표적 인리치먼트 | NGS 기반 하이브리드 캡처 방식

표적 재시퀀싱(Targeted resequencing)을 통해 유전자의 부분집합이나 유전체의 특정 영역을 분리하여 시퀀싱을 수행합니다. 표적 인리치먼트는 관심 유전체 영역을 표적 특이적 바이오틴화된 프로브에 하이브리드화하여 캡처한 다음, 이를 자성을 이용해 아래로 끌어당겨서 분리하는 과정을 말합니다.

Illumina DNA Prep with Enrichment는 혁신적인 최신 기술이 적용된 차세대 시퀀싱(Next-generation sequencing, NGS) 표적 인리치먼트 솔루션입니다. 비드 결합 트랜스포좀(Bead-linked transposome) 방식으로 조정한 태그멘테이션 chemistry와 하이브리드 캡처 표적 인리치먼트를 함께 사용하면 연구자들의 워크플로우 시간을 단축할 수 있을 뿐만 아니라 표적 인리치먼트 재시퀀싱에 적합한 정확하고 신뢰도 높은 assay를 만들 수 있습니다.

하이브리드화 기반 인리치먼트는 주어진 샘플에서 특정 유전적 변이를 분석하는 데 유용한 전략입니다.

표적 인리치먼트는 효과적이고 간편한 워크플로우를 통해 엑솜이나 많은 수의 유전자(예: 유전자 수 > 50개)를 안정적으로 시퀀싱할 수 있게 해 줍니다. 이 방식을 이용하면 광범위한 샘플 타입과 수량에 걸쳐 믿을 수 있는 결과를 도출합니다. 표적 인리치먼트가 활용될 수 있는 시퀀싱 방법은 다음과 같습니다.

인간 전장 엑솜 시퀀싱
사전 설계(고정)된 시퀀싱 패널을 사용한 암 및 유전 질환 연구
맞춤형 유전체 시퀀싱

하이브리드 캡처 기반 표적 인리치먼트를 이용하면 연구 관심 분야와 관련 있는 유전체 영역을 표적화할 수 있습니다. 표적 재시퀀싱은 PCR이나 생어(Sanger) 시퀀싱보다 발견 역량(신종 변이를 식별하는 능력)이 뛰어나며, 높은 해상도로 돌연변이 연구를 수행할 수 있게 해 줍니다.

하이브리드화 기반의 인리치먼트 시퀀싱을 통해 PCR 기반의 앰플리콘(Amplicon) 시퀀싱보다 더 많은 수의 유전자를 표적화하고, 모든 변이 유형을 더욱 포괄적으로 프로파일링해 보세요. 표적화된 총 유전자 수가 더 많을수록 발견 관련 애플리케이션에서 알려진 변이와 신종 변이의 특성을 모두 규명할 수 있습니다.

표적 인리치먼트와 앰플리콘 시퀀싱의 장점 비교*

표적 인리치먼트(Target Enrichment)	앰플리콘 시퀀싱
더 많은 수의 유전자(일반적인 유전자 수 > 50)	더 적은 수의 유전자(일반적인 유전자 수 < 50)
모든 변이 유형에 대해 더 통합적인 프로파일링 제공	단일 염기서열 변이(single-nucleotide variant, SNV) 및 삽입/결실(Insertion/deletion, Indel) 분석에 가장 적합
더 포괄적인 방식이지만, 수작업 시간과 소요 시간이 더 오래 걸림**	보다 경제적이며 간편한 워크플로우

* Data on file, Illumina 2018.
** 소요 시간은 라이브러리 준비 assay 시간 기준(DNA부터 완성된 라이브러리까지).

COVID-19 NGS 솔루션

NGS는 감염병 감시 시스템 및 발생 모형 분야에서 독보적인 위치를 점하고 있습니다. 표적 인리치먼트를 샷건 메타지노믹스(Shotgun metagenomics)와 같은 기타 병원체 NGS 방식과 비교해 보세요. SARS-CoV-2를 탐지하고 감염 경로를 추적하며, 동시 감염을 연구하고 바이러스의 진화 과정을 조사하기 위한 솔루션을 찾아보세요.