Illumina DNA Prep with Enrichment

광범위한 표적 염기서열 분석 애플리케이션을 위한 염기서열 분석용 DNA 라이브러리 프렙을 제공하는 빠른 통합 워크플로우입니다.

~6.5시간

Assay 시간

~2시간

수작업 시간

고품질 genomic DNA 10~1,000 ng, FFPE DNA 50~1,000 ng. (혈액 및 타액의 경우 참조 가이드 확인).

사용량

상세한 정보는 사양표를 확인하세요.

개요

이전에 Nextera Flex for Enrichment로 알려진 Illumina DNA Prep with Enrichment는 Illumina 라이브러리 프렙 포트폴리오에서 DNA를 위한 가장 빠르고 가장 유연한 표적 시퀀싱 솔루션입니다.

  • 단 6.5시간 만에 완전한 라이브러리 준비, 농축 및 농축 후 증폭

  • 혈액 및 타액에 대한 통합 프로토콜로 라이브러리 준비 효율성 향상

  • 매우 균일한 삽입 크기로 일관된 라이브러리 수율 확보

빠르고 사용자 친화적인 워크플로우

내장된 정량화 및 라이브러리 정규화를 통해 비드 온-비드 태그화 화학과 간소화된 단일 하이브리드화 프로토콜이 결합되어 작업 시간을 약 2시간으로 단축합니다.

샘플 입력 유연성

혈액, 타액, 유전체 DNA 및 포르말린 고정 파라핀 포매(FFPE) 조직을 포함한 광범위한 DNA 투입물 및 검체 유형과 호환됩니다.

최적화된 성능

비드 태그 부착은 바이어스와 오류 기회를 최소화하여 모든 Illumina 시퀀싱 시스템에서 재현성이 뛰어난 데이터를 생성합니다.


Illumina DNA Prep 제품 라인

다양한 응용 분야에 사용할 수 있는 빠르고 최적화된 시퀀싱 라이브러리 준비 솔루션을 찾으십시오.


사양


필수 제품

Illumina DNA 준비 및 농축 키트는 Illumina DNA/RNA UD 인덱스 세트를 사용해야 합니다. 이중 인덱싱이 권장됩니다. 

패널과 프로브는 옵션이며 별도로 주문합니다.

Flex Lysis Kit는 혈액 DNA 추출을 보완합니다.

Infinium FFPE QC 키트는 FFPE 검체의 적격성을 평가하기 위해 필요하다.

Infinium MIDI 히트블록 인서트는 SciGene Hybex 마이크로히팅 시스템을 사용할 때 필요합니다. 

Illumina 프리 어댑터 차단 시약(옵션)은 인덱스 호핑 레벨을 줄이는 데 사용됩니다.

Illumina 정제 비드는 비드:샘플 비율에 기초하여 DNA 정제 및/또는 DNA 단편의 크기 선택에 사용된다.

/ 결과

애플리케이션

Illumina DNA Prep with Enrichment는 다양한 DNA 입력 및 샘플 유형으로부터 다양하고 간단하며 빠른 라이브러리 준비 및 증균을 결합하여 맞춤형 패널, 고정 패널 및 전엑솜 패널을 포함하는 광범위한 표적 증균 응용 프로그램을 지원합니다.

워크플로우 예시



프로젝트 권장 사항

기기 Recommended number of samples Read length
iSeq 100 System

TruSight Cancer: 4 samples per run (based on 280× mean targeted coverage; 99% target coverage at 20×)
TruSight Cardio: 4 samples per run (based on 170× mean targeted coverage; 100% target coverage at 20×)

2 x 100 bp

2 x 100 bp

MiniSeq System

TruSight Cancer (samples per run): mid output: 8, high output: 25 (based on 280× mean targeted coverage; 99% target coverage at 20×)
TruSight Cardio (samples per run): mid output: 8, high output: 25 (based on 170× mean targeted coverage; 100% target coverage at 20×)

