태그멘테이션
온비드 태그멘테이션으로 라이브러리 준비 시간 단축
새로운 화학 반응은 DNA 추출, 절편화, 라이브러리 준비 및 라이브러리 표준화를 통합합니다.
태그멘테이션이란 무엇인가?
태그멘테이션(tagmentation)은 분석을 위해 절편화되지 않은 DNA를 절단하고 태그를 지정하는 라이브러리 준비의 초기 단계입니다.
온비드 태그멘테이션(On-bead tagmentation) 라이브러리 준비는 용액 내 태그멘테이션 반응과 비교하여 보다 균일한 태그멘테이션 반응을 위해 bead-linked transposome(BLT)을 사용합니다. Bead-linked transposome 화학 반응은 DNA 추출, 절편화, 라이브러리 준비 및 라이브러리 표준화 단계를 통합합니다. 이렇게 워크플로우 단계의 수를 단축하면 필요한 샘플 입력이 줄어들어 실습 및 작업 시간을 줄일 수 있습니다.
온비드 태그멘테이션이 더 나은 이유
솔루션 내 태그멘테이션에 비해 bead-linked transposome 라이브러리 준비의 이점은 다음과 같습니다.
- 낮은 샘플 입력 요구 사항
- 라이브러리 정량화 및 표준화 단계가 제거되어 작업 시간이 단축되고 수작업 시간이 줄어듬
- 온비드 절편화로 DNA 절단이 필요하지 않음
- 광범위한 DNA 사용량 범위에서 균일하고 일관된 단편(insert) 크기와 라이브러리 수율
온비드 태그멘테이션은 라이브러리 준비 시간을 줄이는 동시에 DNA 입력량이나 유전체 크기에 관계없이 일관된 단편 크기, 균일한 커버리지 및 최적화된 성능을 제공할 수 있습니다.
더 알아보기실험의 유연성
온비드 태그멘테이션 라이브러리 준비는 귀중한 샘플을 포함하여 다양한 샘플 유형을 사용한 실험에 유연성을 제공하는 넓은 DNA 사용량 범위를 가지고 있습니다. 이 기술은 인간 전장 유전체 시퀀싱, 암 유전체학 연구, 환경 메타지노믹, 전염병 연구, 농업 유전체학 등과 같은 애플리케이션에 이상적이며 다음 용도로도 사용됩니다.
- 모든 (크거나 작은) 종(species)의 DNA 전장 유전체 시퀀싱
- 전장 엑솜 시퀀싱, 고정 패널, 맞춤형 패널, Illumina 및 타사 올리고 공급업체를 포함하여 고유한 분자 식별자가 없는 표적 DNA 인리치먼트 애플리케이션
- RNA 인리치먼트
A Novel Library Prep Technology
Illumina DNA Prep(이전 명칭: Nextera DNA Flex)이 효소 절편화의 단점을 해결하면서 효소 절편화의 편리함을 유지하기 위해 새로운 비드 태그멘트테이션 기술을 어떻게 사용하는지 알아보세요.
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실험에 적합한 태그멘테이션 키트 선택하기
| 애플리케이션 | 제품 | 이점 |
|---|---|---|
| 16s rRNA 시퀀싱, 앰플리콘 시퀀싱, De Novo 시퀀싱, 샷건 시퀀싱, 전장 유전체 시퀀싱 | Nextera XT |
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| 임플리콘 시퀀싱, De Novo 시퀀싱, 샷건 시퀀싱, 전장 유전체 시퀀싱 | Illumina DNA Prep |
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| 인간 전장 유전체 시퀀싱 | Illumina DNA PCR-Free |
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Nextera와 TruSeq 기술 비교
Nextera는 비드 결합 트랜스포좀(bead-linked transposome, BLT) 기술을 사용합니다. 통합 DNA 추출, 자동 절편화, 라이브러리 준비 및 라이브러리 표준화가 프로토콜에 포함됩니다. 이는 전장 유전체 시퀀싱 및 표적 인리치먼트 애플리케이션에 이상적입니다.
TruSeq은 어댑터 라이게이션, 절편화, 말단 복구를 사용하고 Poly(A) 캡처 효율성이 뛰어납니다. 여기에는 별도의 DNA 절단이 필요합니다. 이는 코딩 전사체를 캡처하며, 전체 전사체 RNA-Seq, 엑솜 인리치먼트, 대규모 전체 유전체 재시퀀싱, 표적 재시퀀싱, de novo 시퀀싱, 메타지노믹 및 메틸레이션 연구에 이상적입니다.
요구 사항을 충족하는 기타 기술
자동화
Illumina의 협력사가 Illumina의 라이브러리 준비 포트폴리오를 포괄하는 고처리량 및 저처리량의 초간편 자동화 방법을 개발했습니다.
인덱스 어댑터
런당 시퀀싱되는 샘플 수를 늘리고 고유한 듀얼 인덱스(unique dual index, UDI) 어댑터를 사용하여 고처리량 시퀀싱을 최적화합니다.
UMI
고유한 분자 식별자(unique molecular identifier, UMI)는 오류 수정과 높은 정확도를 제공합니다. 변이 검출 민감도를 높이면서 위양성 변이 결과를 줄일 수 있습니다.