NovaSeq X 시리즈 주문
발전된 화학 반응, 광학 및 인포매틱스가 결합되어 뛰어난 속도와 데이터 품질, 뛰어난 처리량과 확장성을 제공합니다.
TruSight RNA 융합 패널은 연구용 단일 NGS 분석에서 암과 관련된 507개의 융합 관련 유전자를 다루며, 4일 내에 RNA의 결과를 제공합니다.
TruSight RNA Fusion Panel
FFPE 및 기타 암 연구 검체에서 얻은 507개의 유전자를 포괄하는 포괄적인 유전자 융합 검출.
2.5일
Assay 시간
11시간
수작업 시간
Total RNA 10 ng, FFPE RNA 20~100 ng
사용량
개요
암 관련 융합 유전자에 대한 종합적인 관점
TruSight RNA 융합 패널은 한 번의 분석으로 수백 개의 유전자를 다루어, 1차 검사 시 융합 검출 가능성을 높입니다.
간단하고 간소화된 워크플로우
간단한 통합 워크플로우에는 라이브러리 준비, 시퀀싱 및 데이터 분석이 포함되며 샘플 수에 따라 확장할 수 있습니다. RNA 샘플은 벤치탑 시스템에서 다중화 및 시퀀싱하여 실험실 예산을 극대화할 수 있습니다.
기기 내 소프트웨어
기기 내 유전자 융합 검출은 추가적인 바이오인포매틱스 지원 없이 검사실에 NGS 기반 융합 검출을 제공합니다. 이 분석은 검출된 융합, 관련 질병 연관성(Mitelman 데이터베이스로 확인), 융합을 뒷받침하는 판독의 증거를 제공한다.
사양
| Assay 시간 | 2.5일 |
|---|---|
| 자동화 상세 정보 | 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기 |
| Cancer type | Pan-cancer, Hematologic, Solid tumor |
| 설명 | 암 연구를 위한 비용 효과적인 NGS 솔루션을 제공하여 고형 종양, 육종, 혈액암을 포함한 여러 암 유형에 관여하는 507개의 유전자를 심층적으로 포괄합니다. |
| 수작업 시간 | 11시간 |
| 사용량 | Total RNA 10 ng, FFPE RNA 20~100 ng |
| Instruments | MiSeq System, NextSeq 550 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System, NextSeq 500 System |
| 방법 | Targeted RNA sequencing, Target enrichment |
| Nucleic acid type | RNA |
| 특수 샘플의 종류 | Low-input samples, FFPE tissue |
| Species category | Human |
| Technology | Sequencing |
| 변이 클래스 | Gene fusions |
필수 제품
세트 A 및 세트 B 키트 시약을 모두 구매해야 하며, 각각 12개의 고유 인덱스가 포함됩니다.
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결과
애플리케이션
TruSight RNA 융합 패널은 혈액, 골수 또는 FFPE 검체를 사용하여 여러 암 유형의 507개 융합 관련 유전자에서 알려진 파트너 및 새로운 파트너와의 유전자 융합 검출 연구를 가능하게 합니다.
예시 워크플로우
준비
TruSight RNA Fusion Panel
프로젝트 권장 사항
| 기기 | Recommended number of samples | Read length |
|---|---|---|
| MiniSeq System | Samples per run: mid output: 2-3, high output: 8 (based on 3 million reads per sample) |
2 × 76 bp(최대 권장) |
| MiSeq System | 8 samples per run with v3 reagents (based on 3 million reads per sample) |
2 × 76 bp(최대 권장) |
| NextSeq 550 System | 24 samples per run (mid output; based on 3 million reads per sample) |
2 × 76 bp(최대 권장) |
관련 애플리케이션 및 방법
Sequencing- and microarray-based technologies offer complementary approaches for identifying chromosomal abnormalities in cancer.
Find FFPE RNA sequencing solutions that yield high-quality results from degraded FFPE tissues and other low-quality samples.
Detect cancer gene expression and transcriptome changes and identify novel cancer transcripts with RNA next-generation sequencing (RNA-Seq).
