코딩 및 비코딩 전사체 전반에 걸쳐 명확하고 포괄적인 분석을 위한 간소화된 RNA-Seq 솔루션으로 탁월한 연구 유연성을 제공합니다.
Assay 시간
수작업 시간
사용량
Illumina Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus는 유전자 및 전사물 풍부도를 정확하게 측정하고, 코딩 및 다양한 형태의 비코딩 RNA에서 알려진 특징과 새로운 특징을 모두 검출할 수 있습니다. 연구자들은 대체 전사물, 유전자 융합, 대립유전자 특이적 발현의 발견에 대한 확신을 가질 수 있습니다. 또한 Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus Microbiome은 메타트랜스크립토믹 애플리케이션에 고품질 데이터를 제공합니다.
| Assay 시간 | 약 7시간 |
|---|---|
| 자동화 기능 | Liquid handling robots |
| 콘텐츠 사양 | 코딩 RNA와 여러 형태의 비코딩 RNA 캡처 |
| 설명 | 다양한 RNA-Seq 애플리케이션을 지원하는 저 RNA 입력 및 저품질 샘플에서 전체 전사체 시퀀싱 준비 라이브러리를 준비하는 데 사용됩니다. 풍부한 전사체 분석을 용이하게 하기 위해 여러 종에서 rRNA 및 글로빈 RNA의 단일 튜브 고갈을 위한 Ribo-Zero Plus를 포함한다. |
| 수작업 시간 | < 3시간 |
| 사용량 | 표준 품질 RNA 검체에 대해 1–1000 ng 총 RNA. 최적의 성능 및 FFPE 검체에 대해 최소 10 ng 총 RNA 권장 |
| Instruments | NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq 6000 System |
| 작용 기전 | 효소 rRNA 제거, 어댑터 및 인덱스의 라이게이션 기반 첨가 |
| 방법 | Whole-transcriptome sequencing, Metatranscriptome sequencing |
| 멀티플렉싱 | 최대 384개의 고유한 듀얼 인덱스(UDI) |
| Nucleic acid type | RNA |
| 특수 샘플의 종류 | Microbiome samples, Low-input samples, FFPE tissue |
| Species category | Mouse, Human, Rat, Bacteria |
| 종 세부 사항 | Ribo-Zero Plus는 인간 세포질 및 미토콘드리아 rRNA, 마우스 rRNA, 랫트 rRNA, 박테리아(E. coli 및 B. 서브틸리스) rRNA, 및 인간 베타 글로빈 전사물을 포함하는 다수의 종으로부터 풍부한 전사물을 고갈시킨다. Ribo-Zero Plus 미생물군유전체는 Ribo-Zero Plus에서 고갈된 것들과 다양한 미생물종 및 ATCC MSA-2002, MSA-2005 및 MSA-2006 을 포함한 여러 종의 풍부한 전사물을 고갈시킨다. |
| Strand specificity | Stranded |
| Technology | Sequencing |
| 변이 클래스 | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Novel transcripts, Transcript variants |
처리 요구에 맞는 라이브러리 준비 키트 크기(16개 샘플 또는 96개 샘플)를 선택합니다.
인덱스는 별도로 판매되며 멀티플렉싱에 필요합니다. 표적 시퀀싱 처리량에 가장 적합한 인덱싱 옵션을 선택하십시오. 시퀀싱 처리량 및 멀티플렉싱 기능은 시퀀서 및 플로우 셀 시약에 따라 다를 수 있습니다.
Ribo-Zero Plus 또는 Ribo-Zero Plus Microbiome 키트가 포함된 Illumina Stranded Total RNA Prep을 사용하면 3시간 미만의 수작업 시간으로 약 7시간 내에 낮은 RNA 입력 및 저품질 샘플에서 전체 전사체 시퀀싱 준비 라이브러리를 준비할 수 있습니다.
Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus 또는 Ribo-Zero Plus Microbiome
| 기기 | Recommended number of samples | Read length |
|---|---|---|
| NextSeq 500 System | Mid output: 2 samples per flow cell High output: 8 samples per flow cell |
2 × 150 |
| NextSeq 2000 System | P2: 8 samples per flow cell P3: 24 samples per flow cell |
2 × 150 |
| NovaSeq 6000 System | SP: 16 samples per flow cell S1: 32 samples per flow cell S2: 82 samples per flow cell S4: 200 samples per flow cell |
2 × 150 |
RNA-Seq는 세균, 바이러스 및 기타 미생물 전사물을 분석하고 정량화하기 위한 편향되지 않은 접근법을 제공합니다.
코딩(coding) RNA와 다양한 형태의 비코딩(noncoding) RNA를 모두 분석하여 전사체에 대한 종합적인 관점에서 살펴볼 수 있게 해 줍니다.
Learn how to profile gene expression changes for a deeper understanding of biology.
| Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus or Ribo-Zero Plus Microbiome | TruSeq Stranded Total RNA | TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Globin | |
|---|---|---|---|
| Assay 시간 | 약 7시간 | 11.5시간 | 11.5시간 |
| 자동화 기능 | Liquid handling robots | Liquid handling robots | Liquid handling robots |
| 콘텐츠 사양 | 코딩 RNA와 여러 형태의 비코딩 RNA 캡처 | 코딩 RNA와 여러 형태의 비코딩 RNA 캡처 | 코딩 RNA와 여러 형태의 비코딩 RNA 캡처 |
| 설명 | 다양한 RNA-Seq 애플리케이션을 지원하는 저 RNA 입력 및 저품질 샘플에서 전체 전사체 시퀀싱 준비 라이브러리를 준비하는 데 사용됩니다. 풍부한 전사체 분석을 용이하게 하기 위해 여러 종에서 rRNA 및 글로빈 RNA의 단일 튜브 고갈을 위한 Ribo-Zero Plus를 포함한다. | 전장 전사체 시퀀싱 연구용입니다. Total RNA 버전은 세포질 rRNA를 제거하며 Total RNA Gold 버전은 세포질 및 미토콘드리아 rRNA를 제거합니다. | 혈액 유래 RNA에 대한 전장 전사체 시퀀싱 연구용입니다. 세포질 및 미토콘드리아 rRNA와 글로빈 mRNA를 제거합니다. |
| 수작업 시간 | < 3시간 | 5.5시간 | 5.5시간 |
| 사용량 | 표준 품질 RNA 검체에 대해 1–1000 ng 총 RNA. 최적의 성능 및 FFPE 검체에 대해 최소 10 ng 총 RNA 권장 | 고품질 Total RNA 0.1~1 ug. 품질이 낮은 샘플에는 추가적인 최적화가 필요할 수 있음. | 혈액 고품질 정제 Total RNA 0.1~1 ug |
| Instruments | NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq 6000 System | NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq X System, NextSeq 500 System, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System | NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq X System, NextSeq 500 System, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System |
| 작용 기전 | 효소 rRNA 제거, 어댑터 및 인덱스의 라이게이션 기반 첨가 | 비드 기반 rRNA 제거, cDNA 합성 및 PCR | 비드 기반 rRNA 제거, cDNA 합성 및 PCR |
| 방법 | Whole-transcriptome sequencing, Metatranscriptome sequencing | Whole-transcriptome sequencing | Whole-transcriptome sequencing |
| 멀티플렉싱 | 최대 384개의 고유한 듀얼 인덱스(UDI) | 저처리량 키트: 최대 12개의 샘플을 풀링합니다. 또는 세트 A, B를 함께 사용 시 최대 24개의 샘플 풀링, 고처리량 키트: 조합 듀얼 인덱스 또는 고유한 듀얼 인덱스를 사용하여 96개의 인덱스 샘플 준비 | 고처리량 키트: 조합 듀얼 인덱스 또는 고유한 듀얼 인덱스를 사용하여 96개의 인덱스 샘플 준비, 저처리량 키트: 최대 12개의 샘플을 풀링합니다. 또는 세트 A, B를 함께 사용 시 최대 24개의 샘플 풀링 |
