TruSeq Stranded Total RNA

사람, 쥐, formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) 조직을 포함한 다양한 종(species)과 샘플 유형을 위한 강력하고 확장성이 뛰어난 전장 전사체(transcriptome) 분석(RNA-Seq) 솔루션입니다.

11.5시간

Assay 시간

5.5시간

수작업 시간

고품질 Total RNA 0.1~1 ug. 품질이 낮은 샘플에는 추가적인 최적화가 필요할 수 있음.

사용량

상세한 정보는 사양표를 확인하세요.

이전 TruSeq Stranded Total RNA Library Prep Kit with Ribo-Zero Human/Mouse/Rat (Cat. 번호 RS-122-2201, RS-122-2202 및 RS-122-2203) 및 TruSeq Stranded Total RNA Library Prep Kit with Ribo-Zero Gold (카탈로그 번호 RS-122-2301, RS-122-2302, 및 RS-122-2303)은 이제 각각 TruSeq Stranded Total RNA Human/Mouse/Rat 및 ruSeq Stranded Total RNA Gold로 제품 구성이 변경되었습니다. 라이브러리 프렙 및 인덱스 어댑터 제품은 키트 대신에 별도로 구매가 필요합니다.

개요

TruSeq Stranded Total RNA는 염기서열분석을 통한 총 RNA 분석을 위한 간소화되고 비용 효율적이며 확장 가능한 솔루션으로 전사체를 명확하게 보여줍니다.

가닥 방향의 정확한 측정을 통한 전사체 전체 분석

저품질 DNA/RNA 및 포르말린 고정 파라핀 포매(FFPE) 검체를 포함한 광범위한 검체와 호환되는 TruSeq Stranded Total RNA는 TruSeq RNA 기술의 모든 이점을 Ribo-Zero 리보솜 RNA 감소 화학과 결합합니다. 이 제품은 스트랜드 배향의 정확한 측정, 균일한 커버리지, 및 대안적인 전사체, 유전자 융합, 및 대립유전자-특이적 발현과 같은 특징의 고신뢰도 발견으로 코딩 및 다수의 형태의 비코딩 RNA의 분석을 가능하게 합니다.

종 호환성

TruSeq Stranded Total RNA는 human, mouse & rat sequences으로 설계되었으나, 다양한 진핵종에 적용될 수 있습니다.

다양한 연구 설계를 위한 유연한 솔루션

TruSeq Stranded Total RNA는 특정 연구 설계 요구에 맞게 여러 버전으로 제공됩니다.

  • TruSeq 가닥 총 RNA 인간/마우스/랫트 가 세포질 rRNA 제거

  • TruSeq Stranded Total RNA Gold 는 세포질 및 미토콘드리아 rRNA를 모두 제거합니다.

  • 총 RNA 키트는 또한 새로운 고유 이중(UD) 인덱스 키트인 Illumina - TruSeq RNA UD 인덱스용 IDT와 호환되며, 최대 96개의 검체를 다중화할 수 있습니다.

빠르고 자동화 친화적인 워크플로우

하루 안에 Illumina 시퀀싱을 위한 라이브러리를 준비해 보세요. Illumina의 적격 방법은 파트너 를 통해 다양한 자동화 플랫폼에서 사용할 수 있습니다.


사양


필수 제품

Illumina는 이제 워크플로우의 유연성을 위해 모듈식 제품 주문을 제공합니다. 다음 인덱스가 있는 다음 라이브러리 준비 제품을 주문할 수 있습니다. 
/ 결과

애플리케이션

예시 워크플로우


프로젝트 권장 사항

기기 Recommended number of samples Read length
NextSeq 550 System

RNA profiling: 6-20 samples per run (based on 20 million reads per sample)
Transcriptome analysis: 2-8 samples per run (based on 50 million reads per sample)

2 x 75 bp

NovaSeq 6000 System

RNA profiling (samples per run, dual flow cell): S1: 160, S2: 320, S4: 768. Limited by index combinations (dual). Based on 20 million reads.
Transcriptome analysis (samples per run, dual flow cell): S1: 64, S2: 128, S4: 400. Limited by index combinations (dual). Based on 50 million reads. 

