유전자 발현과 전사체 분석
포괄적인 유전자 발현 및 전사체 분석 솔루션
전사체 분석 실험을 통해 연구자는 전사 활동(코딩[coding] 및 비코딩[noncoding])의 특성을 규명하거나, 관련 표적 유전자와 전사물의 부분집합에 초점을 맞추거나, 한 번에 수천 개의 유전자를 프로파일링하여 세포 기능에 대한 전체적인 그림을 만들 수 있습니다. 유전자 발현 분석 연구를 통해 다양한 조건에서 활발하게 발현된 유전자와 전사물의 스냅샷을 얻을 수 있습니다.
차세대 시퀀싱(NGS) 기능은 전사체학의 범위를 한 번에 몇 개의 유전자를 조사하는 것에서 단일 실험으로 유전체 차원의 유전자 발현 수준을 프로파일링하는 것으로 바꾸었습니다. NGS 기반 RNA 시퀀싱(RNA-Seq)이 다른 일반적인 유전자 발현 및 전사물(transcript) 프로파일링 방법, 유전자 발현 마이크로어레이 및 qRT-PCR과 비교하여 어떠한지 알아보세요. RNA-Seq을 사용하여 유전자 발현을 분석하고 새로운 전사물을 식별하는 방법을 알아보세요.
일반적인 유전자 발현 분석 방법
연구 목표에 따라 일부 관심 표적에 대한 유전자 발현을 프로파일링 및/또는 코딩 전사체를 분석하는 데 다양한 방법을 사용할 수 있습니다. 몇 가지 주요 유전자 발현 및 전사체 분석 방법의 장단점에 대해 알아보세요.
유전자 발현 마이크로어레이
장점: 알려진 유전자 및 전사물 분석을 위한 친숙한 워크플로우, 높은 샘플 처리량
단점: 새로운 전사물을 검출할 수 없음. 유전자 발현 측정은 로우엔드의 백그라운드와 하이엔드의 신호 포화에 의해 제한됩니다.1
어레이 대 RNA-Seq 비교에 대해 알아보기RNA-Seq
장점: 광범위한 동적 범위, 모든 종에 적용 가능, 단일 assay에서 알려진 기능과 새로운 기능을 모두 검출할 수 있음1
단점: 소수의 알려진 전사물 변이 세트에 대해 제한된 수의 샘플을 조사할 때 비용 효율성이 떨어질 수 있음
RNA-Seq에 대해 더 알아보기RNA-Seq을 사용하여 유전자 발현을 분석하는 방법
다음 NGS 기반 RNA-Seq 방법을 사용하여 유전자 발현을 분석하는 방법에 대해 알아보세요.
- mRNA 시퀀싱: 코딩 전사체에 대한 명확하고 종합적인 관점을 통해 대체 전사물, 유전자 융합 및 대립유전자 특이적 발현 패턴을 확인해 보세요.
- 표적 RNA 시퀀싱: 관심 있는 특정 유전자 또는 전사물을 선택하고 시퀀싱합니다. 수십에서 수천 개의 표적에 대한 유전자 발현을 동시에 프로파일링합니다.
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전체 RNA 시퀀싱(total RNA-Seq)과 함께 전장 전사체 분석을 사용하여 유전자 발현 변화의 광범위한 영향을 포착하는 방법을 알아보세요. 코딩 RNA와 다양한 형태의 비코딩(noncoding) RNA를 모두 검출하는 이 방법으로 전체 전사체를 종합적인 관점에서 살펴볼 수 있습니다.
전체 RNA-Seq에 대해 더 알아보기
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참고 문헌
- Zhao S, Fung-Leung WP, Bittner A, and Ngo K, Liu X. Comparison of RNA-Seq and microarray in transcriptome profiling of activated T cells. PLoS One. 2014;16;9(1):e78644.