표적 인리치먼트(Target Enrichment)
표적 인리치먼트(Target Enrichment)란?
표적 재시퀀싱(Targeted resequencing)을 통해 유전자의 부분집합이나 유전체의 특정 영역을 분리하여 시퀀싱을 수행합니다. 표적 인리치먼트는 관심 유전체 영역을 표적 특이적 바이오틴화된 프로브에 하이브리드화하여 캡처한 다음, 이를 자성을 이용해 아래로 끌어당겨서 분리하는 과정을 말합니다.
Illumina DNA Prep with Enrichment는 혁신적인 최신 기술이 적용된 차세대 시퀀싱(Next-generation sequencing, NGS) 표적 인리치먼트 솔루션입니다. 비드 결합 트랜스포좀(Bead-linked transposome) 방식으로 조정한 태그멘테이션 chemistry와 하이브리드 캡처 표적 인리치먼트를 함께 사용하면 연구자들의 워크플로우 시간을 단축할 수 있을 뿐만 아니라 표적 인리치먼트 재시퀀싱에 적합한 정확하고 신뢰도 높은 assay를 만들 수 있습니다.
NGS 표적 인리치먼트의 장점
하이브리드화 기반 인리치먼트는 주어진 샘플에서 특정 유전적 변이를 분석하는 데 유용한 전략입니다.
표적 인리치먼트는 효과적이고 간편한 워크플로우를 통해 엑솜이나 많은 수의 유전자(예: 유전자 수 > 50개)를 안정적으로 시퀀싱할 수 있게 해 줍니다. 이 방식을 이용하면 광범위한 샘플 타입과 수량에 걸쳐 믿을 수 있는 결과를 도출합니다. 표적 인리치먼트가 활용될 수 있는 시퀀싱 방법은 다음과 같습니다.
- 인간 전장 엑솜 시퀀싱
- 사전 설계(고정)된 시퀀싱 패널을 사용한 암 및 유전 질환 연구
- 맞춤형 유전체 시퀀싱
표적 인리치먼트와 기타 재시퀀싱 전략 비교
하이브리드 캡처 기반 표적 인리치먼트를 이용하면 연구 관심 분야와 관련 있는 유전체 영역을 표적화할 수 있습니다. 표적 재시퀀싱은 PCR이나 생어(Sanger) 시퀀싱보다 발견 역량(신종 변이를 식별하는 능력)이 뛰어나며, 높은 해상도로 돌연변이 연구를 수행할 수 있게 해 줍니다.
하이브리드화 기반의 인리치먼트 시퀀싱을 통해 PCR 기반의 앰플리콘(Amplicon) 시퀀싱보다 더 많은 수의 유전자를 표적화하고, 모든 변이 유형을 더욱 포괄적으로 프로파일링해 보세요. 표적화된 총 유전자 수가 더 많을수록 발견 관련 애플리케이션에서 알려진 변이와 신종 변이의 특성을 모두 규명할 수 있습니다.
표적 인리치먼트와 앰플리콘 시퀀싱의 장점 비교*
표적 인리치먼트(Target Enrichment) |
앰플리콘 시퀀싱 |
| 더 많은 수의 유전자(일반적인 유전자 수 > 50) | 더 적은 수의 유전자(일반적인 유전자 수 < 50) |
| 모든 변이 유형에 대해 더 통합적인 프로파일링 제공 | 단일 염기서열 변이(single-nucleotide variant, SNV) 및 삽입/결실(Insertion/deletion, Indel) 분석에 가장 적합 |
| 더 포괄적인 방식이지만, 수작업 시간과 소요 시간이 더 오래 걸림** | 보다 경제적이며 간편한 워크플로우 |
* Data on file, Illumina 2018.
** 소요 시간은 라이브러리 준비 assay 시간 기준(DNA부터 완성된 라이브러리까지).
COVID-19 NGS 솔루션
NGS는 감염병 감시 시스템 및 발생 모형 분야에서 독보적인 위치를 점하고 있습니다. 표적 인리치먼트를 샷건 메타지노믹스(Shotgun metagenomics)와 같은 기타 병원체 NGS 방식과 비교해 보세요. SARS-CoV-2를 탐지하고 감염 경로를 추적하며, 동시 감염을 연구하고 바이러스의 진화 과정을 조사하기 위한 솔루션을 찾아보세요.
추천 표적 인리치먼트 워크플로우
사용이 용이하고, 자동화 지원 워크플로우가 연구진에게 빠르고 유연한 솔루션을 제공합니다. 온비드 태그멘테이션(On-bead tagmentation) chemistry를 통해 폭넓은 DNA 사용량, 다양한 샘플 사이즈, 광범위한 애플리케이션을 지원합니다.
주요 제품
NextSeq 1000 & 2000 Systems
Groundbreaking benchtop sequencers allow you to explore new discoveries across a variety of current and emerging applications, with higher efficiency and fewer restraints.
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Nextera Flex for Enrichment
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BaseSpace Sequence Hub
Data management and simplified bioinformatics for labs getting started and for rapidly scaling next-generation sequencing (NGS) operations.
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Respiratory Virus Oligo Panel
포괄적이고 신속한 표적 인리치먼트 시퀀싱을 활용하여 SARS-CoV-2 및 최근에 유행하는 독감 바이러스의 주 등 일반적인 호흡기 바이러스를 높은 민감도로 검출하고 그 특성을 규명합니다.
Respiratory Pathogen ID/AMR Panel
호흡기 병원체와 항생제 내성(Antimicrobial resistance, AMR) 대립유전자를 표적화하는 NGS 기반의 표적 인리치먼트 워크플로우를 사용하며, IDbyDNA를 통한 간소화된 데이터 분석을 제공합니다.
SNP 및 SNV 유전형 분석(Genotyping)
SNP와 SNV를 검출하는 기법을 비교하여 연구에 가장 적합한 방식이 무엇인지 판단해 보세요. 과학계에서 어떻게 변이와 기능을 연결 짓는 속도를 높이고 질병 생물학에 관한 귀중한 정보를 얻고 있는지 알아보세요.
추가 자료
Illumina DNA Prep Technology
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Library Prep and Array Kit Selector
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