≤ 2 × 100 bp


관련 애플리케이션 및 방법

비교하기

TruSeq Stranded Total RNA Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus or Ribo-Zero Plus Microbiome
Assay 시간 11.5시간 약 7시간
자동화 기능 Liquid handling robots Liquid handling robots
자동화 상세 정보 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기
콘텐츠 사양 코딩 RNA와 여러 형태의 비코딩 RNA 캡처 코딩 RNA와 여러 형태의 비코딩 RNA 캡처
설명 전장 전사체 시퀀싱 연구용입니다. Total RNA 버전은 세포질 rRNA를 제거하며 Total RNA Gold 버전은 세포질 및 미토콘드리아 rRNA를 제거합니다. 다양한 RNA-Seq 애플리케이션을 지원하는 저 RNA 입력 및 저품질 샘플에서 전체 전사체 시퀀싱 준비 라이브러리를 준비하는 데 사용됩니다. 풍부한 전사체 분석을 용이하게 하기 위해 여러 종에서 rRNA 및 글로빈 RNA의 단일 튜브 고갈을 위한 Ribo-Zero Plus를 포함한다. 
수작업 시간 5.5시간 < 3시간
사용량 고품질 Total RNA 0.1~1 ug. 품질이 낮은 샘플에는 추가적인 최적화가 필요할 수 있음. 표준 품질 RNA 검체에 대해 1–1000 ng 총 RNA. 최적의 성능 및 FFPE 검체에 대해 최소 10 ng 총 RNA 권장 
Instruments NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq X System, NextSeq 500 System, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq 6000 System
작용 기전 비드 기반 rRNA 제거, cDNA 합성 및 PCR 효소 rRNA 제거, 어댑터 및 인덱스의 라이게이션 기반 첨가
방법 Whole-transcriptome sequencing Whole-transcriptome sequencing, Metatranscriptome sequencing
멀티플렉싱 저처리량 키트: 최대 12개의 샘플을 풀링합니다. 또는 세트 A, B를 함께 사용 시 최대 24개의 샘플 풀링, 고처리량 키트: 조합 듀얼 인덱스 또는 고유한 듀얼 인덱스를 사용하여 96개의 인덱스 샘플 준비 최대 384개의 고유한 듀얼 인덱스(UDI)
Nucleic acid type RNA RNA
특수 샘플의 종류 FFPE tissue Microbiome samples, Low-input samples, FFPE tissue
Species category Mouse, Human, Rat Mouse, Human, Rat, Bacteria
종 세부 사항 rRNA 제거: 인간, 생쥐 및 쥐 rRNA 제거 Ribo-Zero Plus는 인간 세포질 및 미토콘드리아 rRNA, 마우스 rRNA, 랫트 rRNA, 박테리아(E. coli 및 B. 서브틸리스) rRNA, 및 인간 베타 글로빈 전사물을 포함하는 다수의 종으로부터 풍부한 전사물을 고갈시킨다.  Ribo-Zero Plus 미생물군유전체는 Ribo-Zero Plus에서 고갈된 것들과 다양한 미생물종 및 ATCC MSA-2002, MSA-2005 및 MSA-2006 을 포함한 여러 종의 풍부한 전사물을 고갈시킨다.
Technology Sequencing Sequencing
변이 클래스 Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Novel transcripts, Transcript variants Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Novel transcripts, Transcript variants

선택 도구:

그림 자료

고품질 가닥 정보

일관되고 정밀한 RNA 풍부도 측정은 기술적 복제 간의 높은 재현성에 의해 반영된다. FFPE 조직의 이러한 기술적 복제는 높은 일치도를 나타내며, 이는 강력한 라이브러리 준비 성능을 나타낸다. 축은 log2(FPKM)입니다. R2 값이 표시됩니다.

전사에 걸친 균일한 커버리지

TruSeq Stranded Total RNA는 신선 냉동(FF, 상단) 및 FFPE(하단) 종양과 상응하는 정상 유방 조직 모두에서 상위 1000개의 발현된 전사물에 걸쳐 우수한 커버리지를 제공하며, > 98% 정렬된 가닥 판독을 제공합니다. X축: 전사체를 따른 위치, Y축: 조합된 판독의 커버 백분율.

라이브러리 프렙 (4)

TruSeq® Stranded Total RNA Library Prep Human/Mouse/Rat (48 Samples)

20020596

인간, 마우스, 랫트로부터 rRNA를 고갈시키기 위한 RiboZero 비드, RNA를 cDNA로 전사하기 위한 PCR 마스터 혼합물, 48개 검체 제조용 시약이 포함된다. 인덱스 어댑터와 정제 비드를 별도로 구입하십시오.

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TruSeq® Stranded Total RNA Library Prep Human/Mouse/Rat (96 Samples)

20020597

인간, 마우스, 랫트로부터 rRNA를 고갈시키기 위한 RiboZero 비드, RNA를 cDNA로 전사하기 위한 PCR 마스터 혼합물, 48개 검체 제조를 위한 시약을 포함한다. 인덱스 어댑터와 정제 비드를 별도로 구입하십시오.

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TruSeq Stranded Total RNA Library Prep Gold (48 Samples)

20020598

인간, 마우스 및 랫트로부터 rRNA 및 미토콘드리아 rRNA를 고갈시키기 위한 RiboZero 비드, RNA를 cDNA로 전사하기 위한 PCR 마스터 혼합물, 및 48개의 샘플 제조용 시약을 포함한다. 색인 어댑터를 별도로 구입하십시오. 색인 어댑터와 정제 비드는 별도로 구입하십시오.

