TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Globin

단일 단계에서 리보솜 RNA 및 글로빈 mRNA를 제거하는 효율적인 워크플로우로 혈액 유래 RNA에서 전장 전사체 시퀀싱 라이브러리를 준비합니다.

11.5시간

Assay 시간

5.5시간

수작업 시간

혈액 고품질 정제 Total RNA 0.1~1 ug

사용량

상세한 정보는 사양표를 확인하세요.

개요

Ribo-Zero Globin이 포함된 TruSeq Stranded Total RNA는 빠르고 효율적인 시퀀싱 라이브러리 준비를 통해 혈액 유래 총 RNA의 전사체를 명확하고 포괄적으로 보여줍니다.

주요 기능

  • 균일한 적용 범위 및 스트랜드 방향의 정밀한 측정

  • 대체 전사물, 안티센스 발현, 대립유전자 특이적 발현에 대한 높은 신뢰도의 발견

  • 코딩 및 여러 형태의 비코딩 RNA에서 발견

정확한 가닥 정보를 이용한 고품질 전 전사체 분석

이 키트는 인간, 마우스 또는 랫트 검체의 전전사체 분석을 위해 Ribo-Zero 리보솜 RNA 감소 화학과 RNA 염기서열분석(RNA-Seq) 기술의 이점을 결합합니다. 

단일 단계에서 효율적인 리보솜 RNA 및 글로빈 mRNA 제거

혈액 유래 RNA의 전체 전사체 분석은 2가지 형태의 풍부한 RNA, 즉 리보솜 RNA(세포질 및 미토콘드리아 모두)와 전혈 내 높은 수치로 존재하는 글로빈 mRNA의 제거를 필요로 한다.

기존의 제거 방법에는 두 개의 독립적인 단계가 필요합니다. 즉, 추가 시약이 필요하고 워크플로가 길어지며 입력 RNA가 더 많이 손실됩니다. Ribo-Zero Globin이 포함된 TruSeq Stranded Total RNA는 Ribo-Zero 화학을 활용하여 한 번의 빠른 단계로 두 가지 형태의 풍부한 RNA를 효율적으로 제거합니다.


사양


필수 제품

Illumina는 이제 워크플로우의 유연성을 위해 모듈식 제품 주문을 제공합니다. 다음 인덱스가 있는 다음 라이브러리 준비 제품을 주문할 수 있습니다.

/ 결과

애플리케이션

예시 워크플로우

1
준비

TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Globin


프로젝트 권장 사항

기기 Recommended number of samples Read length
NextSeq 550 System

RNA Profiling: 6-20 samples per run (based on 20 million reads per sample)
Transcriptome Analysis: 2-8 samples per run (based on 50 million reads per sample)

2 x 75 bp
2 x 75 bp

NovaSeq 6000 System

RNA Profiling (samples per run, dual flow cell): S1: 160, S2: 320, S4: 768. Limited by index combinations (dual). Based on 20 million reads.
Transcriptome Analysis (samples per run, dual flow cell): S1: 64, S2: 128, S4: 400. Limited by index combinations (dual). Based on 50 million reads. 

