TruSeq RNA Exome

FFPE 조직 및 기타 저품질 샘플의 RNA 시퀀싱을 위한 재현 가능하고 경제적인 솔루션을 제공합니다. 10 ng의 총 RNA로 정확도를 높입니다.

약 2일

Assay 시간

약 11시간

수작업 시간

신선/냉동 샘플의 Total RNA 10 ng 또는 FFPE 샘플의 Total RNA 20 ng

사용량

상세한 정보는 사양표를 확인하세요.

이전에 TruSeq RNA Access Library Prep Kit(카탈로그 번호 RS-301-2001 및 RS-301-2002) 제품을 이제 TruSeq RNA Exome의 제품명으로 선보입니다. 제품 구성이 변경되었습니다. 새로운 구성에서는 library preparation, index adapters, enrichment reagents, 및 exome panels등 주요 구성요소를 별도로 구매할 수 있습니다. 이전에 카탈로그 번호 RS-301-2001 또는 카탈로그 번호 RS-301-2002를 구매한 경우, 다음 부품은 별도로 구매해 주세요: TruSeq RNA Library Prep for Enrichment(카탈로그 번호 20020189), TruSeq RNA Enrichment(카탈로그 번호 20020490), Exome Panel(카탈로그 번호 20020183) 및 아래 인덱스 어댑터 항목에서 한 가지 품목을 구매해 주세요.

개요

TruSeq RNA Exome(구 TruSeq RNA Access Library Prep Kit)은 총 RNA를 알려진 가닥 기원의 템플릿 분자로 변환한 후 코딩 RNA의 시퀀스별 캡처를 수행합니다. 이는 포르말린 고정, 파라핀 포매(FFPE) 조직 및 기타 저품질 샘플에서 분리된 인간 RNA를 분석하기 위한 저렴한 솔루션을 제공합니다.

주요 기능

  • 경제성 및 초점 - 인간 전사체 코딩 영역을 분리하여 서열결정 깊이의 일부에서 발견력을 극대화합니다

  • 어려운 샘플의 고품질 데이터 - FFPE 조직을 포함한 분해된 샘플의 RNA 시퀀싱에 최적화됨

  • 출발물질이 제한된 검체 - 높은 민감도를 유지하면서 검체 투입 요건(새롭거나 냉동된 검체에서 총 RNA 10 ng 또는 분해된 검체에서 총 RNA 20 ng)이 크게 감소됨

TruSeq RNA Exome은 분해된 샘플에서 RNA 코딩 영역에 초점을 맞춘 RNA 시퀀싱(RNA-Seq) 라이브러리를 생성합니다. 가치가 높은 이 콘텐츠 영역을 분리하면 발견 역량을 극대화하면서도 총 RNA 시퀀싱의 리드 뎁스 중 일부만 필요합니다. 그 결과 낮은 사용량 요구 사항, 높은 샘플 처리량 및 비용 효율적인 전사체 분석이 가능해졌습니다. 공급되는 시약 용량은 1~4플렉스 인리치먼트 반응을 지원하기에 충분합니다.


사양


필수 제품

Illumina는 이제 워크플로우의 유연성을 위해 모듈식 제품 주문을 제공합니다. 라이브러리 준비, 강화, 인덱스 어댑터 및 엑솜 패널 구성 요소를 별도로 주문하십시오.

/ 결과

애플리케이션

예시 워크플로우


프로젝트 권장 사항

기기 Recommended number of samples Read length
NextSeq 550 System

5 to 16 samples per run (based on 25 million reads per sample)

2 x 75 bp

NovaSeq 6000 System

Samples per run (dual flow cell): S1: 96, S2: 96, S4: 192 (currently limited by available index combinations)

2 × 100 bp

NovaSeq 6000 System

Samples per run (dual flow cell): S1: 96, S2: 96, S4: 192 (currently limited by available index combinations)