2 x 100 bp

2 x 100 bp

MiSeq System

TruSight Cancer (samples per run): v2 reagents: 15, v3 reagents: 25 (based on 280× mean targeted coverage; 99% target coverage at 20×)
TruSight Cardio (samples per run): v2 reagents: 15, v3 reagents: 25 (based on 170× mean targeted coverage; 100% target coverage at 20×)
TruSight One (samples per run): v2 reagents: 1, v3 reagents: 3 (based on 120× mean targeted coverage; 95% target coverage at 20×)

2 x 100 bp

2 x 100 bp

2 x 100 bp(최대 2 x 150 bp 가능)

NextSeq 550 System

Exome (samples per run): mid output: 5, high output: 16 (based on 50× mean targeted coverage; 90% target coverage at 20×)

TruSight One (samples per run): mid output: 12, high output: 36 (based on 120× mean targeted coverage; 95% target coverage at 20×)
TruSight One Expanded (samples per run): mid output: 7, high output: 24 (based on 130× mean targeted coverage; 97% target coverage at 20×)

2 x 100 bp
2 x 100 bp(최대 2 x 150 bp 가능)
2 x 100 bp(최대 2 x 150 bp 가능)

NovaSeq 6000 System

Exome (samples per run, by flow cell type): S1: 128, S2: 164, S4: 400 (based on 50× mean targeted coverage; 90% target coverage at 20×; S4 limited by available indexes)

2 x 100 bp


관련 애플리케이션 및 방법

비교하기

선택 도구:

그림 자료

Illumina on-bead tagmentation chemistry

eBLT에 의해 매개된 균일한 태그화 반응 후 단일 혼성화 반응은 빠르고 유연한 워크플로우를 가능하게 한다.

Enrichment panel 호환성

Illumina DNA Prep with Enrichment는 다양한 Illumina 증균 패널과 호환되며 저처리량, 중처리량 및 고처리량 시스템에서 사용하도록 최적화되었습니다.

High coverage uniformity and padded read enrichment

Illumina DNA Prep with Enrichment는 맞춤형, 고정형 및 엑솜 패널을 위한 높은 적용 범위 균일성과 온타겟 패딩 판독 강화 기능을 제공합니다.

정확한 변이 검출

Illumina DNA Prep with Enrichment는 (A, B) 세포주 FFPE 대조 인간 참조 DNA 샘플 및 (C, D) 실제 FFPE 샘플을 필요로 하는 저풍부 체세포 변이체를 제공하며, 관찰된 변이체 빈도는 이종상동 시퀀싱 분석의 빈도와 유의한 상관관계를 나타낸다.

라이브러리 프렙 (4)

Illumina® DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation (96 Samples)

20025524

96개의 라이브러리(8개의 12-플렉스 증균 반응)를 준비하고 증균하기 위한 시약이 포함되어 있습니다. 증균 프로브 패널, Illumina 정제 비드 및 인덱스 어댑터를 별도로 구입하십시오.

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Illumina® DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation (16 Samples)

20025523

16개의 라이브러리(16개의 1-플렉스 증균 반응)를 준비하고 증균하기 위한 시약이 포함되어 있습니다. 증균 프로브 패널, Illumina 정제 비드 및 인덱스 어댑터를 별도로 구입하십시오.

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Illumina® DNA Prep, (S) Tagmentation (96 Samples)

20025520

96개의 라이브러리를 준비하기 위한 시약이 포함되어 있습니다. 증균 시약은 포함되어 있지 않습니다. 증균 프로브 패널, Illumina 정제 비드 및 인덱스 어댑터를 별도로 구입하십시오. 인리치먼트 시약은 라이브러리 준비 시약(Illumina DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation (96 samples))과 함께 주문하는 것만 가능합니다.

