mRNA 시퀀싱

mRNA 시퀀싱 소개

mRNA 시퀀싱(mRNA-Seq)은 질병 상태, 생물학적 과정 및 광범위한 연구 설계에서 전사체를 분석하기 위해 선택하는 방법으로 빠르게 발전했습니다. 유전자 발현을 정량화하는 고감도의 정확한 수단일 뿐만 아니라, mRNA-Seq은 알려지거나 새로운 전사물 동형(isoform), 유전자 융합 및 기타 특징과 대립 유전자 특이적 발현을 모두 식별할 수 있습니다. 사전 지식의 필터에 의해 제한되지 않는 코딩 전사체에 대한 완전한 관점을 제공합니다.

간단한 3단계의 mRNA-Seq

이 원활한 워크플로우 솔루션으로 표준 mRNA 샘플의 코딩 전사체를 분석하세요.

권장 워크플로우 보기

mRNA 시퀀싱의 장점

mRNA-Seq은 전사체 분석에서 유전자 발현 어레이(array)에 비해 여러 가지 이점을 제공합니다.

  • 더 광범위한 동적 범위를 제공하여 유전자 발현의 배율 변화를 보다 민감하고 정확하게 측정할 수 있습니다.
  • 알려진 특징과 새로운 특징을 모두 포착
  • 다양한 종에 적용 가능
어레이에서 mRNA-Seq으로 전환

Expression Analysis는 mRNA-Seq 결과를 이전 어레이 데이터와 쉽게 비교할 수 있는 방법입니다.

인터뷰 읽어보기

전사체에 대한 정확한 고해상도 보기

비율 압축은 동적 범위를 줄이고 측정된 전사 변화를 가리거나 변경할 수 있는 유전자 발현 어레이의 확립된 기술적 한계입니다.1–3 반면, mRNA-Seq은 이러한 편향의 영향을 받지 않으며 유전자 발현 변화를 보다 포괄적이고 정확하게 측정할 수 있습니다.

또한, mRNA-Seq은 가닥 정보를 제공하여 역배열 발현을 검출하고, 중복되는 전사물을 보다 정확하게 정량화할 수 있으며, 정렬 가능한 리드(read)를 높일 수 있습니다.

자폐증과 mRNA-Seq

Stanley Lapidus(SynapDx의 사장, CEO 및 창립자)는 회사가 자폐증 연구에 mRNA-Seq을 어떻게 활용하고 있는지 설명합니다.

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Explore the NextSeq 1000 & 2000 Systems

With over 75 breakthrough innovations, these sequencing systems offer dry instrumentation, easier run setup, and fast secondary analysis with DRAGEN software onboard. Experience our simplest workflows yet, and perform a broad range of emerging and mid-throughput sequencing applications.

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강화된 RNA-Seq 라이브러리 준비 솔루션을 통해 유전자 발현(gene expression)을 정량화하고, 코딩 전사체(coding transcriptome)의 알려진 동형(isoform)과 새로운 동형을 식별하고, 유전자 융합(gene fusion)을 검출하며, 대립 유전자 특이적 발현(allele-specific expression)을 측정합니다.

더 알아보기

포괄적인 mRNA-Seq 워크플로우

Illumina의 sequencing by synthesis(SBS) chemistry는 가장 널리 활용되고 있는 NGS 기술로, 전 세계 시퀀싱 데이터의 약 90%가 이 기술을 통해 생성됩니다.*

업계를 선도하는 고품질 데이터에 더해, Illumina는 라이브러리 준비에서부터 데이터 분석 및 생물학적 해석에 이르기까지 전체 과정을 간소화하는 통합 mRNA-Seq 워크플로우를 제공합니다.

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All the information you need, from BeadChips to library prep to sequencer selection and analysis. Use this guide to select the best tools for your lab.

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참고 문헌
  1. Shi L, Tong W, Su Z, et al. Microarray scanner calibration curves: characteristics and implications. BMC Bioinformatics. 2005;6 Suppl 2:S11.
  2. Naef F, Socci ND, Magnasco M. A study of accuracy and precisions in oligonucleotide arrays: extracting more signal at large concentrations. Bioinformatics. 2003;19:178-184.
  3. Yuen T, Wurmbach E, Pfeffer RL, Ebersole BJ, Sealfon SC. Accuracy and calibration of commercial oligonucleotide and custom cDNA microarrays. Nucleic Acids Res. 2002;30:e48.

*Data calculations on file. Illumina, Inc., 2015