Kit Selector
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리소스
Infinium 마우스 메틸화 비드에 대해 알아야 할 10가지 사항Chip
Wanding Zhou 박사가 생쥐 연구자를 위해 이 강력한 도구의 개요를 제시합니다.
Experts discuss their strategies for analyzing Illumina methylation array data.
Infinium Mouse Methylation BeadChip Kit (24 samples)
20041558
2개의 12-샘플 BeadChip과 24개의 DNA 샘플을 증폭, 조각화, 혼성화, 라벨링 및 검출하기 위한 시약이 포함되어 있습니다. 입력에 ≥ 250 ng DNA 필요. 각 키트는 단일 배치로 처리됩니다.
List Price:
Discounts:
Infinium Mouse Methylation BeadChip Kit (48 samples)
20041559
4개의 12-샘플 BeadChip 및 48개의 DNA 샘플을 증폭, 파편화, 혼성화, 라벨링 및 검출하기 위한 시약이 포함되어 있습니다. 입력에 ≥ 250 ng DNA 필요. 각 키트는 단일 배치로 처리됩니다.
List Price:
Discounts:
Infinium Mouse Methylation BeadChip Kit (96 samples)
20041560
8개의 12-샘플 BeadChip과 96개의 DNA 샘플을 증폭, 조각화, 혼성화, 라벨링 및 검출하기 위한 시약이 포함되어 있습니다. 입력에 ≥ 250 ng DNA 필요. 각 키트는 단일 배치로 처리됩니다.
List Price:
Discounts:
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요약
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FAQ
표준 Infinium 메틸레이션 프로토콜을 사용하면 샘플당 최소 250 ng의 사용량에서 고품질의 손상되지 않은 genomic DNA를 가정할 때 어레이(array)에서 96% 이상의 부위를 GenomeStudio 메틸레이션 모듈 소프트웨어로 검출해야 합니다.
GenomeStudio 메틸레이션 모듈은 베타 값을 추출하고 Infinium Mouse Methylation BeadChip 데이터에 대한 클러스터링을 제공합니다. GenomeStudio는 현재 Mouse Methylation BeadChip을 이용한 표준화 제어를 지원하지 않습니다. 또한 BeadArray Controls Reporter 소프트웨어 도구는 현재 지원되지 않습니다.
Bioconductor에는 SeSAMe와 같이 향상된 표준화 및 시각화 옵션을 제공하는 많은 프리웨어 애플리케이션이 있습니다. Illumina는 이러한 프리웨어 솔루션에 대한 지원을 직접 제공하지 않습니다.
BeadChip에는 SNP가 포함되어 있으므로 검사자가 추가 품질 관리 수준으로 샘플의 DNA 지문을 생성할 수 있습니다. 구체적으로 Mouse Methylation BeadChip의 경우, 분석 중인 DNA의 균주 기원을 식별하는 데 도움이 되는 SNP 프로브가 포함됩니다. 자세한 내용은 Infinium HD Methylation Assay 참조 가이드를 참조하세요. BeadChip의 SNP assay는 assay 가이드에 언급되어 있지 않으며 GenomeStudio 메틸레이션 모듈에 간략하게만 설명되어 있습니다.
Illumina는 5-hMc용 어레이를 검증하지 않았습니다. 그러나 출판물에서는 5-hMc 분석을 위해 Infinium HumanMethylation450K 및 MethylationEPIC BeadChip을 사용했으며, 이 프로토콜이 Infinium Mouse Methylation BeadChip에 적용될 가능성이 있습니다.
자세한 내용은 다음을 참조하세요. Nazor KL, Boland MJ, Bibikova M, et al. Application of a low cost array-based technique—TAB-Array—for quantifying and mapping both 5mC and 5hmC at single base resolution in human pluripotent stem cells. Genomics. 2014;104(5):358-367. doi: 10.1016/j.ygeno.2014.08.014
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결과
MiSeq Reagent Kit v3
클러스터 밀도와 판독 길이를 높여 이전 버전에 비해 시퀀싱 품질 점수를 개선하는 최적화된 시약 키트입니다.
TruSight Oncology 500
FFPE 조직의 모든 주요 변이 계열과 유전자 시그니처(TMB, MSI, HRD)를 포함하는 대형 범암 패널로 CGP를 활성화합니다.
Illumina DNA Prep
광범위한 시퀀싱 애플리케이션에 사용하기 위한 매우 정확한 데이터를 생성하는 효율적이고 빠른 통합 라이브러리 프렙 워크플로우입니다.
Infinium MethylationEPIC v2.0 Kit
전후성유전체 연관성 연구를 위한 CpG 섬(island), 유전자, 인핸서(enhancer) 등 폭넓은 범위에 적용되는 강력한 메틸레이션 프로파일링 마이크로어레이입니다.
Infinium FFPE QC and DNA Restoration Kit
Infinium 어레이 기반 assay에 사용하기 위해 샘플 품질을 평가하고 분해된 FFPE DNA 샘플을 복구합니다.
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