RNA 엑솜 캡처 시퀀싱
RNA 엑솜 캡처 시퀀싱 소개
유전자 융합 발견 역량을 완전히 활용하면서 까다로운 샘플에 대해서도 비용 효율적이고 정확하며 민감한 RNA 엑솜 분석을 실현할 수 있습니다. 많은 RNA 엑솜 시퀀싱 방법은 정해진 수의 알려진 전사물에 초점을 맞추거나 고가의 딥 시퀀싱을 필요로 합니다. RNA 엑솜 캡처 시퀀싱은 RNA-Seq과 엑솜 인리치먼트를 결합하여 이러한 문제를 극복합니다.
이 방법은 전사체의 코딩 영역만 캡처하므로 비엑솜 캡처 방법보다 처리량이 높고 시퀀싱 뎁스(depth)가 더 낮습니다. RNA 엑솜의 시퀀스 특이적 캡처는 poly-A 꼬리의 존재 여부에 의존하지 않습니다. 따라서 RNA 엑솜 캡처 시퀀싱은 품질이 낮은 샘플 또는 제한된 출발 물질을 사용하는 RNA-Seq에 이상적입니다.
RNA 엑솜 캡처 시퀀싱의 장점
전사체 코딩 영역을 분리하면 전체 RNA 시퀀싱의 리드 뎁스보다 훨씬 적은 양으로 발견 역량을 극대화할 수 있습니다.
- 높은 샘플 처리량과 비용 효율성을 가능하게 함
- 경제성을 위해 가치가 높은 콘텐츠에 집중
- 포르말린 고정 파라핀 포매(FFPE) 조직 등 품질이 저하된 샘플에서 고품질 데이터를 확보
- 적은 샘플 사용량으로(최소 10 ng의 총 RNA) 높은 민감도 유지
NGS로 전사체 분석
Illumina의 저명한 과학자 Gary Schroth 박사가 RNA-Seq 기술의 최신 발전을 시연합니다. 최신 RNA 라이브러리 준비 방법을 통해 단일 세포 또는 FFPE 조직과 같은 까다로운 샘플에서 전사체 분석을 수행하는 방법을 알아보세요.
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RNA 엑솜 캡처 시퀀싱 워크플로우
업계를 선도하는 고품질 데이터 이외에도, Illumina는 라이브러리 준비에서부터 데이터 분석 및 생물학적 해석에 이르기까지 전체 과정을 간소화하는 통합 RNA 엑솜 캡처 워크플로우를 제공합니다.
주요 제품
NextSeq 1000 & 2000 Systems
Groundbreaking benchtop sequencers allow you to explore new discoveries across a variety of current and emerging applications, with higher efficiency and fewer restraints.
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Illumina Ribo-Zero Plus rRNA Depletion Kit
The stand-alone Illumina Ribo-Zero Plus kit allows for ribosomal RNA removal in human, mouse, rat, and bacterial samples.
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Illumina RNA Prep with Enrichment
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RNA Sequencing Considerations
Each RNA-Seq experiment type—whether it’s gene expression profiling, targeted RNA expression, or small RNA analysis—has unique requirements for read length and depth. This bulletin reviews experimental considerations and offers resources to help with study design.
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RNA-Seq Data Analysis
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Gene Panel and Array Finder
Identify sequencing panels or microarrays that target your genes of interest.
NextSeq 1000 and NextSeq 2000 single-cell RNA sequencing solution
This cost-effective, flexible workflow measures gene expression in single cells and offers high-resolution analysis to discover cellular differences usually masked by bulk sampling methods. This app note outlines the workflow, provides example study designs and throughput charts, and more.