TruSeq Stranded mRNA

mRNA로부터 시퀀싱 라이브러리를 준비하여 가닥 특이적 정보로 코딩 전사체를 명확하게 파악합니다.

~10.5시간

Assay 시간

~4.5시간

수작업 시간

Total RNA 0.1~1 ug 또는 이전에 분리한 mRNA 10~100 ng(폴리A 꼬리가 있는 종)

사용량

상세한 정보는 사양표를 확인하세요.

개요

TruSeq Stranded mRNA는 전사체 분석을 코딩하기 위한 간소화되고 비용 효율적이며 확장 가능한 솔루션을 제공합니다. 다양한 샘플과 호환됩니다.

스트랜드 방향 감지

안티센스 전사 검출, 향상된 전사물 주석, 정렬 효율 향상을 위해 mRNA 가닥 방향을 정확하게 측정할 수 있습니다. 높은 커버리지 균일성은 대안적인 전사물, 유전자 융합, 및 대립유전자-특이적 발현과 같은 특징의 발견을 향상합니다.

비용 효율적

가닥 정보는 주어진 RNA 전사체가 2개의 DNA 가닥 중 어느 것에서 유래되었는지 식별한다. 이러한 정보는 특히 비인간 샘플에 대해 전사물 주석에 대한 신뢰도를 증가시킨다. 가닥 기원을 식별하면 정렬된 판독의 백분율이 증가하여 샘플당 시퀀싱 비용이 감소합니다.

확장 가능

워크플로우는 표준 및 저품질 샘플 모두에 대한 강력한 조사와 광범위한 연구 설계와 호환되는 워크플로우를 가능하게 합니다.

빠르고 자동화 친화적인 워크플로우

하루 안에 Illumina 시퀀싱을 위한 라이브러리를 준비해 보세요. Illumina의 적격 방법은 파트너 를 통해 다양한 자동화 플랫폼에서 사용할 수 있습니다.


사양


필수 제품

Illumina는 이제 워크플로우의 유연성을 위해 모듈식 제품 주문을 제공합니다. 다음 인덱스가 있는 다음 라이브러리 준비 제품을 주문할 수 있습니다. 

/ 결과

애플리케이션

예시 워크플로우


프로젝트 권장 사항

기기 Recommended number of samples Read length
NextSeq 550 System

RNA Profiling: 13–40 samples per run (based on 10 million reads per sample)
Transcriptome Analysis: 5–16 samples per run (based on 25 million reads per sample)

2 x 75 bp
2 x 75 bp

NovaSeq 6000 System

RNA Profiling (samples per run, dual flow cell): S1: 320, S2:384, S4:768. Limited by index combinations (dual). Based on 10 million reads.
Transcriptome Analysis (samples per run, dual flow cell): S1: 128, S2: 256, S4: 768. Limited by index combinations (dual). Based on 25 million reads. 

≤ 2 × 100 bp
≤ 2 × 100 bp


관련 애플리케이션 및 방법


다른 사람들이 이 제품을 사용하는 방법

마운트 시나이 Icahn School of Medicine의 연구자들은 암, 불임 및 자가면역 질환의 비밀을 밝히기 위해 mtDNA, piRNA 및 TCR 레퍼토리 다양성을 연구하고 있습니다.

RNA-Seq 및 HLA 형별 검사를 통해 표적 발견 플랫폼의 역량과 효율성이 증가하고 있습니다.

비교하기

TruSeq Stranded mRNA Illumina Stranded mRNA Prep Illumina RNA Prep with Enrichment
Assay 시간 ~10.5시간 6.5시간 < 9시간
자동화 기능 Liquid handling robots Liquid handling robots Liquid handling robots
자동화 상세 정보 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기
콘텐츠 사양 가닥 정보가 있는 코딩 전사체 캡처 가닥 정보가 있는 코딩 전사체 캡처 Illumina Exome Panel과 함께 사용 시 코딩 전사물 캡처
설명 정밀한 가닥 정보로 연구자들에게 코딩 전사체에 대한 명확하고 종합적인 관점을 제공합니다. 정밀한 가닥 정보가 있는 코딩 전사체의 분석을 위한 단순하고 비용 효율적인 솔루션입니다. 포르말린 고정 파라핀 포매(FFPE) 조직 및 기타 저품질 샘플 등 광범위한 샘플의 종류와 사용량으로부터 표적 전사물(transcript) 검출 및 발견 연구를 가능하게 하는 재현 가능하고 경제적인 솔루션입니다.
수작업 시간 ~4.5시간 < 3시간 < 2시간
사용량 Total RNA 0.1~1 ug 또는 이전에 분리한 mRNA 10~100 ng(폴리A 꼬리가 있는 종) 표준 품질 Total RNA 25~1,000 ng RNA 10 ng, FFPE RNA 20 ng
Instruments MiSeq System, NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq X System, NextSeq 500 System, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq X System, NextSeq 500 System, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System MiSeq System, iSeq 100 System, NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiniSeq System, NovaSeq 6000 System
작용 기전 Oligo-dT 비드가 폴리A 꼬리 포획 폴리A 포획, 라이게이션 기반 어댑터 및 인덱스 추가 Bead-linked transposome
방법 mRNA sequencing mRNA sequencing mRNA sequencing, Targeted RNA sequencing, Target enrichment
멀티플렉싱 1~96 최대 384개의 고유한 듀얼 인덱스(UDI) 최대 384개의 고유한 듀얼 인덱스(UDI)
Nucleic acid type RNA RNA RNA
특수 샘플의 종류 Not FFPE-compatible Not FFPE-compatible, Low-input samples Blood, Low-input samples, FFPE tissue
Species category Mammalian, Bovine, Mouse, Human, Rat Mammalian, Bovine, Mouse, Human, Rat Human, Virus
종 세부 사항 폴리A 꼬리가 있는 종의 고품질 RNA로 작업 폴리A 꼬리가 있는 종의 고품질 RNA로 작업
Strand specificity Stranded Stranded Non-stranded
Technology Sequencing Sequencing Sequencing
변이 클래스 Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Novel transcripts, Transcript variants Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Novel transcripts, Transcript variants Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Novel transcripts, Transcript variants