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Illumina® DNA Prep, (S) Tagmentation (16 Samples)

20025519

16개의 라이브러리를 준비하기 위한 시약이 포함되어 있습니다. 증균 시약은 포함되어 있지 않습니다. 증균 프로브 패널, Illumina 정제 비드 및 인덱스 어댑터를 별도로 구입하십시오. 인리치먼트 시약은 라이브러리 준비 시약(Illumina DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation (16 samples))과 함께 주문하는 것만 가능합니다.

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패널 (5)

TruSight Cancer – Enrichment Oligos only (4 or 8 Enrichment Reactions)

FC-121-0202

TruSight Cancer는 다양한 암에 대한 소인과 관련된 94개 유전자 및 284개 SNP를 표적으로 하며, 단일 하이브리드화 워크플로우로 인해 Nextera Flex for Enrichment와 함께 사용하면 8가지 인리치먼트 반응에 충분하고 TruSight Rapid Capture와 함께 사용하면 4가지 인리치먼트 반응에 충분합니다. 라이브러리 준비, 인리치먼트 및 인덱스 어댑터 시약은 별도로 주문해야 합니다.

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TruSight Hereditary Cancer – Enrichment Oligos Only (8 Enrichment Reactions)

20029551

TruSight Hereditary Cancer – Enrichment Oligos Only (8 Enrichment Reactions)

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TruSight One – Enrichment Oligos only (6 Enrichment Reactions)

20029227

Illumina DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation과 함께 사용하면 6가지 증균 반응에 충분합니다. 라이브러리 준비 및 증균 시약과 색인 어댑터를 별도로 구입하십시오.

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TruSight One Expanded – Enrichment Oligos only (6 Enrichment Reactions)

20029226

Illumina DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation과 함께 사용하면 6가지 증균 반응에 충분합니다. 라이브러리 준비 및 증균 시약과 색인 어댑터를 별도로 구입하십시오.

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Illumina Custom Enrichment Panel (8 Enrichment Reactions)

20025371

Illumina DNA Prep with Enrichment와 함께 사용하면 8가지 증균 반응에 충분합니다. DesignStudio를 사용하여 2K – 67K 프로브 간의 사용자 지정 패널 설계를 활성화합니다. 라이브러리 준비 및 증균 시약과 색인 어댑터를 별도로 구입하십시오.

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맞춤 설정

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인덱스 어댑터 (8)

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091654

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)에는 96개 샘플을 라벨링하는 데 충분한 96개의 10 bp 인덱스가 포함되어 있습니다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091656

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)에는 96개 샘플을 라벨링하는 데 충분한 96개의 10 bp 인덱스가 포함되어 있습니다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091658

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)에는 96개 샘플을 라벨링하는 데 충분한 96개의 10 bp 인덱스가 포함되어 있습니다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091660

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)에는 96개 샘플을 라벨링하는 데 충분한 96개의 10 bp 인덱스가 포함되어 있습니다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20027213

96개의 검체 라벨링에 충분한 96, 10 bp 지수를 포함한다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20027214

96개의 검체 라벨링에 충분한 96, 10 bp 지수를 포함한다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20042666

96개의 샘플에 라벨을 부착하기에 충분한 96, 10 bp 인덱스 포함. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20042667

96개의 검체 라벨링에 충분한 96, 10 bp 지수를 포함한다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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서비스 (1)

Illumina DNA Prep with Enrichment Training

20028457

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액세서리 제품 (7)

Illumina Purification Bead, 100mL

20060057

라이브러리 정리 및 크기 선택을 위한 비드 100ml 컨테이너 1개가 포함되어 있습니다. 라이브러리 준비 및 증균 시약, 프로브 패널 및 색인을 별도로 구입합니다.

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Illumina Purification Bead, 400mL

20060058

라이브러리 정리 및 크기 선택을 위한 비드 100ml 컨테이너 4개가 포함되어 있습니다. 라이브러리 준비 및 증균 시약, 프로브 패널 및 색인을 별도로 구입합니다.