| Nucleic acid type | RNA | RNA | RNA |
| 특수 샘플의 종류 | Microbiome samples, Low-input samples, FFPE tissue | FFPE tissue | Blood |
| Species category | Mouse, Human, Rat, Bacteria | Mouse, Human, Rat | Mouse, Human, Rat |
| 종 세부 사항 | Ribo-Zero Plus는 인간 세포질 및 미토콘드리아 rRNA, 마우스 rRNA, 랫트 rRNA, 박테리아(E. coli 및 B. 서브틸리스) rRNA, 및 인간 베타 글로빈 전사물을 포함하는 다수의 종으로부터 풍부한 전사물을 고갈시킨다. Ribo-Zero Plus 미생물군유전체는 Ribo-Zero Plus에서 고갈된 것들과 다양한 미생물종 및 ATCC MSA-2002, MSA-2005 및 MSA-2006 을 포함한 여러 종의 풍부한 전사물을 고갈시킨다. | rRNA 제거: 인간, 생쥐 및 쥐 rRNA 제거 | rRNA 제거: 인간, 생쥐 및 쥐 rRNA(세포질 및 미토콘드리아) 및 글로빈 mRNA 제거 |
| Strand specificity | Stranded | ||
| Technology | Sequencing | Sequencing | Sequencing |
| 변이 클래스 | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Novel transcripts, Transcript variants | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Novel transcripts, Transcript variants | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Novel transcripts, Transcript variants |
Find the right sequencing library preparation kit or microarray for your needs. Filter by method, species, and more. Compare, share, and order kits.
Illumina Stranded Total RNA Prep은 작업 시간을 단축하면서 빠른 워크플로를 제공합니다. 시간은 사용된 장비, 처리된 샘플 수, 자동화 절차 또는 사용자 경험에 따라 다를 수 있습니다.
Ribo-Zero Plus를 갖는 Illumina Stranded Total RNA Prep을 Ribo-Zero를 갖는 TruSeq Stranded Total RNA와 비교했습니다. Ribo-Zero Plus를 이용한 Illumina Stranded Total RNA Prep은 rRNA 고갈, 특히 10 ng 및 1 ng 총 UHR RNA의 낮은 투입량에서 더 효과적이었습니다.
Ribo-Zero Plus Microbiome rRNA Depletion 키트는 대변 샘플에서 rRNA(5S, 16S 및 23S) 수치를 효과적으로 제거합니다. 결과는 두 개의 대변 샘플 혼합물(샘플 1 및 샘플 2)을 사용하여 회사 X의 Ribo-Zero Plus rRNA Depletion Kit 및 시중에서 구할 수 있는 리보핵산제거 키트와 비교됩니다.
Illumina Stranded Total RNA Prep 키트에는 (A) 인간, 마우스, 랫트, 박테리아 및 역학 샘플을 포함한 여러 종에서 풍부한 rRNA를 제거하기 위한 Ribo-Zero Plus 또는 (B) 메트란스크롬 연구를 위해 대변 샘플을 포함한 복잡한 미생물 샘플에서 풍부한 rRNA의 강력한 고갈을 제공하는 Ribo-Zero Plus Microbiome이 포함됩니다.
A. Ribo-Zero Plus 키트
| 고갈 목표 | rRNA 표적 |
| 인간 세포질 rRNA | 28S, 18S , 5.8S 및 5S |
| 인간 미토콘드리아 rRNA | 12S 및 16S |
| 인간 베타 글로빈 전사물 | HBA1, HBA2, HBB, HBG1, HBG2 |
| 마우스 및 랫트 | 12S, 16S, 28S, 18S , 5.8S 및 5S |
| 그람(-) 세균성 rRNA | E.coli: 5S, 16S, 23S |
| >그람(+) 세균 rRNA | B. 서브틸리스: 5S, 16S, 23S |
B. Ribo-Zero Plus 마이크로바이옴 키트
| 고갈 목표 | rRNA 표적 |
| 미생물군유전체 rRNA* | 5S, 16S, 23S는 일반적인 성인, 유아 박테리아 종 및 ATCC MSA-2002, MSA-2005 및 MSA-2006을 포함한 다양한 미생물로부터 얻은 것입니다. |
*Illumina Stranded Total Ribo-Zero Plus Microbiome 키트(Cat#20072063)에만 포함되어 있습니다. rRNA 고갈은 인간 마이크로바이옴 rRNA에 대해 최적화되었으며, 성능은 다른 샘플 유형을 사용할 때 달라질 수 있다.
