DNA 라이브러리 준비
빠르고 정확한 DNA 라이브러리 준비
PCR 프리 및 온비드 절편화 기술의 혁신은 시간 절약, 유연성 및 향상된 시퀀싱 데이터 성능을 제공합니다
더욱 빨라진 라이브러리 준비를 경험하세요
8시간의 근무 시간이 끝나기 전에 완료되는 DNA 라이브러리 준비 및 인리치먼트 워크플로우를 사용할 준비가 되었습니다. 타임랩스 비디오에서 라이브러리 준비를 비교하는 방법을 알아보세요.
다재다능한 DNA 라이브러리 준비를 사용하면 작은 표적 영역 또는 전체 유전체를 검사할 수 있습니다.
전장 유전체
전장 유전체 저사용량
DNA 전장 유전체
샘플 준비 및 라이브러리 준비를 사용하기 쉬운 하나의 제품으로 결합하여 시퀀싱 준비가 된 샘플을 생성하는 프로세스를 간소화했습니다. 온비드 절편화를 사용하면 라이브러리 정량화가 필요하지 않아 PCR 중복을 방지하여 시간을 절약하고 시퀀싱 데이터 성능이 향상됩니다.
Illumina DNA Prep으로 워크플로우를 간소화하세요
Illumina DNA Prep(이전 Nextera DNA Flex)은 선행 DNA 단편화 프로세스를 간소화하고 DNA 추출, DNA 정량화, 라이브러리 준비 QC 및 라이브러리 정량화와 같은 기타 워크플로우 문제를 해결합니다.
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UMI 포함 인리치먼트
UMI 미포함 인리치먼트
DNA 인리치먼트(enrichment)
Illumina의 인리치먼트 라이브러리 준비 수율은 모든 Illumina 시퀀싱 시스템에서 > 90%의 표적 판독, > 95%의 균일성 및 낮은 PCR 중복율을 제공합니다.1 워크플로우는 단일 90분 혼성화 단계와 10 ng의 낮은 사용량 DNA를 사용합니다. 온비드 태그멘테이션(On-bead tagmentation) chemistry를 통해 폭넓은 DNA 사용량, 다양한 샘플의 종류, 광범위한 애플리케이션을 지원합니다.
Illumina DNA Prep with Enrichment: 간단하고 빠르며 유연함
이 비디오는 인리치먼트 패널 옵션 선택 과정, 라이브러리 준비 및 Illumina DNA Prep with Enrichment(이전의 Nextera Flex for Enrichment) 및 데이터 분석을 위한 인리치먼트 워크플로우를 간략하게 설명합니다.
비디오 보기
DNA 앰플리콘
DNA 앰플리콘(amplicon)
앰플리콘의 울트라 딥 시퀀싱(ultra-deep sequencing)을 통해 효율적인 변이 식별 및 특성화가 가능합니다. 가속 라이브러리 준비는 감소 편향 PCR을 사용하고 젤이 없으므로 하루도 안 되는 시간에 고품질 라이브러리를 준비할 수 있습니다. 기계적 DNA 절편화 및 어댑터 라이게이션.
한눈에 살펴보는 DNA 라이브러리 준비
| 애플리케이션 | 전장 유전체 시퀀싱 | 전장 유전체 시퀀싱 | DNA 인리치먼트 - UMI 없음 |
|---|---|---|---|
| 수작업 시간 | 약 45분 | 1~1.5시간 | 약 2시간 |
| 작업 시간 | 약 1.5시간 | 약 3~4시간 | 약 6.5시간 |
| 입력 | 25~300 ng | 1~500 ng | 10~1000 ng |
| 자동화 가능 | 예 | 예 | 예 |
| PCR 프로토콜 | 아니요 | 예 | 예 |
| 라이브러리 정량화 필요 여부 | 아니요 | 아니요 | 아니요 |
| 절편화 포함 여부 | 예 - 비드 방식 | 예 - 비드 방식 | 예 - 비드 방식 |
| 제품 | Illumina DNA PCR-Free Prep | Illumina DNA Prep | Illumina DNA Prep with Enrichment |
실험에 적합한 DNA 키트 선택하기
| 애플리케이션 | 제품 | 이점 |
|---|---|---|
| 인간 DNA WGS용 | Illumina DNA PCR-Free Prep |
|
| 저사용량 DNA WGS용 | Illumina DNA Prep |
|
| UMI 미포함 DNA 인리치먼트용 | Illumina DNA Prep with Enrichment |
|
태그멘테이션의 이점
비드 결합 트랜스포좀(Bead-linked transposome, BLT) 태그멘테이션은 Illumina의 라이브러리 준비 포트폴리오에 사용되는 혁신적인 기술입니다. 온비드 태그멘테이션을 사용하면 동시에 genomic DNA를 단편화하고 Illumina 시퀀싱 프라이머를 추가하여 이전보다 더 빠르게 시퀀싱 준비가 된 라이브러리를 얻을 수 있습니다. 보조 시약 또는 장비 없이 라이브러리를 표준화하고, 총 작업 소요 시간과 복잡성을 줄입니다.