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TruSeq® Stranded Total RNA Library Prep Gold (96 Samples)

20020599

인간, 마우스, 랫트로부터 rRNA 및 미토콘드리아 rRNA를 고갈시키기 위한 RiboZero 비드, RNA를 cDNA로 전사하기 위한 PCR 마스터 혼합물, 48개 검체 제조용 시약을 포함한다. 인덱스 어댑터를 별도로 구매하십시오. 인덱스 어댑터와 정제 비드를 별도로 구입하십시오.

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인덱스 어댑터 (4)

TruSeq RNA CD Index Plate (96 Indexes, 96 Samples)

20019792

TruSeq Stranded RNA HT 키트 96개 샘플 어댑터 플레이트 박스

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TruSeq RNA Single Indexes Set A (12 Indexes, 48 Samples)

20020492

48개의 개별 RNA 검체를 준비하기 위한 24개의 지표(지수: 2, 4, 5, 6, 7, 12, 13, 14, 15, 16, 18, 19) 중 12개를 포함한다.

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TruSeq RNA Single Indexes Set B (12 Indexes, 48 Samples)

20020493

48개의 개별 RNA 검체를 준비하기 위한 24개의 지표(지수: 1, 3, 8, 9, 10, 11, 20, 21, 22, 23, 25, 27) 중 12개를 포함한다.

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IDT for Illumina – TruSeq RNA UD Indexes v2 (96 Indexes, 96 Samples)

20040871

96개의 샘플에 라벨을 부착하기에 충분한 96, 8 bp 인덱스를 포함하며 TruSeq 가닥 mRNA 및 TruSeq 가닥 총 RNA 라이브러리 준비 키트와 호환됩니다. 버전 2는 플레이트 20022371의 192개 인덱스 올리고(oligo) 중 8개에 대한 개선 사항을 포함하고 있으며, 나머지 184개에는 변경사항이 없습니다. 라이브러리 준비 및 프로브 패널을 별도로 구입하세요.

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액세서리 제품 (1)

Illumina Ribo-Zero plus rRNA Depletion Kit (96 Samples)

20037135

인간, 마우스, 랫트, 세균의 리보솜 RNA 고갈 및 96개 검체에 대한 글로빈 전사물에 대한 Ribo-Zero Plus 고갈 모듈을 포함한다. 정제 비드, 라이브러리 준비 시약 및 색인 어댑터를 별도로 구입하십시오. 라이브러리 준비 시약을 포함한 전체 키트의 경우 Ribo-Zero Plus 키트가 포함된 Illumina Stranded Total RNA를 주문하십시오.

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서비스 (1)

TruSeq Total RNA Training

15044069

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선택 품목 요약

제품

수량

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NovaSeq X 시리즈 주문

발전된 화학 반응, 광학 및 인포매틱스가 결합되어 뛰어난 속도와 데이터 품질, 뛰어난 처리량과 확장성을 제공합니다.

MiSeq Reagent Kit v3

클러스터 밀도와 판독 길이를 높여 이전 버전에 비해 시퀀싱 품질 점수를 개선하는 최적화된 시약 키트입니다.

TruSight Oncology 500

FFPE 조직의 모든 주요 변이 계열과 유전자 시그니처(TMB, MSI, HRD)를 포함하는 대형 범암 패널로 CGP를 활성화합니다.

Illumina DNA Prep

광범위한 시퀀싱 애플리케이션에 사용하기 위한 매우 정확한 데이터를 생성하는 효율적이고 빠른 통합 라이브러리 프렙 워크플로우입니다.

제한적 사용 라벨 라이선스: 본 제품 및 그 사용은 Max Planck Gesellschaft가 소유하고 New England Biolabs, Inc.에 독점적으로 라이선스를 허여하고 Illumina, Inc.에 2차 라이선스를 허여한 하나 이상의 발행 및/또는 계류 중인 미국 및 외국 특허 출원의 대상입니다. Illumina, Inc., 그 계열사 또는 공인 리셀러 및 유통업체로부터 본 제품을 구매하는 것은 구매자에게 구매자가 구매한 제품 수량 및 제품 구성 요소를 사용할 수 있는 양도 불가능한 권리를 양도합니다(구매자가 학술 또는 영리 단체인지 여부와 무관). 이 제품의 구매는 상기 특허 또는 제품 생산에 직접 적용되는 특허 출원의 청구범위에 따른 라이선스를 전달하지 않습니다. 구매자는 본 제품 또는 그 구성 요소를 제3자에게 판매 또는 양도하거나 다음과 같은 상업적 목적으로 제품을 사용할 수 없습니다. (I) 제품 또는 그 구성요소를 제조에 사용하는 행위, 또는 (2) 인간 또는 동물에서 치료 또는 예방 목적으로 제품 또는 그 구성요소를 사용하는 행위.

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