어댑터 라이게이션
라이브러리 준비의 균일성, 정밀도 및 신뢰성
라이게이션 기술은 이제 더 적은 단계로 많은 연구 설계에 대한 유연성을 제공합니다.
진화하는 어댑터 라이게이션
어댑터 라이게이션 기술은 분해된 샘플에서도 높은 커버리지 균일성, 정확한 가닥 정보 및 신뢰할 수 있는 라이브러리 준비로 오랫동안 사용되어 왔습니다.
이제 그 기술이 훨씬 더 발전되었습니다. 보편적인 메틸레이션 어댑터 설계 방식은 초기 라이게이션 단계에서 인덱스 시퀀스를 통합합니다. 정제, 샘플 전송 및 피펫팅 단계가 더욱 줄어듭니다. 이 모든 것이 합쳐져 작업 흐름 효율성이 향상되고 보다 강력한 멀티플렉스 시퀀싱이 가능합니다.
어댑터 라이게이션 기술이란 무엇입니까?
라이게이션 기술은 시퀀싱을 위한 NGS 라이브러리를 구성하는 데 사용됩니다. 이 프로세스는 효소를 사용하여 특수 어댑터를 DNA 절편의 양쪽 끝에 연결합니다. 'A'- 염기가 각 가닥의 두가닥말단에 추가되어 시퀀싱 어댑터에 라이게이션을 위해 준비합니다. 각 어댑터에는 'T' 염기 돌출부가 포함되어 있어 어댑터를 A-테일 절편 DNA에 연결하기 위한 상호보완적인 돌출부를 제공합니다.
우리의 기술은 어떻게 비교됩니까?
Illumina 어댑터 라이게이션은 2011년 이래 9,926개 이상의 간행물에서 인용된 탁월한 기술입니다. 어댑터 라이게이션에는 단일, 페어드 엔드 및 인덱싱 리드를 위한 시퀀싱 프라이머 혼성화 사이트의 완전한 보완성이 포함되어 있습니다. 이렇게 하면 인덱스 태그 및 인덱스 프라이머 사이트를 추가하기 위한 추가 PCR 단계가 필요하지 않습니다. 겔이 없는 프로토콜은 다른 방법에서 볼 수 있는 시간 집약적인 겔 정제 단계를 제거하여 보다 일관되고 완전히 자동화된 프로세스를 가능하게 합니다.
어댑터 라이게이션 기술의 애플리케이션
라이게이션 기술은 고처리량 실험을 위한 보다 저렴한 RNA 시퀀싱을 가능하게 하여 어레이보다 저렴한 비용으로 NGS를 사용하여 유전자 발현 프로파일링 연구를 수행할 수 있게 합니다. 또한 이는 대규모 전체 유전체 재시퀀싱, 표적 재시퀀싱, de novo 시퀀싱, 메타지노믹 및 메틸레이션 연구를 위한 비용 효율적인 DNA 시퀀싱 솔루션을 제공합니다.
이 능률적이고 신속한 라이게이션 기반 라이브러리 준비는 적은 샘플 사용량과 광범위한 RNA-Seq 애플리케이션을 지원합니다. 어댑터 라이게이션 기술은 RNA-Seq, 유전체 시퀀싱 또는 엑솜 인리치먼트와 같은 애플리케이션에 이상적입니다.
자주 함께 구매되는 제품
Nextera와 TruSeq 기술 비교
TruSeq은 어댑터 라이게이션, 절편화, 말단 복구를 사용하고 Poly(A) 캡처 효율성이 뛰어납니다. 여기에는 별도의 DNA 절단이 필요합니다. 이는 코딩 전사체를 캡처하며, 전체 전사체 RNA-Seq, 엑솜 인리치먼트, 대규모 전체 유전체 재시퀀싱, 표적 재시퀀싱, de novo 시퀀싱, 메타지노믹 및 메틸레이션 연구에 이상적입니다.
Nextera는 비드 결합 트랜스포좀(bead-linked transposome, BLT) 기술을 사용합니다. 통합 DNA 추출, 자동 절편화, 라이브러리 준비 및 라이브러리 표준화가 프로토콜에 포함됩니다. 이는 전장 유전체 시퀀싱 및 표적 인리치먼트 애플리케이션에 이상적입니다.
요구 사항을 충족하는 기타 기술
자동화
Illumina의 협력사가 Illumina의 라이브러리 준비 포트폴리오를 포괄하는 고처리량 및 저처리량의 초간편 자동화 방법을 개발했습니다.
인덱스 어댑터
런당 시퀀싱되는 샘플 수를 늘리고 고유한 듀얼 인덱스(unique dual index, UDI) 어댑터를 사용하여 고처리량 시퀀싱을 최적화합니다.
UMI
고유한 분자 식별자(unique molecular identifier, UMI)는 오류 수정과 높은 정확도를 제공합니다. 변이 검출 민감도를 높이면서 위양성 변이 결과를 줄일 수 있습니다.