AmpliSeq for Illumina 인포매틱스 솔루션
사용하기 쉬운 앰플리콘 데이터 분석
AmpliSeq for Illumina 패널을 위한 당사의 완전한 인포매틱스 솔루션을 통해 간편하게 미가공 시퀀싱 데이터를 의미 있는 결과로 처리할 수 있습니다. 이 분석은 생물학자를 위해 설계되었으며 전용 컴퓨팅 인프라나 바이오인포매틱스 전문 지식이 필요하지 않습니다.
변이체 세부 정보 및 생물학적 해석을 포함하는 의미 있는 보고서를 생성합니다. DNA 및 RNA 앰플리콘 패널 모두를 위한 인포매틱스 솔루션을 사용할 수 있습니다.
- DNA 앰플리콘 패널을 사용하여 2차 분석 워크플로우가 참조 유전체에 대한 리드를 정렬하고 작은 변이를 호출합니다.
- RNA 앰플리콘 패널의 경우, 2차 분석 워크플로우는 차등 발현 분석 및 유전자 융합 호출 기능을 수행합니다.
- 3차 분석은 선별된 공개 및 비공개 지식을 통해 변이, 유전자 융합 및 차등 발현 유전자에 생물학적 맥락을 추가합니다.
주요 AmpliSeq 인포매틱스 도구
기기 내 분석이 완료되면 BaseSpace Sequence Hub 및 Local Run Manager가 앰플리콘 패널에 대한 변이 호출 및 차등 발현 결과를 생성합니다.
BaseSpace Sequence Hub
기기 런(run)을 실시간으로 설정 및 모니터링하고 엄선된 분석 앱 세트를 사용하여 데이터를 관리 및 분석합니다.
- 시퀀싱데이터를 기기에서 바로 클라우드로 전송
- 표준 형식으로 데이터 변환
- 사내에서 인프라와 도구를 조립하는 것보다 더 경제적임
Local Run Manager
시퀀싱 런 생성, 런 상태 모니터링, 시퀀싱 데이터 분석 및 결과 보기를 위한 기기 내 솔루션:
- 자동으로 기기 내 데이터 분석 수행
- 선택적 소프트웨어 모듈을 통해 다양한 라이브러리 유형에 대한 분석 절차 수행
추가 다운스트림인 Basespace Variant Interpreter 및 BaseSpace Correlation Engine은 결과에 생물학적 컨텍스트를 추가하고 보고서를 생성할 수 있습니다.
BaseSpace Variant Interpreter
다음과 같이 인간 유전체 데이터에서 생물학적으로 중요한 변이를 신속하게 식별합니다.
- 광범위한 소스를 사용하여 데이터에 주석을 달고 구조화된 보고서로 결과 요약
- 전장 유전체 시퀀싱부터 표적 시퀀싱에 이르기까지 모든 assay 유형의 변이 분석
- 수동으로 엄선된 60,000개 이상의 연결로 변이 해석 가속화
BaseSpace Correlation Engine
데이터 기반으로 관심 있는 유전자 및 변이와 관련된 유전자, 실험, 약물 및 표현형의 발견:
- 질병 메커니즘, 약물 표적, 예후 또는 예측 바이오마커 식별
- 여러 연구 및 데이터 유형에서 질병 진전에 역할을 담당하는 경로 확인
- 약동학 및 독성 프로필을 위한 후보 분자 분석