멀티플렉스 시퀀싱
더 짧은 시간에 더 많은 샘플 처리
런당 시퀀싱되는 샘플 수를 늘리고 고유한 듀얼 인덱스(unique dual index, UDI) 어댑터를 사용하여 고처리량 시퀀싱을 최적화합니다.
샘플 멀티플렉싱 개요
멀티플렉스 시퀀싱이라고도 하는 샘플 멀티플렉싱을 사용하면 Illumina 기기에서 한 번의 런 중에 많은 수의 라이브러리를 풀링하고 동시에 시퀀싱할 수 있습니다. 샘플 멀티플렉싱은 특정 유전체 영역을 표적으로 하거나 더 작은 유전체로 작업할 때 유용합니다. 샘플을 풀링하면 비용이나 시간을 크게 늘리지 않고도 한 번의 런에서 분석되는 샘플 수가 기하급수적으로 증가합니다.
멀티플렉스 시퀀싱을 사용하면 차세대 시퀀싱(next-generation sequencing, NGS) 라이브러리 준비 중에 각 DNA 절편에 개별 "바코드" 시퀀스가 추가되어 최종 데이터 분석 전에 각 리드를 식별하고 분류할 수 있습니다. 이러한 바코드 또는 인덱스 어댑터는 Library Prep Kit 및 애플리케이션에 따라 두 가지 주요 인덱싱 전략 중 하나를 따를 수 있습니다.
멀티플렉스 시퀀싱 주요 특징
- 빠른 고처리량 전략: 단일 실험 중에 많은 수의 샘플을 동시에 시퀀싱할 수 있습니다.
- 비용 효율적인 방법: 샘플 풀링은 시간을 절약하고 시약 사용을 줄여 생산성을 향상시킵니다.
- 간소화된 분석: Illumina 데이터 분석 소프트웨어를 사용하여 "바코드"로 자동 샘플 식별
Sample Multiplexing Facilitates Microbial Studies
연구자들은 Illumina 시퀀서의 속도와 멀티플렉스 시퀀싱 기능을 활용하여 미시시피 강의 미생물을 식별합니다.
인터뷰 읽어 보기멀티플렉스 시퀀싱 관련 주제
듀얼 인덱스 시퀀싱
멀티플렉싱용 라이브러리를 준비할 때는 고유한 듀얼 인덱스(unique dual index)를 사용하는 것이 좋습니다. 고유한 듀얼 인덱스를 사용하면 다른 인덱싱 전략에 비해 런당 시퀀싱되는 샘플 수를 늘리고 샘플당 비용을 줄일 수 있습니다.
더 알아보기고유한 분자 식별자
고유한 분자 식별자(Unique molecular identifier, UMI)는 시퀀싱 중에 오류 수정과 정확도 향상을 제공하는 일종의 분자 바코드입니다. UMI를 사용한 시퀀싱은 위양성(false-positive) 변이 콜 비율을 줄이고 변이 검출 민감도를 높일 수 있습니다.
더 알아보기인덱스 호핑 최소화
멀티플렉싱을 사용하면 사용된 라이브러리 준비 방법이나 시퀀싱 시스템에 관계없이 인덱스 호핑의 가능성이 있습니다. 인덱스 호핑의 영향을 최소화하는 데 도움이 되는 모범 사례를 알아보세요.
더 알아보기Chan Zuckerberg Biohub 및 NovaSeq 시스템
Chan Zuckerberg Biohub의 연구자들은 혁신적인 실험을 수행하고 유전체학에서 새로운 협업을 형성하기 위해 노력하고 있습니다. NovaSeq 시스템을 사용하면 인간의 건강을 개선하는 데 도움이 될 수 있도록 의학 연구용으로 많은 샘플을 번들로 함께 묶을 수 있습니다.
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관련 콘텐츠
- 고처리량 시퀀싱 방법: 단일세포 및 공간 분석을 포함하여 데이터가 풍부한 새로운 방법을 비용 효율적으로 실행하고 더 많은 샘플을 처리하여 통계적 역량을 개선하세요.
- 라이브러리 준비 자동화: 대량의 시퀀싱 라이브러리를 준비해야 하는 검사실을 위해 설계된 자동 액체 취급 솔루션에 대해 알아보세요.
- 풀링 계산기: 멀티플렉스 시퀀싱용으로 풀링된 라이브러리를 적절한 농도로 희석해 보세요.
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시퀀싱
연구자는 Illumina 시퀀싱을 통해 다양한 유기체의 유전체(genome), 전사체(transcriptome) 또는 후성유전체(epigenome)와 관련된 수많은 질문을 해 볼 수 있습니다.
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