Drs. Tonya Ward, Emily Hollister, Le François of Diversigen and DNA Genotek가 어떻게 메트란스크로믹 연구를 위한 워크플로우를 개발했는지 확인하고 이 연구 분야의 잠재적으로 영향력 있는 미래에 대한 그들의 견해를 읽어보십시오.
이 웨비나에서는 세 명의 업계 최고 전문가들이 샘플 수집 및 처리, rRNA 제거 및 바이오인포매틱 분석에 대한 통찰력과 주요 고려 사항을 공유합니다.
Illumina® Stranded Total RNA Prep, Ligation with Ribo-Zero Plus (16 Samples)
20040525
16개의 시료를 준비하기 위한 시약 및 Ribo-Zero Plus 고갈 모듈이 포함되어 있습니다. Illumina RNA UD 인덱스, 연결용 IDT와만 호환됩니다. 인덱스 및 정제 비드는 별도 판매됩니다.
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Discounts:
Illumina® Stranded Total RNA Prep, Ligation with Ribo-Zero Plus (96 Samples)
20040529
96개의 시료를 준비하기 위한 시약 및 Ribo-Zero Plus 고갈 모듈이 포함되어 있습니다. Illumina RNA UD 인덱스, 연결용 IDT와만 호환됩니다. 인덱스 및 정제 비드는 별도 판매됩니다.
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Discounts:
Illumina® Stranded Total RNA Prep with Ligation, Ribo-Zero Plus Microbiome (96 Samples)
20072063
96개 라이브러리를 준비하기 위한 시약 및 Ribo-Zero Plus Microbiome 고갈 모듈이 포함되어 있습니다. Illumina RNA UD 인덱스, 연결용 IDT와만 호환됩니다. 인덱스는 별도로 판매됩니다.
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Illumina® RNA UD Indexes Set A, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)
20091655
Illumina® RNA UD 인덱스 세트 A, 결찰(96 인덱스, 96 샘플) 96개의 샘플 및 RNA 인덱스 앵커 플레이트에 라벨을 부착하기에 충분한 96, 10 bp 인덱스를 포함합니다. Illumina Stranded Total RNA Prep 및 Illumina Stranded mRNA Prep 키트와 함께 사용됩니다. 라이브러리 준비 시약을 별도로 구입합니다.
List Price:
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Illumina® RNA UD Indexes Set B, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)
20091657
Illumina® RNA UD 인덱스 세트 B, 결찰(96 인덱스, 96 샘플) 96개의 샘플 및 RNA 인덱스 앵커 플레이트에 라벨을 부착하기에 충분한 96, 10 bp 인덱스를 포함합니다. Illumina Stranded Total RNA Prep 및 Illumina Stranded mRNA Prep 키트와 함께 사용됩니다. 라이브러리 준비 시약을 별도로 구입합니다.
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Illumina® RNA UD Indexes Set C, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)
20091659
Illumina® RNA UD 인덱스 세트 C, 결찰(96 인덱스, 96 샘플) 96개의 샘플 및 RNA 인덱스 앵커 플레이트에 라벨을 부착하기에 충분한 96, 10 bp 인덱스를 포함합니다. Illumina Stranded Total RNA Prep 및 Illumina Stranded mRNA Prep 키트와 함께 사용됩니다. 라이브러리 준비 시약을 별도로 구입합니다.
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Illumina® RNA UD Indexes Set D, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)
20091661
Illumina® RNA UD 인덱스 세트 D, 결찰(96 인덱스, 96 샘플) 96개의 샘플 및 RNA 인덱스 앵커 플레이트에 라벨을 부착하기에 충분한 96, 10 bp 인덱스를 포함합니다. Illumina Stranded Total RNA Prep 및 Illumina Stranded mRNA Prep 키트와 함께 사용됩니다. 라이브러리 준비 시약을 별도로 구입합니다.