2 × 100 bp


관련 애플리케이션 및 방법

비교하기

TruSeq RNA Exome Illumina RNA Prep with Enrichment Illumina Stranded mRNA Prep
Assay 시간 약 2일 < 9시간 6.5시간
자동화 기능 Liquid handling robots Liquid handling robots Liquid handling robots
자동화 상세 정보 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기
콘텐츠 사양 코딩 전사체/RNA 엑솜 캡처 Illumina Exome Panel과 함께 사용 시 코딩 전사물 캡처 가닥 정보가 있는 코딩 전사체 캡처
설명 정밀한 가닥 정보와 샘플 사용량 요구 사항 감소로 연구자들에게 코딩 전사체에 대한 명확하고 종합적인 관점을 제공합니다. 포르말린 고정 파라핀 포매(FFPE) 조직 및 기타 저품질 샘플 등 광범위한 샘플의 종류와 사용량으로부터 표적 전사물(transcript) 검출 및 발견 연구를 가능하게 하는 재현 가능하고 경제적인 솔루션입니다. 정밀한 가닥 정보가 있는 코딩 전사체의 분석을 위한 단순하고 비용 효율적인 솔루션입니다.
수작업 시간 약 11시간 < 2시간 < 3시간
사용량 신선/냉동 샘플의 Total RNA 10 ng 또는 FFPE 샘플의 Total RNA 20 ng RNA 10 ng, FFPE RNA 20 ng 표준 품질 Total RNA 25~1,000 ng
Instruments NextSeq 550 System, HiSeq 3000 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq X System, NextSeq 500 System, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System, HiSeq 4000 System MiSeq System, iSeq 100 System, NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiniSeq System, NovaSeq 6000 System NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq X System, NextSeq 500 System, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System
작용 기전 코딩 RNA를 표적으로 하는 바이오틴화된 캡처 프로브. 폴리A 꼬리가 있는 RNA는 필요하지 않습니다. Bead-linked transposome 폴리A 포획, 라이게이션 기반 어댑터 및 인덱스 추가
방법 Exome sequencing, mRNA sequencing mRNA sequencing, Targeted RNA sequencing, Target enrichment mRNA sequencing
멀티플렉싱 최대 24개 싱글, 96개 조합(CD) 듀얼 최대 384개의 고유한 듀얼 인덱스(UDI) 최대 384개의 고유한 듀얼 인덱스(UDI)
Nucleic acid type RNA RNA RNA
특수 샘플의 종류 Low-input samples, FFPE tissue Blood, Low-input samples, FFPE tissue Not FFPE-compatible, Low-input samples
Species category Human Human, Virus Mammalian, Bovine, Mouse, Human, Rat
Strand specificity Stranded Non-stranded Stranded
Technology Sequencing Sequencing Sequencing
변이 클래스 Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Novel transcripts, Transcript variants Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Novel transcripts, Transcript variants Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Novel transcripts, Transcript variants

그림 자료

효율적인 유전자 융합 발견

TruSeq RNA Exome을 사용하면 융합 접합부에 특정한 프로브를 설계할 필요 없이 발현된 융합 전사물을 검출할 수 있습니다. 특성 규명이 잘 된 BCR-ABL 융합은 UHRR(Universal Human Reference RNA) 샘플에서 25M 개의 리드로 효율적으로 검출합니다.

리소스

축소판

에볼라와 성적 전염

에볼라 바이러스병(EVD)의 남성 생존자가 에볼라 치료를 마치고 퇴원한 지 6개월 후 여성 파트너에게 바이러스를 전염시켜 여성이 이 질병으로 사망했습니다. 생존자의 정액은 기존 방법으로는 음성 판정을 받았지만 저자는 Illumina TruSeq RNA Access Kit 및 맞춤형 프로브를 사용하여 EBOV RNA에 대한 정액 샘플을 인리치먼트(enrichment) 처리할 수 있었습니다.

라이브러리 프렙 (1)

TruSeq® RNA Library Prep for Enrichment (48 Samples)

20020189

48개의 라이브러리를 준비하기 위한 시약이 포함되어 있습니다. 인덱스 어댑터, 증균 패널 및 증균 시약을 별도로 구입하십시오.

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인리치먼트 (1)

TruSeq® RNA Enrichment (12 enrichments)

20020490

TruSeq RNA Library Prep for Enrichment와 함께 사용할 경우 12가지 증균 반응에 충분합니다. 라이브러리 준비, 인덱스 어댑터 및 프로브 패널을 별도로 구입합니다.

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인덱스 어댑터 (2)

TruSeq RNA Single Indexes Set A (12 Indexes, 48 Samples)

20020492

48개의 개별 RNA 검체를 준비하기 위한 24개의 지표(지수: 2, 4, 5, 6, 7, 12, 13, 14, 15, 16, 18, 19) 중 12개를 포함한다.

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TruSeq RNA Single Indexes Set B (12 Indexes, 48 Samples)

20020493

48개의 개별 RNA 검체를 준비하기 위한 24개의 지표(지수: 1, 3, 8, 9, 10, 11, 20, 21, 22, 23, 25, 27) 중 12개를 포함한다.

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패널 (1)

Illumina Exome Panel – Enrichment Oligos Only

20020183

Illumina DNA Prep with Enrichment와 함께 사용할 경우 8개의 농축 반응에 충분하며, TruSeq RNA Exome과 함께 사용할 경우 12개의 반응, Illumina RNA prep with Enrichment와 함께 사용할 경우 32개의 반응에 충분합니다. 라이브러리 준비 및 증균 시약과 색인 어댑터를 별도로 구입하십시오.

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선택 품목 요약

제품

수량

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NovaSeq X 시리즈 주문

발전된 화학 반응, 광학 및 인포매틱스가 결합되어 뛰어난 속도와 데이터 품질, 뛰어난 처리량과 확장성을 제공합니다.

MiSeq Reagent Kit v3

클러스터 밀도와 판독 길이를 높여 이전 버전에 비해 시퀀싱 품질 점수를 개선하는 최적화된 시약 키트입니다.

TruSight Oncology 500

FFPE 조직의 모든 주요 변이 계열과 유전자 시그니처(TMB, MSI, HRD)를 포함하는 대형 범암 패널로 CGP를 활성화합니다.

Illumina DNA Prep

광범위한 시퀀싱 애플리케이션에 사용하기 위한 매우 정확한 데이터를 생성하는 효율적이고 빠른 통합 라이브러리 프렙 워크플로우입니다.

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