≤ 2 × 100 bp
≤ 2 × 100 bp


관련 애플리케이션 및 방법

비교하기

TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Globin Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus or Ribo-Zero Plus Microbiome
Assay 시간 11.5시간 약 7시간
자동화 기능 Liquid handling robots Liquid handling robots
콘텐츠 사양 코딩 RNA와 여러 형태의 비코딩 RNA 캡처 코딩 RNA와 여러 형태의 비코딩 RNA 캡처
설명 혈액 유래 RNA에 대한 전장 전사체 시퀀싱 연구용입니다. 세포질 및 미토콘드리아 rRNA와 글로빈 mRNA를 제거합니다. 다양한 RNA-Seq 애플리케이션을 지원하는 저 RNA 입력 및 저품질 샘플에서 전체 전사체 시퀀싱 준비 라이브러리를 준비하는 데 사용됩니다. 풍부한 전사체 분석을 용이하게 하기 위해 여러 종에서 rRNA 및 글로빈 RNA의 단일 튜브 고갈을 위한 Ribo-Zero Plus를 포함한다. 
수작업 시간 5.5시간 < 3시간
사용량 혈액 고품질 정제 Total RNA 0.1~1 ug 표준 품질 RNA 검체에 대해 1–1000 ng 총 RNA. 최적의 성능 및 FFPE 검체에 대해 최소 10 ng 총 RNA 권장 
Instruments NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq X System, NextSeq 500 System, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq 6000 System
작용 기전 비드 기반 rRNA 제거, cDNA 합성 및 PCR 효소 rRNA 제거, 어댑터 및 인덱스의 라이게이션 기반 첨가
방법 Whole-transcriptome sequencing Whole-transcriptome sequencing, Metatranscriptome sequencing
멀티플렉싱 고처리량 키트: 조합 듀얼 인덱스 또는 고유한 듀얼 인덱스를 사용하여 96개의 인덱스 샘플 준비, 저처리량 키트: 최대 12개의 샘플을 풀링합니다. 또는 세트 A, B를 함께 사용 시 최대 24개의 샘플 풀링 최대 384개의 고유한 듀얼 인덱스(UDI)
Nucleic acid type RNA RNA
특수 샘플의 종류 Blood Microbiome samples, Low-input samples, FFPE tissue
Species category Mouse, Human, Rat Mouse, Human, Rat, Bacteria
종 세부 사항 rRNA 제거: 인간, 생쥐 및 쥐 rRNA(세포질 및 미토콘드리아) 및 글로빈 mRNA 제거 Ribo-Zero Plus는 인간 세포질 및 미토콘드리아 rRNA, 마우스 rRNA, 랫트 rRNA, 박테리아(E. coli 및 B. 서브틸리스) rRNA, 및 인간 베타 글로빈 전사물을 포함하는 다수의 종으로부터 풍부한 전사물을 고갈시킨다.  Ribo-Zero Plus 미생물군유전체는 Ribo-Zero Plus에서 고갈된 것들과 다양한 미생물종 및 ATCC MSA-2002, MSA-2005 및 MSA-2006 을 포함한 여러 종의 풍부한 전사물을 고갈시킨다.
Technology Sequencing Sequencing
변이 클래스 Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Novel transcripts, Transcript variants Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Novel transcripts, Transcript variants

그림 자료

기술 복제본

FFPE 조직의 기술적 복제는 높은 일치도를 보여, 강력한 라이브러리 준비 성능을 나타냅니다. 축은 log2(FPKM)입니다. R2 값이 표시됩니다.

전사 전반에 걸친 균일한 커버리지

TruSeq Stranded Total RNA는 신선 냉동(FF, 상단) 및 FFPE(하단) 종양과 상응하는 정상 유방 조직 모두에서 발현된 상위 1,000개의 전사물에 걸쳐 우수한 커버리지를 제공하며, > 98% 정렬된 가닥 판독을 제공합니다. X축: 전사체를 따른 위치, Y축 = 조합된 판독의 커버리지 백분율.

라이브러리 프렙 (2)

TruSeq® Stranded Total RNA Library Prep Globin (48 Samples)

20020612

혈액 검체에서 rRNA와 글로빈 mRNA를 고갈시키는 RiboZero 비드, RNA를 cDNA로 전사하기 위한 PCR 마스터 혼합물, 48개 검체 제조용 시약이 포함된다. 인덱스 어댑터와 정제 비드를 별도로 구입하십시오.

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TruSeq® Stranded Total RNA Library Prep Globin (96 Samples)

20020613

혈액 검체에서 rRNA 및 글로빈 mRNA를 고갈시키는 RiboZero 비드, cDNA로 RNA를 전사하기 위한 PCR 마스터 혼합물, 48개 검체 제조용 시약이 포함된다. 인덱스 어댑터와 정제 비드를 별도로 구입하십시오.