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IDT® for Illumina® RNA UD Indexes Set A, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)
20040553
96개의 검체 및 RNA 인덱스 앵커 플레이트에 라벨을 부착하기에 충분한 96, 10 bp 인덱스를 포함합니다. Illumina Stranded Total RNA Prep 및 Illumina Stranded mRNA Prep 키트와 함께 사용됩니다. 라이브러리 준비 및 프로브 패널을 별도로 구입합니다.
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IDT® for Illumina® RNA UD Indexes Set B, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)
20040554
96개의 검체 및 RNA 인덱스 앵커 플레이트에 라벨을 부착하기에 충분한 96, 10 bp 인덱스 포함. Illumina Stranded Total RNA Prep 및 Illumina Stranded mRNA Prep 키트와 함께 사용됩니다. 라이브러리 준비 및 프로브 패널을 별도로 구입합니다.
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IDT® for Illumina® RNA UD Indexes Set C, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)
20040555
96개의 검체 및 RNA 인덱스 앵커 플레이트에 라벨을 부착하기에 충분한 96, 10 bp 인덱스를 포함합니다. Illumina Stranded Total RNA Prep 및 Illumina Stranded mRNA Prep 키트와 함께 사용됩니다. 라이브러리 준비 및 프로브 패널을 별도로 구입합니다.
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IDT® for Illumina® RNA UD Indexes Set D, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)
20040556
96개의 검체 및 RNA 인덱스 앵커 플레이트에 라벨을 부착하기에 충분한 96, 10 bp 인덱스 포함. Illumina Stranded Total RNA Prep 및 Illumina Stranded mRNA Prep 키트와 함께 사용됩니다. 라이브러리 준비 및 프로브 패널을 별도로 구입합니다.
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Illumina Stranded Total RNA Library Prep Training
20044764
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최종 라이브러리의 품질과 농도를 확인하기 위해 다음 두 가지 방법을 사용할 수 있습니다.
NextSeq 1000/2000 Sequencing System을 사용하는 경우 1 μl 라이브러리 1:10,000을 희석한 후 KAPA qPCR 라이브러리 정량화 키트를 이용하여 라이브러리를 분석합니다.
다른 모든 염기서열 분석 시스템의 경우, Agilent 2100 Bioanalyzer 및 DNA 1000 키트를 사용하여 1µ리터 라이브러리를 분석합니다.
발전된 화학 반응, 광학 및 인포매틱스가 결합되어 뛰어난 속도와 데이터 품질, 뛰어난 처리량과 확장성을 제공합니다.
클러스터 밀도와 판독 길이를 높여 이전 버전에 비해 시퀀싱 품질 점수를 개선하는 최적화된 시약 키트입니다.
FFPE 조직의 모든 주요 변이 계열과 유전자 시그니처(TMB, MSI, HRD)를 포함하는 대형 범암 패널로 CGP를 활성화합니다.
광범위한 시퀀싱 애플리케이션에 사용하기 위한 매우 정확한 데이터를 생성하는 효율적이고 빠른 통합 라이브러리 프렙 워크플로우입니다.
스트랜드 정보를 정밀하게 측정하여 단백질 코딩 전사체를 정확하고 공정하게 검출할 수 있는 빠르고 비용 효율적인 워크플로우입니다.
NextSeq 1000/2000 시스템용 시약은 사용하기 쉬운 카트리지와 유연한 시퀀싱 옵션을 위한 다중 플로우 셀 구성이 특징입니다.
고유한 듀얼(UD) 인덱스를 사용하면 처리량을 늘리고 비용 절감의 이점을 위해 다중화할 수 있는 고품질 라이브러리를 준비할 수 있습니다.
안전한 고성능 시퀀싱 운영을 위한 사용이 간편한 클라우드 기반 유전체 실행 관리 및 생물정보학 컴퓨팅 및 스토리지 환경.
즉시 사용 가능한 사전 충전 시약 카트리지와 플로우 셀로 구성된 NovaSeq 6000 System용 시약 키트입니다.
광범위한 시퀀싱 애플리케이션에 사용하기 위한 매우 정확한 데이터를 생성하는 효율적이고 빠른 통합 라이브러리 프렙 워크플로우입니다.
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