표적 RNA 시퀀싱
표적 RNA 시퀀싱 소개
표적 RNA 시퀀싱(RNA-Seq)은 관심 대상 특정 전사물을 선택하고 시퀀싱하는 매우 정확한 방법입니다. 이는 정량적 정보와 정성적 정보를 모두 제공합니다. 표적 RNA-Seq은 인리치먼트(enrichment) 또는 앰플리콘(amplicon) 기반 접근법을 통해 달성할 수 있으며, 두 가지 접근법 모두 관심 대상 유전자 세트에서 유전자 발현 분석을 가능하게 합니다. 또한 인리치먼트 분석은 포르말린 고정 파라핀 임베디드(FFPE) 조직을 포함한 다양한 샘플 유형에서 알려지거나 새로운 유전자 융합 파트너를 모두 검출할 수 있는 기능을 제공합니다.
표적 인리치먼트 RNA-Seq의 장점
RNA 인리치먼트는 양적 발현 정보를 제공하고 작은 변이와 유전자 융합(gene fusion)을 검출합니다. RNA 인리치먼트는 다음의 특징을 제공합니다.
- FFPE 조직과 같은 까다로운 샘플과 호환
- 낮은 사용량(총 RNA 10 ng 또는 FFPE RNA 20~100 ng 필요)
- 알려지거나 새로운 융합 유전자 파트너를 모두 검출
- 넓은 동적 범위로 유전자 발현 프로파일링
표적 앰플리콘 RNA-Seq의 장점
관심 대상 RNA 시퀀스에 초점을 맞추도록 RNA 발현 패널을 설계하거나 완전히 최적화되고 실험적으로 검증된 패널에 사용자 지정 콘텐츠를 추가할 수 있습니다.
- 관심 대상 전사물을 측정하기 위해 매우 정확하고 구체적인 방법 제공
- 차등 발현 분석, 대립 유전자 특이적 발현 측정 및 유전자 융합 검증을 위한 정성적, 정량적 정보 제공
- 수십에서 수천 개의 표적을 동시에 측정
- 저품질 또는 FFPE 유래 RNA 샘플과 호환 가능
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더 알아보기RNA Sequencing Considerations
Each RNA-Seq experiment type—whether it’s gene expression profiling, targeted RNA expression, or small RNA analysis—has unique requirements for read length and depth. This bulletin reviews experimental considerations and offers resources to help with study design.
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Illumina는 라이브러리 준비에서부터 데이터 분석 및 생물학적 해석에 이르기까지 전체 과정을 간소화하는 통합적 표적 RNA-Seq 워크플로우를 제공합니다.
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*Data calculations on file. Illumina, Inc., 2015