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Flex Lysis Reagent Kit (96 reactions)

20018706

Illumina DNA Prep 및 Illumina DNA Prep with Enrichment로 혈액 검체를 처리하기 위한 시약이 포함되어 있습니다. 라이브러리 준비, 증균, 증균 프로브 패널 및 인덱스 어댑터 시약을 별도로 구입합니다.

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Infinium FFPE QC Kit (384 reactions)

WG-321-1001

Infinium FFPE QC Kit는 Nextera Flex for Enrichment를 사용하여 FFPE 샘플의 적격성을 확인하는 데 필요한 액세서리 제품입니다. 라이브러리 준비, 인리치먼트, 인리치먼트 프로브 패널 및 인덱스 어댑터 시약은 별도로 주문해야 합니다.

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Infinium MIDI Heatblock Insert

BD-60-601

Nextera Flex for Enrichment 하이브리드 단계에 필요한 SciGene Hybex Microheating 시스템용 Heatblock 단편(insert).

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Illumina® Free Adapter Blocking Reagent (12 Reactions)

20024144

이 시약은 라이브러리 준비 중에 인덱스 호핑 수준을 줄이기 위해 사용합니다.

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Illumina® Free Adapter Blocking Reagent (48 Reactions)

20024145

이 시약은 라이브러리 준비 중에 인덱스 호핑 수준을 줄이기 위해 사용합니다.

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선택 품목 요약

제품

수량

Unit Price

FAQ

Illumina DNA Prep with Enrichment 키트는 10~1000 ng 또는 50~1000 ng FFPE의 고품질 이중가닥 유전체 DNA(gDNA) 입력과 호환됩니다. 인간 gDNA 검체 및 기타 큰 복합체 유전체의 경우, 권장되는 최소 gDNA 입력은 50 ng이다.

이 키트는 비드 기반 트랜스포솜 복합체를 사용하여 게놈 DNA를 어댑터와 함께 단편화하고 표지한 다음, PCR 단계를 수행하여 인덱싱된 어댑터 서열을 DNA 단편의 말단에 추가한다. 라이브러리 준비 후, 비오틴화 올리고뉴클레오티드 프로브를 혼성화하고 스트렙타비딘 자성 비드(SMB)를 사용하여 표적 라이브러리 단편을 포획함으로써 표적을 강화한다. 포획되고 색인화된 라이브러리는 비드로부터 용리되고 시퀀싱 전에 증폭된다.

Flex Lysis Reagent Kit와 함께 냉동 또는 응고된 혈액을 사용하고 Illumina DNA Prep with Enrichment가 포함된 혈액 용해 프로토콜은 Illumina가 지원하거나 검사하지 않습니다.

Illumina DNA Prep with Enrichment를 사용하는 혈액 용해 프로토콜은 K2-EDTA 채취 튜브(Becton Dickinson에서 제조)와 함께 사용하도록 최적화되었습니다. 다른 혈액 채취 튜브는 효과가 있을 수 있지만, 검증되지 않았습니다.

/ 결과

NovaSeq X 시리즈 주문

발전된 화학 반응, 광학 및 인포매틱스가 결합되어 뛰어난 속도와 데이터 품질, 뛰어난 처리량과 확장성을 제공합니다.

MiSeq Reagent Kit v3

클러스터 밀도와 판독 길이를 높여 이전 버전에 비해 시퀀싱 품질 점수를 개선하는 최적화된 시약 키트입니다.

TruSight Oncology 500

FFPE 조직의 모든 주요 변이 계열과 유전자 시그니처(TMB, MSI, HRD)를 포함하는 대형 범암 패널로 CGP를 활성화합니다.

Illumina DNA Prep

광범위한 시퀀싱 애플리케이션에 사용하기 위한 매우 정확한 데이터를 생성하는 효율적이고 빠른 통합 라이브러리 프렙 워크플로우입니다.

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