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어댑터 라이게이션 이해
Illumina의 NGS 라이브러리 준비에 사용되는 또 다른 주요 기술은 일관적으로 고품질의 데이터를 제공하는 것으로 잘 알려져 있는 어댑터 라이게이션(adapter ligation)입니다. 라이브러리는 gDNA 또는 cDNA 샘플을 절편화하고 특수 어댑터를 절편의 양 말단에 결합하여 준비됩니다. 이러한 어댑터에는 시퀀싱 프라이머 하이브리드화 영역의 보체 수가 포함되어 있습니다. 이렇게 하면 인덱스 태그 및 인덱스 프라이머 사이트를 추가하기 위한 추가 PCR 단계가 필요하지 않아 프로세스를 완전히 자동화할 수 있습니다.
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주요 DNA 라이브러리 준비 애플리케이션
Illumina DNA Prep을 사용한 인간 WGS
인간 전장 유전체 시퀀싱(WGS)에 대한 균일한 커버리지를 제공하는 혈액, 타액 또는 genomic DNA의 라이브러리 준비.
Illumina DNA Prep을 사용한 미생물 WGS
바이러스, 세균 및 기타 미생물 종에 대한 균일한 커버리리지를 제공하고 유전체 조립을 개선하는 라이브러리 준비.
Illumina DNA Prep with Enrichment을 사용한 전장 엑솜 시퀀싱
엑솜 콘텐츠의 하이브리드 캡처와 결합된 라이브러리 준비 및 고유한 듀얼 인덱싱.
Illumina DNA Prep with Enrichment와 DRAGEN를 사용한 종양 엑솜 시퀀싱
Illumina DNA Prep을 사용한 엑솜 시퀀싱과 DRAGEN의 분석 역량을 결합하면 FFPE 종양 샘플의 간소화되고 효율적이며 매우 정확한 변이 분석이 가능합니다.
Illumina Library Prep을 최대한 활용할 수 있는 방법을 전문가에게 문의하세요.
Illumina가 귀하의 요구 사항을 살펴보고 추천해 드리겠습니다.
전장 유전체 시퀀싱을 위한 DNA 시퀀싱 예제
라이브러리 준비
시퀀싱
NovaSeq 6000 시스템
단일 S1 플로우 셀을 사용해 종양-정상 쌍이나 생식계열 트리오를 시퀀싱하거나 듀얼 S4 플로우 셀을 사용해 런당 최대 48개의 유전체를 시퀀싱합니다.
분석
관련 솔루션
인덱싱
런당 시퀀싱되는 샘플 수를 늘리고 고유한 듀얼 인덱스(unique dual index, UDI) 어댑터를 사용하여 고처리량 시퀀싱을 최적화합니다.
UMI
고유한 분자 식별자(Unique molecular identifier, UMI)는 오류 수정 및 정확성을 제공하고 위양성(false-positive) 변이 검출을 줄이면서 변이 검출 민감도를 높일 수 있습니다.
자동화
Illumina의 협력사가 Illumina의 라이브러리 준비 포트폴리오를 포괄하는 고처리량 및 저처리량의 초간편 자동화 방법을 개발했습니다.
DNA 시퀀싱
DNA 시퀀싱은 다양한 방법을 통해 작은 표적 영역 또는 전체 유전체에 적용할 수 있으므로 연구자가 건강과 질환을 연구하고 더 잘 이해할 수 있습니다.