문서
비교하기
| TruSight RNA Fusion Panel | AmpliSeq for Illumina Focus Panel | AmpliSeq for Illumina Comprehensive Panel v3 | ||
|---|---|---|---|---|
| Assay 시간 | 2.5일 | 5~6시간(라이브러리 준비만 해당, 라이브러리 정량화, 정규화 또는 통합 시간은 포함되지 않음) | 5~6시간(라이브러리 준비만 해당, 라이브러리 정량화, 정규화 또는 통합 시간은 포함되지 않음) | |
| 자동화 상세 정보 | 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기 | |||
| Cancer type | Pan-cancer, Hematologic, Solid tumor | Solid tumor | Solid tumor | |
| 설명 | 암 연구를 위한 비용 효과적인 NGS 솔루션을 제공하여 고형 종양, 육종, 혈액암을 포함한 여러 암 유형에 관여하는 507개의 유전자를 심층적으로 포괄합니다. | 고형암과 연관되어 있는 52개 유전자에 대한 체세포 분석 연구용입니다. | 고형암과 연관되어 있는 유전자*의 핫스팟 및 전장 표적에 대한 체세포 분석 연구. | |
| 수작업 시간 | 11시간 | < 1.5시간 | <1.5시간 | |
| 사용량 | Total RNA 10 ng, FFPE RNA 20~100 ng | 1~100 ng(풀당 10 ng 권장) | 1~100 ng(풀당 10 ng 권장) | |
| Instruments | MiSeq System, NextSeq 550 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System, NextSeq 500 System | MiSeq System, iSeq 100 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System | NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NextSeq 550Dx in Research Mode | |
| 방법 | Targeted RNA sequencing, Target enrichment | Targeted DNA sequencing, Amplicon sequencing, Targeted RNA sequencing | Targeted DNA sequencing, Amplicon sequencing, Targeted RNA sequencing | |
| Nucleic acid type | RNA | DNA, RNA | DNA, RNA | |
| 특수 샘플의 종류 | Low-input samples, FFPE tissue | FFPE tissue | FFPE tissue | |
| Species category | Human | Human | Human | |
| Technology | Sequencing | Sequencing | Sequencing | |
| 변이 클래스 | Gene fusions | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Somatic variants, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs) | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Somatic variants, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs) |
선택 도구:
Library Prep and Array Kit Selector
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그림 자료
TruSight RNA 융합 포획 화학
TruSight RNA 융합 패널은 총 RNA로부터 표적 관심 영역을 분리하는 간단하고 간결한 방법을 제공합니다.
TruSight RNA 융합 검출과 FISH 및 RT-PCR의 일치
TruSight RNA 융합 패널을 사용한 FFPE 검체 내 융합 검출
Trusight RNA Fusion 패널은 고품질 및 저품질 RNA 샘플 유형의 고성능에 최적화되어 있습니다. 라이브러리 준비에는 최소 10 ng의 총 RNA 또는 20 ng의 FFPE RNA가 필요합니다. 이러한 낮은 입력 요구 사항으로 인해 이 패널은 제한된 수량의 샘플에 대한 신뢰할 수 있는 표적 분석에 이상적입니다.
TruSight RNA Fusion Panel Set A (48 samples)
RS-304-1002
RNA 라이브러리 준비와 시퀀싱을 위한 총 48개 RNA 샘플(FFPE 포함) 인리치먼트용 키트형 시약. 각 키트에는 12개의 고유 인덱스(2, 4, 5, 6, 7, 12, 13, 14, 15, 16, 18, 19)가 있습니다.
List Price:
Discounts:
TruSight RNA Fusion Panel Set B (48 samples)
RS-304-1003
RNA 라이브러리 준비와 시퀀싱을 위한 총 48개 RNA 샘플(FFPE 포함) 인리치먼트용 키트형 시약. 각 키트에는 12개의 고유 인덱스(1, 3, 8, 9, 10, 11, 20, 21, 22, 23, 25, 27)가 있습니다.
List Price:
Discounts:
TruSight RNA Fusion Oligo Panel
20046101
TruSight RNA Fusion Oligo Panel에는 1플렉스 인리치먼트를 사용하는 경우 시퀀싱을 위한 총 96개의 RNA 샘플에 충분한 올리고가 포함되어 있고, 3플렉스* 인리치먼트를 사용하는 경우 시퀀싱을 위한 총 288개의 RNA 샘플에 충분한 올리고가 포함되어 있습니다. 이 패널에는 라이브러리 준비가 포함되어 있지 않습니다. *멀티플렉싱 인리치먼트를 허용하는 라이브러리 준비 워크플로우에만 적용됩니다.
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요약
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카탈로그 ID
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단가
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카탈로그 ID:수량:
FAQ
높은 신뢰도의 융합 호출은 분할 판독 점수, 쌍 판독 점수, 부실 상동성 및 기타 특징의 계산된 값에서 얻은 점수를 기반으로 융합이 임계값 필터를 충족함을 의미합니다.
신뢰도가 낮은 융합 호출은 융합이 Mitelman 데이터베이스에 반복되는 것으로 나열되지만 최소 임계값 점수를 통과하거나 충족하지 않음을 의미합니다.
자세한 내용은 로컬 Run Manager RNA 융합 분석 모듈 워크플로 가이드 를 참조하십시오.
융합 점수는 융합 호출의 신뢰도를 반영하며, 여기서 0은 낮음, 1은 높음입니다. > 0.6점은 높은 신뢰도의 융합 호출로 보고된다.
이 분석은 일부 자동화 제공업체에 의해 자동화되고 있습니다. 이 워크플로를 자동화하는 데 관심이 있는 경우 계정 관리자에게 문의하십시오.
전사체의 과발현 또는 결실을 초래하는 염색체 전위는 유전자 발현 수준에 반영될 수 있지만 융합 유전자를 생성하지는 않을 것이다. Local Run Manager RNA Fusion 모듈은 유전자 발현 변화를 검출하도록 설계되지 않았습니다. 이러한 변화를 감지하려면 BaseSpace Sequence Hub의 RNA-Seq 정렬 앱을 사용하는 것이 좋습니다. 또한, DNA에서 이러한 소견을 확인하는 것이 권장된다.
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결과
많이 구매한 제품
MiSeq Reagent Kit v3
클러스터 밀도와 판독 길이를 높여 이전 버전에 비해 시퀀싱 품질 점수를 개선하는 최적화된 시약 키트입니다.
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