AmpliSeq for Illumina Custom RNA Panel

최대 1200개의 관심 대상 유전체 표적을 시퀀싱하도록 최적화된 맞춤형 표적 RNA 연구 패널입니다.

5.5~7.5시간

Assay 시간

< 1.5시간

수작업 시간

1 ng

사용량

상세한 정보는 사양표를 확인하세요.

개요

AmpliSeq for Illumina Custom RNA 패널을 사용하여 단일 분석에서 12~1200개의 유전자 표적에서 유전자 발현을 측정합니다. 웹 기반 분석 설계 소프트웨어 도구인 DesignStudio Software를 사용하여 20,000개 이상의 인간 RefSeq 유전자 메뉴에서 맞춤형 표적 패널을 쉽게 설계할 수 있습니다.

주요 기능

  • Fast Gene Expression Profiling - < 1.5시간의 실습 시간으로 6시간 내에 라이브러리를 준비합니다. 결과는 < 2일 후에 이용할 수 있습니다.

  • 저품질, 저수량 샘플 입력 - 포르말린 고정, 파라핀 포매(FFPE) 조직에서 최소한의 입력으로 시작할 때에도 고품질 데이터를 얻을 수 있습니다.

  • DNA-분석 솔루션 - 라이브러리 준비, 시퀀싱 및 분석을 아우르는 포괄적인 워크플로우를 활용합니다.

Illumina 맞춤형 RNA 패널용 AmpliSeq는 Illumina 중합효소 연쇄반응(PCR) 기반 라이브러리 준비, 합성에 의한 Illumina 염기서열분석(SBS) 화학 및 차세대 염기서열분석(NGS) 기술, 자동 분석을 위한 AmpliSeq를 포함하는 통합 워크플로우의 일부입니다.

Ampliseq for Illumina에 대해 자세히 알아보기


사양


필수 제품

AmpliSeq for Illumina 라이브러리 준비 워크플로우에는 패널, 라이브러리 준비 시약(Library Plus) 및 인덱스가 필요합니다. 부속품 제품은 cDNA 합성 및 샘플 식별에도 사용할 수 있습니다.

AmpliSeq for Illumina RNA Panel로 작업할 때 Total RNA를 cDNA로 변환하려면 AmpliSeq cDNA Synthesis for Illumina가 필요합니다.

Illumina용 AmpliSeq 라이브러리 이퀄라이저는 Illumina 라이브러리 준비 방법에 AmpliSeq를 사용하는 동안 라이브러리를 정규화하기 위해 선택 사항이지만 사용하기 쉬운 권장 솔루션입니다.

AmpliSeq ERCC RNA Spike-In Mix for Illumina는 External RNA Controls Consortium(ERCC)에서 개발한 외부 RNA 컨트롤 세트입니다. 대조군은 차등 유전자 발현을 정량화하기 위해 전사체 패널이 있는 Illumina 분석을 위해 AmpliSeq와 함께 사용할 수 있는 표지되지 않은 폴리아데닐화 전사물 세트로 구성된다. Illumina(Illumina에서 별도 판매)에는 AmpliSeq ERCC RNA Companion 패널이 필요합니다.

Illumina용 AmpliSeq ERCC RNA Companion Panel은 전사체 패널로 Illumina 분석을 위해 AmpliSeq를 수행할 때 차등 유전자 발현을 정량화하기 위해 AmpliSeq ERCC RNA Spike-In Mix for Illumina(Illumina에서 별도 판매)와 함께 사용하도록 고안되었습니다.

/ 결과

애플리케이션

예시 워크플로우


관련 애플리케이션 및 방법

비교하기

선택 도구:

그림 자료

복제본 간의 높은 일치도

Illumina 맞춤형 RNA 패널(208 앰플리콘 패널 크기)을 위한 AmpliSeq를 사용하여 10 ng의 범용 인간 RNA로부터 라이브러리를 제조하고, MiSeq 시스템에서 시퀀싱하였다. 결과는 동일한 RNA 샘플의 두 복제물 간에 높은 일치(R2 = 0.997)를 보여준다. R2 는 데이터 상관관계의 통계적 측정이다.

High Read 정렬

AmpliSeq for Illumina Custom RNA Panel은 연구자들이 관심 유전자 전반에 걸쳐 차등 유전자 발현을 분석할 수 있도록 합니다. 분석 성능을 입증하기 위해, 다양한 크기(앰플리콘 수)의 Illumina 맞춤형 RNA 패널에 대해 5개의 AmpliSeq를 사용하여 인간 뇌 참조 RNA 및 범용 인간 RNA를 분석하였다. 라이브러리를 MiSeq 시스템에서 시퀀싱하였다.