선택 도구:

그림 자료

기술 복제본

FFPE 조직의 기술적 복제는 높은 일치도를 보여, 강력한 라이브러리 준비 성능을 나타냅니다. 축은 log2(FPKM)입니다. R2 값이 표시됩니다.

라이브러리 프렙 (2)

TruSeq® Stranded mRNA Library Prep (48 Samples)

20020594

선행 polyA 포획 단계용 RNA 정제 비드, mRNA를 cDNA로 전사하기 위한 PCR 마스터 혼합물, 48개 검체 제조용 시약이 포함된다. 색인 어댑터를 별도로 구입하십시오. 정제 비드는 polyA 포획 단계 후에 필요하며 별도로 판매된다.

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TruSeq Stranded mRNA Library Prep (96 Samples)

20020595

선행 polyA 포획 단계용 RNA 정제 비드, mRNA를 cDNA로 전사하기 위한 PCR 마스터 혼합물, 48개 검체 준비용 시약이 포함된다. 인덱스 어댑터를 별도로 구매하십시오. 정제 비드는 polyA 포획 단계 후에 필요하며 별도로 판매됩니다.

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인덱스 어댑터 (4)

TruSeq RNA Single Indexes Set A (12 Indexes, 48 Samples)

20020492

48개의 개별 RNA 검체를 준비하기 위한 24개의 지표(지수: 2, 4, 5, 6, 7, 12, 13, 14, 15, 16, 18, 19) 중 12개를 포함한다.

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TruSeq RNA Single Indexes Set B (12 Indexes, 48 Samples)

20020493

48개의 개별 RNA 검체를 준비하기 위한 24개의 지표(지수: 1, 3, 8, 9, 10, 11, 20, 21, 22, 23, 25, 27) 중 12개를 포함한다.

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TruSeq RNA CD Index Plate (96 Indexes, 96 Samples)

20019792

TruSeq Stranded RNA HT 키트 96개 샘플 어댑터 플레이트 박스

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IDT for Illumina – TruSeq RNA UD Indexes v2 (96 Indexes, 96 Samples)

20040871

96개의 샘플에 라벨을 부착하기에 충분한 96, 8 bp 인덱스를 포함하며 TruSeq 가닥 mRNA 및 TruSeq 가닥 총 RNA 라이브러리 준비 키트와 호환됩니다. 버전 2는 플레이트 20022371의 192개 인덱스 올리고(oligo) 중 8개에 대한 개선 사항을 포함하고 있으며, 나머지 184개에는 변경사항이 없습니다. 라이브러리 준비 및 프로브 패널을 별도로 구입하세요.

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선택 품목 요약

제품

수량

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NovaSeq X 시리즈 주문

발전된 화학 반응, 광학 및 인포매틱스가 결합되어 뛰어난 속도와 데이터 품질, 뛰어난 처리량과 확장성을 제공합니다.

MiSeq Reagent Kit v3

클러스터 밀도와 판독 길이를 높여 이전 버전에 비해 시퀀싱 품질 점수를 개선하는 최적화된 시약 키트입니다.

TruSight Oncology 500

FFPE 조직의 모든 주요 변이 계열과 유전자 시그니처(TMB, MSI, HRD)를 포함하는 대형 범암 패널로 CGP를 활성화합니다.

Illumina DNA Prep

광범위한 시퀀싱 애플리케이션에 사용하기 위한 매우 정확한 데이터를 생성하는 효율적이고 빠른 통합 라이브러리 프렙 워크플로우입니다.

본 제품 및 그 사용은 Max Planck Gesellschaft가 소유하고 New England Biolabs, Inc.에 독점적으로 라이선스를 허여하고 Illumina, Inc.에 2차 라이선스를 허여한 하나 이상의 발행 및/또는 계류 중인 미국 및 외국 특허 출원의 대상입니다. Illumina, Inc., 그 계열사 또는 공인 리셀러 및 유통업체로부터 본 제품을 구매하는 것은 구매자에게 구매자가 구매한 제품 수량 및 제품 구성 요소를 사용할 수 있는 양도 불가능한 권리를 양도합니다(구매자가 학술 또는 영리 단체인지 여부와 무관). 이 제품의 구매는 상기 특허 또는 제품 생산에 직접 적용되는 특허 출원의 청구범위에 따른 라이선스를 전달하지 않습니다. 구매자는 본 제품 또는 그 구성 요소를 제3자에게 판매 또는 양도하거나 다음과 같은 상업적 목적으로 제품을 사용할 수 없습니다. (I) 제품 또는 그 구성요소를 제조에 사용하는 행위, 또는 (2) 인간 또는 동물에서 치료 또는 예방 목적으로 제품 또는 그 구성요소를 사용하는 행위.

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