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인덱스 어댑터 (5)

TruSeq RNA CD Index Plate (96 Indexes, 96 Samples)

20019792

TruSeq Stranded RNA HT 키트 96개 샘플 어댑터 플레이트 박스

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TruSeq RNA Single Indexes Set A (12 Indexes, 48 Samples)

20020492

48개의 개별 RNA 검체를 준비하기 위한 24개의 지표(지수: 2, 4, 5, 6, 7, 12, 13, 14, 15, 16, 18, 19) 중 12개를 포함한다.

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TruSeq RNA Single Indexes Set B (12 Indexes, 48 Samples)

20020493

48개의 개별 RNA 검체를 준비하기 위한 24개의 지표(지수: 1, 3, 8, 9, 10, 11, 20, 21, 22, 23, 25, 27) 중 12개를 포함한다.

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IDT for Illumina – TruSeq RNA UD Indexes (24 Indexes, 96 Samples)

20020591

TruSeq 가닥 mRNA 및 TruSeq 가닥 총 RNA 라이브러리 준비 키트와 호환되는 새로운 고유 이중 인덱스(UDI). UDI 키트는 플레이트 형식으로 제공되며, 24개의 UDI(x4)를 포함하고, 96개의 샘플에 충분합니다.

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IDT for Illumina – TruSeq RNA UD Indexes (96 Indexes, 96 Samples)

20022371

TruSeq 가닥 mRNA 및 TruSeq 가닥 총 RNA 라이브러리 준비 키트와 호환되는 새로운 고유 이중 인덱스(UDI). UDI 키트는 플레이트 형식으로 제공되며, 96개의 UDI를 포함하기 때문에 96개의 샘플에 충분합니다.

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선택 품목 요약

제품

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NovaSeq X 시리즈 주문

발전된 화학 반응, 광학 및 인포매틱스가 결합되어 뛰어난 속도와 데이터 품질, 뛰어난 처리량과 확장성을 제공합니다.

MiSeq Reagent Kit v3

클러스터 밀도와 판독 길이를 높여 이전 버전에 비해 시퀀싱 품질 점수를 개선하는 최적화된 시약 키트입니다.

TruSight Oncology 500

FFPE 조직의 모든 주요 변이 계열과 유전자 시그니처(TMB, MSI, HRD)를 포함하는 대형 범암 패널로 CGP를 활성화합니다.

Illumina DNA Prep

광범위한 시퀀싱 애플리케이션에 사용하기 위한 매우 정확한 데이터를 생성하는 효율적이고 빠른 통합 라이브러리 프렙 워크플로우입니다.

제한적 사용 라벨 라이선스:

Ribo-Zero Globin Workflow 제품과 그 사용이 포함된 TruSeq Stranded Total RNA는 Max Planck Gesellschaft가 소유하고 New England Biolabs, Inc.에 독점적으로 라이선스를 허여하고 Illumina, Inc.에 2차 라이선스를 허여한 하나 이상의 발행 및/또는 계류 중인 미국 및 외국 특허 출원의 대상입니다. Illumina, Inc., 그 계열사 또는 공인 리셀러 및 유통업체로부터 본 제품을 구매하는 것은 구매자에게 구매자가 구매한 제품 수량 및 제품 구성 요소를 사용할 수 있는 양도 불가능한 권리를 양도합니다(구매자가 학술 또는 영리 단체인지 여부와 무관). 이 제품의 구매는 상기 특허 또는 제품 생산에 직접 적용되는 특허 출원의 청구범위에 따른 라이선스를 전달하지 않습니다. 구매자는 본 제품 또는 그 구성 요소를 제3자에게 판매 또는 양도하거나 다음과 같은 상업적 목적으로 제품을 사용할 수 없습니다. (I) 제품 또는 그 구성요소를 제조에 사용하는 행위, 또는 (2) 인간 또는 동물에서 치료 또는 예방 목적으로 제품 또는 그 구성요소를 사용하는 행위.

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