표적 RNA 시퀀싱
표적 RNA 시퀀싱 소개
표적 RNA 시퀀싱(RNA-Seq)은 관심 대상 특정 전사물을 선택하고 시퀀싱하는 매우 정확한 방법입니다. 이는 정량적 정보와 정성적 정보를 모두 제공합니다. 표적 RNA-Seq은 인리치먼트(enrichment) 또는 앰플리콘(amplicon) 기반 접근법을 통해 달성할 수 있으며, 두 가지 접근법 모두 관심 대상 유전자 세트에서 유전자 발현 분석을 가능하게 합니다. 또한 인리치먼트 분석은 포르말린 고정 파라핀 임베디드(FFPE) 조직을 포함한 다양한 샘플 유형에서 알려지거나 새로운 유전자 융합 파트너를 모두 검출할 수 있는 기능을 제공합니다.
표적 인리치먼트 RNA-Seq의 장점
RNA 인리치먼트는 양적 발현 정보를 제공하고 작은 변이와 유전자 융합(gene fusion)을 검출합니다. RNA 인리치먼트는 다음의 특징을 제공합니다.
- FFPE 조직과 같은 까다로운 샘플과 호환
- 낮은 사용량(총 RNA 10 ng 또는 FFPE RNA 20~100 ng 필요)
- 알려지거나 새로운 융합 유전자 파트너를 모두 검출
- 넓은 동적 범위로 유전자 발현 프로파일링
표적 앰플리콘 RNA-Seq의 장점
관심 대상 RNA 시퀀스에 초점을 맞추도록 RNA 발현 패널을 설계하거나 완전히 최적화되고 실험적으로 검증된 패널에 사용자 지정 콘텐츠를 추가할 수 있습니다.
- 관심 대상 전사물을 측정하기 위해 매우 정확하고 구체적인 방법 제공
- 차등 발현 분석, 대립 유전자 특이적 발현 측정 및 유전자 융합 검증을 위한 정성적, 정량적 정보 제공
- 수십에서 수천 개의 표적을 동시에 측정
- 저품질 또는 FFPE 유래 RNA 샘플과 호환 가능
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RNA 시퀀싱 라이브러리 준비
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RNA 라이브러리 준비에 대해 자세히 알아보기RNA Sequencing Considerations
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표적 RNA-Seq 워크플로우
Illumina의 sequencing by synthesis(SBS) chemistry는 가장 널리 활용되고 있는 NGS 기술로, 전 세계 시퀀싱 분석 데이터의 약 90%가 이 기술을 통해 생성됩니다.*
Illumina는 라이브러리 준비에서부터 데이터 분석 및 생물학적 해석에 이르기까지 전체 과정을 간소화하는 통합적 표적 RNA-Seq 워크플로우를 제공합니다.
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Identify sequencing panels or microarrays that target your genes of interest. Search panels by gene, or find genotyping arrays by genomic location, variant ID, or species.
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*Data calculations on file. Illumina, Inc., 2015