Total RNA 시퀀싱
Total RNA 시퀀싱 소개
전장 전사체(transcriptome) 분석과 Total RNA 시퀀싱(RNA-Seq)을 통해 코딩(coding) RNA 및 여러 형태의 비코딩(noncoding) RNA를 검출할 수 있습니다. Total RNA-Seq은 유전자 및 전사물의 풍부도를 정확하게 측정하고 전사체의 알려진 특징과 새로운 특징을 식별할 수 있습니다.
Total RNA-Seq은 정상 샘플 또는 저품질 샘플에서 최적의 커버리지를 제공합니다. 종 특이적 리보솜 RNA 프로브는 풍부한 RNA 종을 효율적으로 제거합니다. 이렇게 하면 라이브러리 캡처를 위한 관심 대상 절편화 전사물과 온전한 전사물이 모두 남습니다.
Total RNA 시퀀싱의 장점
Total RNA-Seq은 코딩 RNA와 다양한 형태의 비코딩 RNA를 모두 분석하여 전사체를 종합적인 관점에서 살펴볼 수 있게 해 줍니다.
- 알려진 특징과 새로운 특징을 모두 캡처
- 연구자가 거의 대부분의 광범위한 전사물에 걸친 생체표지자 식별
- 관심 대상 표현형에 대한 보다 포괄적인 이해를 제공
- 광범위한 역학 범위에 걸친 전장 전사체의 프로파일링 가능
전장 유전체 어레이에서 Total RNA-Seq으로 전환
Boston University Medical Center의 폐 질환 및 중환자 전문의인 Avrum Spira 박사는 폐 질환에 대한 잠재적인 생체표지자를 연구하기 위해 전장 유전체 발현 어레이를 사용한 샘플 분석을 목표로 검사실을 시작했습니다. Spira의 검사실에서 Total RNA-Seq을 사용하여 발현 어레이에서 검출할 수 없는 새롭고 희귀한 전사체를 발견하는 방법을 알아보세요.
사례 연구 읽어 보기.
Deciphering the Role of Long Non-Coding RNA in Cancer
Biogazelle의 연구자들은 RNA-Seq을 사용하여 lncRNA가 어떻게 세포 타입에 대한 특이성을 가지고 있는지를 밝혀내고 있습니다. 이들은 특정 lncRNA를 침묵시키면 암세포를 파괴하는 데 도움이 될 수 있음을 발견했습니다.
인터뷰 읽어 보기
Total RNA 시퀀싱 워크플로우
Illumina의 sequencing by synthesis(SBS) chemistry는 가장 널리 활용되고 있는 차세대 시퀀싱(NGS) 기술로, 전 세계 시퀀싱 분석 데이터의 약 90%가 이 기술을 통해 생성됩니다.*
고품질 데이터에 더해, Illumina는 라이브러리 준비에서부터 데이터 분석 및 생물학적 해석에 이르기까지 전체 과정을 간소화하는 통합 전장 전사체 시퀀싱 워크플로우를 제공합니다.
Total RNA-Seq용 라이브러리 준비
Illumina의 향상된 RNA-Seq 라이브러리 준비 포트폴리오에는 풍부한 rRNA 제거가 포함되므로 전사체의 고가치 부분에 집중할 수 있습니다.
더 알아보기RNA Sequencing Considerations
Each RNA-Seq experiment type—whether it’s gene expression profiling, targeted RNA expression, or small RNA analysis—has unique requirements for read length and depth. This bulletin reviews experimental considerations and offers resources to help with study design.
Read Bulletin
NGS를 사용한 희귀 미진단 유전 질환 연구
전장 엑솜 시퀀싱과 전장 전사체 시퀀싱은 희귀 질환과 관련된 돌연변이와 경로를 밝히는 데 도움이 되는 것으로 입증되었습니다
더 알아보기주요 제품
NextSeq 1000 & 2000 Systems
Groundbreaking benchtop sequencers allow you to explore new discoveries across a variety of current and emerging applications, with higher efficiency and fewer restraints.
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Illumina Ribo-Zero Plus rRNA Depletion Kit
The stand-alone Illumina Ribo-Zero Plus kit allows for ribosomal RNA removal in human, mouse, rat, and bacterial samples.
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Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus
Rapid library preparation from a broad range of sample types for studying the coding and non-coding transcriptome with unparalleled study flexibility.
Learn More관련 솔루션
암 연구: 유전자 발현 연구
Total RNA-Seq을 사용하여 코딩 및 비코딩 RNA 생체표지자 모두에서 유전자 발현 변화를 모니터링하면 어떤 변이가 종양 분류 및 진행에 영향을 미치는지 연구자가 이해하는 데 도움이 됩니다. 암 RNA-Seq에 대해 자세히 알아보세요.
농업유전체학: 딥 전사체 시퀀싱
식물은 크고 반복적인 유전체를 가지고 있어 약하게 발현되는 유전자를 시퀀싱하는 것이 어려울 수 있습니다. 울트라 딥 RNA 시퀀싱은 이러한 유전자의 분석을 용이하게 할 수 있습니다. 식물 시퀀싱에 대해 자세히 알아보세요.
복합 질환 생체표지자 식별
Total RNA-Seq을 사용하면 복합 질환 연구자들이 단일 분석에서 코딩 및 여러 형태의 비코딩 RNA를 연구할 수 있어 광범위한 잠재적 질병 관련 생체표지자에 대한 가시성을 제공합니다. 복합 질환 연구에 대해 자세히 알아보세요.
RNA 기반 약제 반응 생체표지자 신약개발
RNA-Seq을 활용하여 RNA 기반 신약 반응 생체표지자를 식별하는 방법을 알아보세요. 이 애플리케이션을 채택하는 새로운 사용자에게 도움이 되도록 설계된 리소스를 열람해 보세요. 약물 개발을 위한 RNA 생체표지자 분석에 대해 자세히 알아보세요.
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Additional Resources
RNA-Seq Data Analysis
User-friendly software tools simplify RNA-Seq data analysis for biologists, regardless of bioinformatics experience.
RNA-Seq of Low-Quality and FFPE Samples
RNA-Seq of formalin-fixed, paraffin-embedded (FFPE) and other low-quality samples offers valuable insights for disease research.
Paired-End RNA-Seq
All Illumina sequencing systems are capable of paired-end sequencing, which facilitates detection of novel RNA transcripts, gene fusions, and more.
NextSeq 1000 and NextSeq 2000 single-cell RNA sequencing solution
This cost-effective, flexible workflow measures gene expression in single cells and offers high-resolution analysis to discover cellular differences usually masked by bulk sampling methods.
*Data calculations on file. Illumina, Inc., 2015