패널 (1)

AmpliSeq™ for Illumina® Custom RNA Panel

20020496

표적 맞춤형 RNA 패널. Library PLUS 및 인덱스 어댑터는 별도 판매됩니다.

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맞춤 설정

List Price:

Discounts:

라이브러리 프렙 (3)

AmpliSeq™ Library PLUS (24 Reactions) for Illumina®

20019101

24개의 라이브러리를 준비하기 위한 시약이 포함되어 있습니다. AmpliSeq for Illumina 패널 및 인덱스 어댑터를 별도로 구입하십시오.

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Discounts:

AmpliSeq™ Library PLUS (96 Reactions) for Illumina®

20019102

96개의 라이브러리를 준비하기 위한 시약이 포함되어 있습니다. AmpliSeq for Illumina 패널 및 인덱스 어댑터를 별도로 구입하십시오.

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Discounts:

AmpliSeq™ Library PLUS (384 Reactions) for Illumina®

20019103

384 라이브러리를 준비하기 위한 시약이 포함되어 있습니다. AmpliSeq for Illumina 패널 및 인덱스 어댑터를 별도로 구입하십시오.

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인덱스 어댑터 (6)

AmpliSeq™ UD Indexes for Illumina® (24 Indexes, 24 Samples)

20019104

24개의 검체 라벨링에 충분한 24개의 지수를 포함한다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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AmpliSeq™ CD Indexes Set A for Illumina®

20019105

96개의 검체 라벨링에 충분한 96개의 색인을 포함한다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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AmpliSeq™ CD Indexes Set B for Illumina®

20019106

96개의 검체 라벨링에 충분한 96개의 색인을 포함한다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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Discounts:

AmpliSeq™ CD Indexes Set C for Illumina®

20019107

96개의 검체 라벨링에 충분한 96개의 지수를 포함한다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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AmpliSeq™ CD Indexes Set D for Illumina®

20019167

96개의 검체 라벨링에 충분한 96, 8 bp 지수를 포함한다. 라이브러리 준비 시약과 프로브 패널을 별도로 구입합니다.

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AmpliSeq™ CD Indexes Set A-D for Illumina® (384 Indexes, 384 Samples)

20031676

Illumina, 세트 A, 세트 B, 세트 C 및 세트 D용 AmpliSeq CD 인덱스 4세트가 포함됩니다. 각 세트에는 96개의 샘플에 라벨을 부착하기에 충분한 96, 8bp 인덱스가 포함되어 있습니다. 라이브러리 준비 및 프로브 패널을 별도로 구입합니다.

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서비스 (1)

AmpliSeq for Illumina RNA Library Prep Training

20023393

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액세서리 제품 (2)

Ampliseq™ cDNA Synthesis for Illumina®

20022654

Illumina RNA 패널(예: AmpliSeq for Illumina Immune Response, Immune Repertoire Plus, TCR 베타 패널, 골수, 전사체 인간 유전자 발현, 포커스, 종합 패널 v3 및 맞춤형 또는 커뮤니티 RNA 패널)용 AmpliSeq로 작업할 때 총 RNA를 cDNA로 변환하기 위한 반응 혼합물 및 효소 혼합물 포함. 반응 수는 패널에 따라 다르다(예: Illumina 면역반응에 대한 AmpliSeq, 포커스, 종합 패널 v3, 맞춤형 패널에 대한 키트당 100건의 반응, Illumina 전사체 인간 유전자 발현, 골수, 면역 레퍼토리 플러스, TCR 베타 패널에 대한 AmpliSeq 키트당 200건의 반응).

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AmpliSeq™ Library Equalizer for Illumina®

20019171

시퀀싱을 위해 Illumina 라이브러리용 AmpliSeq를 준비할 때 라이브러리 정규화를 위한 비드 및 시약이 포함됩니다.

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선택 품목 요약

제품

수량

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NovaSeq X 시리즈 주문

발전된 화학 반응, 광학 및 인포매틱스가 결합되어 뛰어난 속도와 데이터 품질, 뛰어난 처리량과 확장성을 제공합니다.

MiSeq Reagent Kit v3

클러스터 밀도와 판독 길이를 높여 이전 버전에 비해 시퀀싱 품질 점수를 개선하는 최적화된 시약 키트입니다.

TruSight Oncology 500

FFPE 조직의 모든 주요 변이 계열과 유전자 시그니처(TMB, MSI, HRD)를 포함하는 대형 범암 패널로 CGP를 활성화합니다.

Illumina DNA Prep

광범위한 시퀀싱 애플리케이션에 사용하기 위한 매우 정확한 데이터를 생성하는 효율적이고 빠른 통합 라이브러리 프렙 워크플로우입니다.

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